在随后的几天中，英军在海上和陆上的战斗大为失利。5月23日，前往亚历山大的两艘驱逐舰被敌机炸沉。26日，在攻击卡尔帕托斯岛上的机场时，“可畏”号航空母舰和另一艘驱逐舰遭受重创。在陆上，德军在向苏达湾突破，那里的英国守军开始越过山地向南部海岸的斯法基亚撤退。那天深夜，英军决定撤离克里特岛。次日晨，“巴勒姆”号战列舰在掩护轻型兵力撤离苏达湾时被击伤。
和从希腊撤退时一样，克里特岛的撤退不得不在夜间进行。5月28日，遵照坎宁安“坚持到底，决不能撇下陆军不管”的指示，3艘巡洋舰和6艘驱逐舰从亚历山大驶向伊拉克利翁地区。这时，舰员们已疲惫不堪。英国的一艘巡洋舰在向目的地接近时被敌人击中，不得不退出战斗，其他舰只在那天晚上共搭载了4000名部队。返航途中，一艘受伤的驱逐舰由于其舵机失控，只好被废弃。此外，敌机还炸沉英国的一艘驱逐舰，炸伤一艘驱逐舰和两艘巡洋舰。有一枚炸弹在“奥赖恩”号巡洋舰上挤满人群的舰员餐室中爆炸了，炸死、炸伤所载部队540人。整个部队中，伤亡和被俘共计800人。
从克里特岛南岸的斯法基亚撤退的部队，损伤自然小一些。5月29日夜，4艘巡洋舰、1艘快速运输舰和3艘驱逐舰搭载了7000名部队离开了该岛，只有1艘巡洋舰受到损伤。与此同时，雷西姆农地区的英军向敌人投了降。第二天晚上，又有4000名部队从斯法基亚撤退，这次英国仍然只损失了1艘巡洋舰。
在这次撤退中，英国皇家海军从克里特岛挽救了17000名部队，但也付出了相当大的代价，3艘巡洋舰和6艘驱逐舰被击沉，另有1艘航空母舰、3艘战列舰、6艘巡洋舰和7艘驱逐舰被击伤，伤亡人数达2000多人。虽然英军一共伤亡了13000人，但由于他们的顽强抵抗，德国损失了400架飞机以及15000至20000名部队，其中包括德国唯一的空降师的5000名官兵。英国在克里特岛所进行的抵抗实际上挽救了马耳他，因为经过克里特岛的战斗，德国已没有空降部队可以参战了。
然而，在克里特岛战役之后，英国的地中海舰队的形势并不令人乐观。尽管在5月初一支由1艘战列舰、2艘巡洋舰和6艘新型驱逐舰组成的增援部队抵达地中海，可是，在6月初，英国地中海舰队只有2艘战列舰、3艘巡洋舰和17艘驱逐舰可用以作战。从亚历山大至马耳他的英国补给线的北侧受到了克里特岛上的德国空军的威胁。马耳他因补给不足，力量不断削弱，而轴心国通往北非的补给线却更加安全。
在中东地区，英国驻埃及的陆军部队的东翼和海军的油料补给也受到了威胁，4月初，亲轴心国的拉希德·阿里夺得了伊拉克政府的大权。18日，英国海军部队在驻印度的海军司令的率领下支援了在巴士拉的登陆，从而使拉希德·阿里很快逃往伊朗。根据双方达成的一项协定，英国和苏联的部队于8月开进伊朗，以防德军攻占这个国家。
在叙利亚，德国间谍在亲维希法国的殖民政府反英情绪的鼓动下活动猖獗。法国在叙利亚有一支小型舰队，它包括2艘超级驱逐舰、3艘潜艇、1艘小型护航舰和1艘巡逻艇，其中驱逐舰上装备有5门5.5英寸(140毫米)口径火炮，航速可达40节。为了对付法国这支小型舰队，英国地中海舰队派出2艘巡洋舰和4艘驱逐舰前往巴勒斯坦的海法。6月初。一艘快速武装运输舰在另一艘巡洋舰和两艘驱逐舰的支援下将英军运往叙利亚登陆；与此同时，其他英国和自由法国的部队则从巴勒斯坦向叙利亚前进。三天之后，双方签署了一项停战协定。但是，在海上战斗结束之前，法国的一艘超级驱逐舰重创了一艘英国驱逐舰，此外，法国的飞机重创了其他两艘英国驱逐舰，在另外两艘巡洋舰的增援下，英国军舰和飞机击沉一艘前往叙利亚为法国运送武器的超级驱逐舰，击伤两艘在叙利亚的驱逐舰。除此之外，他们还击沉一艘潜艇和两艘商船。
隆美尔发起进攻
正当英国妄图挽救希腊和克里特时，埃及边境上隐约出现了一场灾难。早在1941年3月，德国非洲军就已到达利比亚，但隆美尔首先关心的是如何阻止韦维尔对的黎波里的进攻。隆美尔本人于2月份到达利比亚，他到达后就致力于加强意大利的防御。他组织了一批小型近海船只，以的黎波里为基地向锡尔特港，后来又向锡尔特港以东250海里的阿里角运送补给品。由于意大利人没有沿利比亚海岸铺设铁路，他必须从海上进行补给。德国陆军总司令瓦尔特·冯·布劳希奇元帅通知隆美尔，德军必将在北非发动进攻，而且他不可能指望得到增援。然而，隆美尔感到德军要固守住沙漠中有限的几个目标是不可能的。如果他执行陆军总司令的指令，即便他夺取了班加西，也不可能守住它。为了获取一个阵地来保卫他的翼侧，他必须占领整个昔兰尼加地区。
虽然隆美尔曾下命令在5月底以前不准备发动一次即便是有限的进攻，但他担心延迟行动可能会使英军有机会加强阿盖拉-比尔·苏伊发防线。于是，隆美尔于4月2日发动了进攻。由于韦维尔已将其部分部队派往希腊，并被迫将驻利比亚最有战斗经验的部队换成了刚从本土调来的未经实战锻炼的部队，因而他抵挡不住德军周密组织的进攻，不得不下令部队后撤到班加西，而且必要时还将进一步后撤。
德军在发动进攻的当天就夺取了阿杰达比亚。后来隆美尔又按到报告说，英军已撤出班加西。正在这个时候，非洲意军总司令格拉齐亚尼将军考虑到隆美尔的行动已超出罗马指示的范围，并且在补给困难的情况下不可能得到支援，因而他企图行使他的权力，阻止隆美尔的前进。而隆美尔不愿失去这个有利的时机。正当他们为此争执不下时，隆美尔接到了德军最高统帅部的一封电报，最高统帅部完全同意他自行采取行动。此后，非洲军迅速向前推进，第二天便夺取了班加西。他们径直穿过昔兰尼加的凸出部，于4月8日抵达德尔纳，并夺取了该城，俘获了800名英军。
接着，隆美尔的部队继续向托卜鲁克挺进。当时英国的沿海舰艇中队正从海上向这个地区加紧运送增援部队。隆美尔对托卜鲁克发动的数次攻击均未获得成功，其原因除了英军的顽强抵抗之外，还由于他使用了没有战斗经验的意大利部队，以及德国空军只顾对托卜鲁克实施战略轰炸，而忽略了空中战术支援。于是，隆美尔决定绕过托卜鲁克，向位于埃及边境上的塞卢姆进攻。他希望在那里巩固德军的防线。到5月底，非洲军在塞卢姆-哈尔法亚-西迪俄马三角地区建立了一个坚固的阵地，企图在那里为进攻埃及积蓄补给品。
5月，一支代号为“老虎”的特别运输船队运载着238辆坦克抵达埃及。这是英国几个月来从直布罗陀首次成功地驶抵亚历山大的一支运输船队。有了这些坦克，韦维尔将军便可对隆美尔的阵地发起反攻。6月15日，英军在大量战斗飞机的掩护下实施反攻。这次反攻的代号为“战斧”作战。经过激烈的战斗，英军反攻失败。克劳德·奥金莱克将军取代了韦维尔将军，继任中东英军总司令的职务。此后，北非战线的形势稳定了数月之久，不论英方或者德方都没有足够的兵力发动一场进攻。由于托卜鲁克仍掌握在英军手中，隆美尔无法向马特鲁港的前哨阵地前进。在马特鲁有一个机场，如果隆美尔占领了该机场，他就能对亚历山大、开罗和苏伊士运河实施空袭。
1941年春、夏两季，英国的沿海舰艇中队在北非沿海担负着对被围困的托卜鲁克的物资补给任务。8月，沿海舰艇中队又承担了驻守托卜鲁克的19000名澳大利亚军队换防的运输任务，澳大利亚自治领政府打算用这支力量在本国抵御日本的威胁。因此，负担过重的沿海舰艇中队肩上的担子又进一步加重了。截至10月底，沿海舰艇中队完成了换防运输任务，同时还向托卜鲁克运送了8000吨物资。11月，奥金莱克终于发动了进攻，于12月10日为托卜鲁克解了围。两个星期后，英军抵达了班加西。在托卜鲁克被包围的242天中，沿海舰艇中队向这里运送了大约33000名部队、92门炮、72辆坦克和34000吨补给品；同时，还从这里运走34000名部队、7500名伤员和7000名俘虏。在整个这次支援行动中，沿海舰艇中队损失2艘驱逐舰、1艘布雷舰和24艘小型船只，另有6艘商船被击沉。此外，还有7艘驱逐舰、1艘武装运输舰、19艘小型船只和7艘商船被击伤。
补给战
1941年夏，北非的德、英双方都在加紧积蓄兵力。德国在巩固了他们在希腊、克里特和昔兰尼加的战果后，最大限度地动员了轴心国的海上运输力量向北非运送部队和补给品。为了阻止德国的战备物资源源不断地运给隆美尔，英国不得不依赖于马耳他。
马耳他约位于地中海的中心，它不仅作为舰船往返直布罗陀和亚历山大的一个中间停靠站，而且它正好横跨意大利至利比亚的通常航线。驻马耳他的战斗机和轰炸机迫使德、意运输船只不得不绕道航行，以避开英国飞机的空袭，从而极大地削弱了德、意向北非进行运输的能力。马耳他，作为英国舰队的一个基地，能够威胁意大利和德国的运输船队，迫使意大利舰队投入大量的护航兵力，而且不得不在缺乏空中掩护的情况下作战。当马耳他岛上的力量强大时，前往北非的轴心国的运输船只有将近五分之二被击沉到海底；当该岛上的力量薄弱时，轴心国有95%以上的运输船只安全地驶抵目的地。图11说明了马耳他在地理上的重要位置。
为了确保对马耳他的补给，英国决定每个月派出一支有强大护航兵力的运输船队前往那里，由于考虑到德、意空军可能进行猛烈的空袭以及意大利舰队的威胁，英国不得不对护航运输队提供强有力的空中掩护。在通常情况下，两支运输船队分别从直布罗陀和亚历山大出发，同时通过地中海。H舰队将直布罗陀运输船队护送到西西里海峡，而地中海舰队则将亚历山大运输船队一直护送至马耳他。尽管英国尽了一切努力，但由于敌人的猛烈空袭，运输船队经常不能顺利通过。
由于英国海军在希腊战役中损失严重，因而在1941年春末和整个夏天，它无法向马耳他派遣军舰。但是在其他几个方面，马耳他的形势有了很大的好转，这主要是因为在6月间德军将第10航空军从西西里调往希腊，以便将驻希腊的第4航空军的一半兵力抽调到俄国。同时，英国的潜艇和飞机不断地破坏轴心国通往北非的海上交通。在1940年的前半年中，轴心国向北非运送了大约2372000吨的物资，其中损失了近80000吨，损失率为3.4%，在后半年中只运送了1750000吨物资，但损失了将近400000吨，损失率为22.7%。
为了加强马耳他的进攻能力，1940年10月英国派出两艘巡洋舰和两艘驱逐舰组成K舰队进驻马耳他。11月8日夜，它们拦截了一支前往的黎波里的运输船队，该船队有7艘德国补给船，由2艘意大利巡洋舰和6艘驱逐舰担任护航。英国K舰队击沉了所有的7艘补给船和1艘护航的驱逐舰。第二天，英国潜艇又击沉了另一艘意大利驱逐舰。约两个星期后，K舰队的一艘巡洋舰和一艘驱逐舰发现了两艘油船和两艘护航的驱逐舰。结果油船被击沉，护航的舰只逃脱了。11月底，K舰队又增加了两艘巡洋舰和两艘驱逐舰，实力得到了加强。12月中旬，K舰队的4艘驱逐舰遇到2艘向的黎波里匆匆运送汽油的意大利巡洋舰。在英舰的打击下，这两艘意大利巡洋舰中弹起火。
1941年11月18日，英国第8集团军再次发起进攻，向班加西迅速挺进。由于轴心国的海上运输损失严重，部队得不到增援，隆美尔在出色地进行一次反击之后被迫撤退。他将部队一直撤到阿杰达比亚，等力量加强之后再继续进攻。
英国K舰队和其它驻马耳他部队的胜利以及德军在昔兰尼加的失利，使得德军最高统帅部重新考虑地中海的问题。尽管希特勒被他在俄国发动的战役弄得茫然不知所措，但其他将领，特别是雷德尔深知地中海在战略上的重要性。德国海军参谋部极力要求采取措施，以充分利用意大利舰队来保卫前往北非的运输船只。然而，1941年8月当希特勒着手解决这些问题时，他不顾雷德尔和邓尼茨的忠告，命令派遣潜艇前往地中海；而雷德尔和邓尼茨则希望在大西洋保持全力以赴的攻势。头两批潜艇先后于1941年9月和11月通过直布罗陀海峡，不久便突然出现在地中海。11月11日，U-81号潜艇击沉“皇家方舟”号航空母舰。12天后，U-331号潜艇又将“巴勒姆”号战列舰打发至海底，该艇在完成攻击后机动逃跑时失去了控制，安全下潜到820英尺1英尺＝0.3048米。的深度，这比它的设计深度还深490英尺。
接着，德国又采取了一些行动以加强地中海战场的力量。1月，希特勒派遣阿尔贝特·凯塞林元帅前往意大利任南方部队总司令。他命令凯塞林夺取并掌握西西里海峡的制海权与制空权。与此同时，希特勒还将第2航空军派往西西里。
为了将斗争坚持到底，意大利同意派遣重型军舰为一些重要运输船队护航，并企图进一步对英国港口实施攻击。1941年12月19日，意大利潜艇“希雷”号在亚历山大港发射了3条双人鱼雷(即一种带有可分离战斗部的袖珍潜艇)有些外文资料称“人操鱼雷”。，重创英国的“伊丽莎白女王”号和“勇士”号战列舰。约在同一时间，曾击沉“皇家方舟”号航空母舰的U-81号潜艇又击伤了英国的“马来亚”号战列舰，从而使英国地中海舰队无一艘能够作战的重型军舰。当时日本已经参战。由于日本飞机在几天之前击沉了“威尔士亲王”号和“反击”号战列舰，英国地中海舰队所损失的军舰也得不到补充。
更为糟糕的是，12月19日，K舰队的3艘巡洋舰和4艘驱逐舰在的黎波里附近海域闯入雷区，一艘驱逐舰和一艘巡洋舰被炸沉，另外两艘巡洋舰被炸伤。这场灾难的一个直接后果是，轴心国的一支大型运输船队安全地驶抵的黎波里。
由于轴心国采取了上述措施以及英军遭受到严重损失，轴心国在中地中海的海运情况有了很大的好转。因此，隆美尔又恢复了在北非的攻势，并在1942年的头两个月中夺回了昔兰尼加。与此同时，轴心国还加强了对马耳他的空袭。
尽管11月11日英国增援守岛的战斗机抵达了马耳他，可是12月份，敌人的空袭增加了一倍多，达到175次。在1942年的前4个月中，由于德国空军向西西里增派了大量飞机，德军每月对马耳他的空袭多达200至300次。3月底，一次可运载12架“喷火”式战斗机的英国“鹰”号航空母舰在进行维修。应丘吉尔的个人请求，罗斯福总统于4月初派遣美国“黄蜂”号航空母舰向马耳他运载飞机。该舰有很大的容量，大约可搭载60架“喷火”式战斗机。但是几天之内，这些飞机全部被摧毁。在那一个月中，德军向马耳他投下的炸弹多达6700吨。因此，英国不得不将那些尚能机动的水面舰艇撤离马耳他。英国潜艇凭借着油料与弹药继续活动，但5月初驻马耳他的最后一批潜艇也撤往亚历山大。5月9日，“黄蜂”号航空母舰再次向马耳他运去了60架“喷火”式战斗机，这些飞机在运抵后的当天和第二天便与敌机展开了一系列激烈的空战。在上述这些战斗结束时，凯塞林元帅认为他已完成了摧垮马耳他防御的任务。
1942年3月，马耳他濒于弹尽粮绝。在这种形势下，驻北非的所有英国部队全力以赴，试图保护一支运输船队顺利通过德军封锁。英国第8集团军对托卜鲁克附近的轴心国机场实施了牵制性的攻击。英国皇家空军攻击了昔兰尼加和克里特的机场，从利比亚和马耳他起飞的飞机执行了空中侦察和突击任务，此外，英国皇家空军还为运输船队提供了最大限度的空中掩护。3月20日夜和21日夜，英国皇家空军的飞机和海军航空兵的一个中队轰炸了利比亚的德尔纳港。地中海舰队因力量受到削弱，只能派遣3艘巡洋舰和10艘驱逐舰担任掩护，派出1艘防空巡洋舰和6艘驱逐舰为这支由4艘船只组成的运输船队护航。另外，还派出6艘驱逐舰沿着北非海岸进行反潜巡逻。航行中，1艘驱逐舰被击沉，其余5艘驱逐舰与来自马耳他的1艘巡洋舰和1艘驱逐舰一同加强了掩护兵力群。
3月22日上午，运输船队多次遭到敌人的空袭，但无任何损失。下午，亚基诺海军上将率领的一支意大利舰队(由“利托里奥”号战列舰、3艘巡洋舰和4艘驱逐舰组成)在锡尔特北部拦截了英国舰队。英国舰队采用灵活机动的战术，利用烟幕作掩护，并以驱逐舰攻击相要挟，成功地活动在运输船队和意大利舰队之间，坚持与敌人周旋到日落。意大利舰队为了避免夜战又一次撤走。运输船队中有两艘船只安全抵达马耳他。但这只不过是一次有名无实的胜利，因为随后敌机对港口进行了猛烈的空袭，炸沉了另外两艘锚泊的补给船，船上的26000吨货物仅卸下了5000吨。
6月，马耳他守军面临着饥饿，英国海军部再次竭尽全力，分别从亚历山大和直布罗陀派出两支运输船队。第一支运输船队有11艘船只，由7艘巡洋舰、26艘驱逐舰和数艘小型舰艇护航，还有1艘老式没有武装的战列舰“百人队长”号冒充主力舰以欺骗对方。此外，9艘潜艇在运输船队航线的北侧进入阵位，准备在意大利舰队一旦出航就对它实施拦截。运输船队在航行时，英国还出动了航空兵进行最大限度的空中掩护。
意大利舰队不顾英国飞机与潜艇的攻击，照常来袭。结果一艘巡洋舰被英国潜艇击沉，“利托里奥”号战列舰也被英机发射的鱼雷击伤。尽管意大利舰队始终没有接触到英国舰队，但英舰在对付敌人的空袭时耗尽了弹药，维安将军不得不命令运输船队返回亚历山大。
从直布罗陀向东航行的运输船队比较走运。当它驶至撒丁海峡时遭到意方的猛烈空袭，接着又在西西里海峡遭到一支意大利驱逐舰部队。经过一场激烈的战斗，运输船队的6艘船中有2艘突破了敌人封锁，安全驶抵目的地，从而使马耳他的补给问题暂时得到了缓和。
轴心国计划夺取马耳他
1942年春，德、意双方领导人一致认为，为了在北非向前推进到苏伊士和夺取伊朗油田，他们必须首先摧垮或夺取马耳他，因为驻守马耳他的英军仍然严重威胁着轴心国的海上运输。于是，希特勒和墨索里尼于4月底在贝希特斯加登会晤，双方同意在隆美尔的北非进攻开始后于7月向马耳他发动攻击。隆美尔在推进到埃及边境时将停止前进，以便将德国空军的飞机用于马耳他作战。计划规定，主攻部队将由新训练的德国空降部队担任，并由意大利海军及舰载的部队进行支援。但希特勒并非全力支持这一作战方案，因而总是托词回避。他希望隆美尔能够夺取托卜鲁克，这样，轴心国则可利用托卜鲁克作为那些经过克里特岛的舰船的一个补给港，从而可以避免驻马耳他的飞机的袭击。
5月26日，隆美尔再次发起进攻。德军于6月19日到达托卜鲁克，并于翌日突破英军的环形防御。6月21日，托卜鲁克失陷。为此，希特勒提升隆美尔为陆军元帅。隆美尔说，“我宁愿他多给我一个师的兵力。”德军在夺取托卜鲁克时缴获了大量的补给品。由于这意外的收获，以及托卜鲁克港已掌握在手，隆美尔请求希特勒允许他借此势头向埃及推进。希特勒认为这正是借口放弃进攻马耳他的好机会，于是，给墨索里尼写了一封信。在信中他以热烈的言辞描绘了进攻埃及的大好时机，并要求墨索里尼同意隆美尔夺取苏伊士。墨索里尼只好默许。不久，轴心国便决定将马耳他作战推迟到9月进行，后来又自行取消。
隆美尔奋力向埃及进攻，夺取了马特鲁港和那里的一个重要空军基地。后来，一件意外的事件发生了。希特勒将原计划增援非洲的部队调往俄国前线。隆美尔所申请的7月份的60000吨补给品，只运去了3000吨。他只有靠缴获英国的物资使部队继续前进。有时，他的运输工具中85%是缴获来的英军车辆。因此，他不得不在距亚历山大只有60英里的阿拉曼停止了前进。
地中海战争的转折点
英国与轴心国之间再次展开了一场补给战。轴心国向北非运一次物资为时只需3天；而英国的海上运输却不得不绕道好望角，每次航行需3个月。隆美尔所需要的主要是食品、燃油和轻型车辆，而英国则急需坦克。托卜鲁克失守时，美国送给英国300辆崭新的“谢尔曼”式坦克和100门105毫米自行火炮。
自从日本参战并在印度洋发动攻势以来，英国一直担心轴心国会在马达加斯加的迪耶果-苏瓦雷斯兴建基地。因为从这个基地，德国或日本的海、空军不仅可以威胁印度，而且还可以打击驶往埃及的英国运输船队。马达加斯加属于法国马达加斯加于1896年沦为法国殖民地。，但英国对维希政府不大相信，尤其在获悉达尔朗海军上将于年初访问了德国，以及在维希政府将法属印度支那转让给日本之后，英国对维希政府更是失去了信任。显然，维希政府希望同胜利的一方为伍，他仍然相信轴心国最终会取得胜利。因此，英国制订了夺取马达加斯加的“铁甲舰”作战计划。
执行“铁甲舰”作战计划的舰艇包括“光辉”号和“无敌”号2艘航空母舰、“拉米伊”号战列舰、2艘巡洋舰、11艘驱逐舰，以及一些小艇，15艘运输舰和突击舰船，其中重型舰只均来目H舰队。驻直布罗陀的H舰队则由本土舰队派出的舰只来补充，而本土舰队则由美国向斯卡帕湾临时派出一些重型军舰加强之。
1942年5月5日4时30分，英军开始进攻迭戈苏瓦雷斯。进攻开始并不顺利，后来50名陆战队员从翼侧发起攻击，挫败了守军的锐气。经过数小时的战斗，迪耶果-苏瓦雷斯便落于英军手中。几个星期之后，英军又拿下了马任加和塔那那利佛。维希政府的官员们被取代之后，岛上的居民普遍支持盟军。
随着好望角航线的危险已被消除，英国对中东的增援迅速地得到了加强。在埃及，英国大约有630000部队。丘吉尔急欲对沙漠发动一次进攻。在托卜鲁克失陷后不久，丘吉尔便决定去开罗亲自查实奥金莱克将军延误对隆美尔预定的进攻的原因。他了解到，奥金莱克由于过分重视了他在整个中东地区的责任，因而看不到北非的极端重要性。经过多次讨论，丘吉尔决定将中东司令部一分为二，免去奥金莱克的职务，任命哈罗德·亚历山大将军为新建立的近东司令部司令，B·L·蒙哥马利将军为第8集团军司令。8月13日，蒙哥马利接任后，立即开始整训部队，以迎击德军即将对阿拉曼的进攻，并准备最后进行大反攻。蒙哥马利的计划不仅仅是象以往的进攻那样把德军赶回到他们的补给线上，而且还准备消灭他们的有生力量，从而使他们不能对抗英、美即将开始的非洲登陆。
与此同时，英国继续加强马耳他的空军兵力。马耳他岛上能够参战的飞机从5月份的23架增加到9月份的169架。尤为重要的是，调往马耳他的新型鱼雷机具有更大的作战半径。1939年，驻马耳他的鱼雷机的有效作战半径只有100海里，1942年已达到400海里。因此，轴心国的运输船只即使采取最迂迴的航线也难以逃脱英国飞机的攻击。甚至连巴尔迪亚、托卜鲁克和马特鲁港内的舰船也遭到猛烈攻击。轴心国的沿海运输船只也受到巨大损失。隆美尔试图为9月以前的继续进攻积蓄补给品，但他所得到的补给品只能勉强满足他的步兵部队日常的消费量，还达不到其装甲部队需要量的一半。隆美尔只有靠缴获英国的补给品来缓和这种局面。
隆美尔深知，如果他要突破阿拉曼，他就必须在9月英国大批增援部队抵达前发起进攻。意大利最高司令部答应从海上为德军运送大量的油料，凯塞林也同意在进攻期间每天向隆美尔空运500加仑1加仑＝4.5461升。的汽油。隆美尔在得到他们的这些承诺后，断然采取了冒险行动，于1942年8月30日夜对阿拉姆海尔发山脊发起了进攻，试图从翼侧包围阿拉曼守军。蒙哥马利坚守阵地拒不后退，任凭隆美尔进攻他那坚固的防御阵地；与此同时，英国皇家空军则对德军的装甲部队实施了惩罚性的打击。隆美尔在进攻期间，意大利最高司令部和凯塞林所许诺的燃油和汽油均未运到，于是，隆美尔于9月2日放弃了进攻。
隆美尔写道，“由于这次进攻的失败，我们失去了夺取苏伊士运河的最后一个机会。现在我们可以预料，英国工业的全力生产，特别是美国工业的巨大潜力最终将使形势的发展对我们不利。”
9月3日隆美尔撤退，蒙哥马利没有立即追击。由于向东方的补给线有了保障，蒙哥马利便继续积蓄力量，准备发动一场大规模进攻。1942年10月23日，英军在阿拉曼发起进攻。经过11天的激烈战斗，第8集团军终于突破了德军防线，向西推进。11月13日，英军收复了托卜鲁克；11月24日，收复了班加西。12月15日，第8集团军到达了阿盖拉，隆美尔向突尼斯方向撤退。在北非遥远的西部，已在摩洛哥和阿尔及利亚登陆的英、美部队正在隆美尔的后方向前推进。地中海的战局发生了最后一次转变。
