1927年8月龙潭战役时，胡宗南升任第1军第1师副师长。战后蒋介石被迫下野，胡宗南与国民革命军总司令部参谋长朱绍良一起，联系时任初级军官的楼景樾、李延年、关麟徵、李默庵、丁炳权、李树森、陈武、王敬久、黄杰等黄埔同学，极力抵制李宗仁为首的桂系，坚决拥护蒋介石东山再起，蒋介石最终得以复出，黄埔生从此受到蒋的重视。作为回报，蒋介石先后晋升胡宗南为第1军第22师师长，楼景樾任代理第2师师长（楼是浙江诸暨人，1931年任警卫第1师师长，副师长是俞济时，楼如果不是身弱多病，前途不可限量），李延年任第2师副师长，王世和（蒋介石的表弟，首任侍卫长）任陆海空军总司令部侍卫总队总队长。一批“黄埔系”出身的旅长、团长也先后新鲜出炉。
抗战期间，黄埔军校教育长陈继承、政治部主任邓文仪在军校举办的运动会上。1932年底，在蒋介石的授意下，国民党特务组织复兴社正式成立，胡宗南、贺衷寒、酆悌、滕杰、桂永清、康泽、郑介民、彭孟缉、曾扩情、潘佑强、周复、戴笠、邓文仪、袁守谦成为组织骨干，号称“复兴十三太保”，主掌政治工作并控制国民党的政训系统。其中滕杰（黄埔第4期）是第一任书记长，起步很高，可是后期表现平平。贺衷寒是复兴社发起人，第二任书记长，后长期担任政训工作，是国民党军政治工作的旗手，官位至国民党中央执委常委。邓文仪以写拍蒋介石马屁的文章得到晋升，官至战区政治部主任、国防部新闻局长。此3人去台湾后均未受重用。酆悌是第三任书记，抗战时长沙大火，蒋介石丢卒保车，被判死刑。康泽是第五任书记长，官至军委会政治部第二厅厅长、第15绥靖区司令，后被俘，1963年第四批特赦。曾扩情在任成都城防司令部政治部主任时被俘，1959年因其曾在西安事变时主张蒋介石抗日，有功而得以首批特赦。
桂永清和彭孟缉较早离开了政训系统。桂永清抗战胜利后进入海军，出任副总司令，不久升任海军总司令，以加强中央对海军的掌控。1949年指挥战舰27艘和其他船只计15万吨安全撤至台湾有功，此后桂氏的经历极富戏剧性，1951年晋升二级上将，正春风得意时，却因与时任台湾省主席的吴国桢有隙，被迫转任总统府参军长，等到吴国桢叛蒋离台后，升任参谋总长并晋一级上将，成为黄埔生首位一级上将，不幸的是这位第一个爬上峰巅的黄埔生上任仅45天，就病魔缠身，死于任上。彭孟缉的“拜将”经历也比较曲折，1947年由桂永清推荐任台湾警备司令，自此发迹，在桂永清死后继任参谋总长，本应同时晋升一级上将，却因为彭氏资历浅显（黄埔第5期），又去当了两年的陆军总司令，1959年再次出任参谋总长后才最终晋升一级上将。
在复兴社内设特务处，蒋介石最初是想让康泽当处长，因康泽推辞，小字辈戴笠这才脱颖而出。戴笠是浙江江山人，黄埔第6期毕业，他最终把小小的特务处破茧成蝶，经营成了国民党的两大特情机构之一的军事委员会调查统计局，即“军统”。1938年戴笠升任中将副局长（职务军衔）代行局长职责，在全国各地遍设站点，暗杀之事四起，政府官员、军事将领人人自危。同时因只对蒋介石一人负责，军统也成为一个独立王国，部下的封赏全由戴笠自己决定，所封少将待遇比正式的中将还高，却没人敢过问。但他因资历太浅，加上与陈诚不合，戴笠直到1945年2月20日才由铨叙厅授予陆军少将的正式军衔。
1935年初，国民党军队为了统一军衔，正式军衔均由铨叙厅统一铨叙。3月27日，国民党中政会决议，4月初公布首批授予中将的89人，其中以师长晋升的有29人，黄埔生只有3人，皆为4月9日第5组铨叙，他们是：“剿匪”第2路第2纵队指挥官兼第1军第1师师长胡宗南，驻闽第4绥靖区司令官兼第2军第9师师长李延年，驻闽绥靖第2区司令官兼第14军第10师师长李默庵，李是第一个声明退出中共的黄埔生，终于得到蒋介石的信任。渐露头角的俞济时，于1936年1月28日补叙中将，搭上了黄埔生“拜将”集团第一梯队的“末班车”。
