秀吉快速撤退（六月六日以降）
六月六日
早就迫不及待回安艺的毛利军开始撤退。秀吉在确认了毛利的确是在撤退后，自己也立刻回到了备前宇喜多秀家的居城－－冈山城。毛利自顾自地退走了，完全顾不上观察秀吉这边的动静。
这天夕刻，秀吉的部队从高松出发，经备前的沼，向姬路撤退。但是秀吉回家的路并不好走，先前的暴风雨使河川泛滥，把沼周围变成了名符其实的沼，一片水乡泽国。秀吉仍然驱使士兵们强行军，在这天剩下的时间里行进了超过二十公里的路程。在沼进行了必要的休息后，七日早晨，部队再次开拔。秀吉本人在这一天里行进了八十公里以上的路程，在当日夜间到达姬路。不过他的部队因为艰苦的行军而又些行动脱节。秀吉入城时还有不少部队落在很远的后边。
直到六日晚间，消息不灵的毛利才收到本能寺之变的消息。毛利马上为要不要追击秀吉展开了激烈的争吵。毛利将领们都嚷嚷着要向秀吉讨还血债。但是最后在重臣小早川隆景的极力坚持下，毛利放弃了追击的机会，按照协议和原定计划向安艺撤退了。
六月七日、六月八日
掉队的士兵陆陆续续赶到了，秀吉让士兵们抓紧时间休息，本人则在考虑下一步的行动。谋士黑田孝高向秀吉进言：如今是绝好的机会，讨灭明智将大义抓在手里，这是取得天下的第一步。听了这话，秀吉微微一笑，在秀吉心中已经早有这样的打算了吧。接着秀吉命令将城中的金银米粮尽数取出分赏将士。士兵们欢声雷动。秀吉也借此表示了自己绝不在姬路坐守待毙，而要与光秀决一死战的决心。
六月九日
秀吉率领一万数千人马由姬路出击，途中派兵占领了淡路的洲本，当天秀吉军主力到达兵库。同日光秀军在洛南的下鸟羽展开，摆开了与秀吉决战的架势。
秀吉到达战场 （六月十一日以降）
六月十一日
六月十一日黎明时分，秀吉到达摄津的尼崎。在这里他汇合了前来参加讨伐行动的织田信孝、丹羽长秀、池田恒兴等人。这时秀吉军的组成大约是这样的：本队一万五千，加上池田恒兴、中川清秀、高山重友、蜂屋赖隆等人的部队，总数在三万五千人上下。
秀吉六日从高松出发，包括在姬路休整的两天在内。只花费了六天时间就从中国的前线来到京都与明智光秀对阵。这在交通不发达，大多数时候靠两条腿的日本古代是了不起的壮举，所以这次神速的行动被后人称为“中国大返回”。
六月十二日
秀吉在摄津富田召开作战会议，在会议上作出了沿着西国街道，从淀川的西岸前出至山崎布阵，准备决战的决定。全军在天王山分成三部：池田恒兴、加藤光泰、中村一氏等人沿淀川进军；一部由高山重友、中川清秀为先锋，堀秀政断后，沿着西国街道前进；另外黑田孝高以及羽柴秀长率领一队人马从天王山麓迂回，准备由明智军的西侧发动进攻。丹羽长秀、织田信孝等人则与秀吉、秀胜一起在后压阵。羽柴秀胜就是信长的四子，过继给秀吉做养子的。正是有秀胜在军中，使得秀吉高喊“报仇”口号时的底气又足了几分。些是秀吉军的部署。
其实这场战斗在有的文献里叫做山崎之战，有的叫做天王山之战。个人认为山崎之战的说法没有天王山之战来得实在。因为这场战斗后来决定在天王山的控制上，而天王山麓的山崎早已为秀吉牢牢控制了。
同时，明智军已然留在下鸟羽的阵地。因为明智光秀认为秀吉会沿着下鸟羽街道直接进攻京都，所以特地在此截断秀吉的进军路线。但是现在秀吉是沿着西国街道而来，使得光秀的如意算盘落了空。光秀只好拔营前进，渡过桂川迎向秀吉军。这样一来光秀非但不能以逸待劳，反而被迫强行军，敌前渡河，白白浪费了宝贵的战力。这也成了之后明智军败走的原因之一。
这天黄昏时分，双方先遣队中的小股铁炮队发生接触战，两军用铁炮相互射击。战斗一直持续到天完全黑下来为止。
两军激战 六月十三日
六月十三日是个雨天。
正午，织田信孝、丹羽长秀再次来到富田的秀吉军营，商讨具体的作战事宜。午后，由下鸟羽来的光秀军强渡桂川，到达胜龙寺城。这时，光秀邀请与自己同级别的大名参战的希望彻底破灭了。光秀手中的军力只有自己的直属部队、以及丹波众、旧室町幕府众等一万五千人。与三万五千人的秀吉军相比处於绝对的劣势。
黄昏，明智方已经登上天王山的并河扫部、松田太郎卫门、波波伯部权头等人并力进攻天王山下的中川清秀部队，企图利用居高临下的地利从侧翼冲散中川军的队形，战斗的帷幕正式拉开。同时伊势贞兴，沟尾庄兵卫等人也率队配合从正面进攻。由于中川左右两翼有加藤、池田等人的掩护，所以果断地展开对攻，正面突破了当面的明智军。战局明显对人数少的明智军不利。明智军中央以及左翼的斋藤利三、柴田源左卫门等人的防御作战也遭遇了挫折。他们被人数占优的秀吉军包围，受到夹击。虽然士兵们的抵抗很顽强，但还是一个一个地倒下去。失败已是不可避免的了。至於天王山上，并河扫部等人的进攻受阻，从自己的背后又杀来了羽柴秀长、黑田孝高的大军。结果明智军偷鸡不成蚀把米，没有占到任何便宜就被赶下了山。全军的侧翼就暴露了出来。战斗只进行到夕刻，胜负就已经分出来了。
光秀向胜龙寺城退却，虽然口头上是宣称准备聚拢人马再战。但是在黑夜之中本阵大将的后退立刻被士兵们看作是全军溃败的标志。於是明智军一哄而散，纷纷败走。一部逃往丹波龟山，秀吉军中川、高山队紧紧追上去。在胜龙寺的光秀日子也不好过，秀吉包围了胜龙寺城，开始猛攻。仓促进城的光秀军还来不及喘口气，就发现自己周围满是敌人。结果是很容易想像的，胜龙寺是一座规模不大的平城，士兵们又来不及各就各位，组织防御，所以城池被轻易攻破了。明智光秀还算神通广大，居然又从城中杀出重围，渡河逃往伏见。光秀还在盘算着如果可以回到坂本，也许还有东山再起的机会。但是他的运气已经在刚才杀出胜龙寺城时用光了。从伏见的大龟谷出发没多久，就遇到了守候多时的农民。他们袭击了光秀的队伍，袭击者虽然被打退，光秀却受了重伤。
因为伤势严重，出血过多光秀已经不能骑马了。自己不能骑马，后面又有尾随而来的秀吉追兵。这样下去一定会被俘获的。被那只猴子的人抓住受到羞辱后杀死，不如就在这里痛痛快快地切腹吧。光秀满怀悲愤地拿起了切腹的刀子。为他介错的是沟尾胜兵卫。光秀享年五十五岁。
秀吉胜利之后 六月十四日以降
六月十四日
留守安土的明智秀满接到光秀战败的消息后于十三日夜放弃安土，返回坂本。大胜后的秀吉则在十三日晚间留在淀过夜。十四日一早，堀秀政就被派去进攻坂本。他同向坂本撤退的明智秀满在近江大津不期而遇。双方自然没什么好说的，马上大打出手。还是秀满急于赶回坂本，也没有恋战，主动撤离战场，好歹跑了回去。因此也没有同堀秀政多纠缠，部队损失也不大。
六月十五日
堀秀政当然也要完成任务，秀满一进城，他就尾随而至，包围了坂本。当天光秀的死讯到达坂本，绝望的秀满将躲藏在天守阁上的光秀妻子和自己的妻子刺死，用火药引燃了天守阁之后在熊熊烈焰中切腹自杀了。
六月十六日
秀吉在安土宣布为故主信长报仇的军事行动胜利完成。此时家康的部队已经到达尾张鸣海，听到这个消息怅然而回。
经过这一战，秀吉成为名至实归的霸主，将霸权牢牢地掌握在手里。接下来要解决的难题就是对其他手握重兵的信长部将，以及家康地位的处理了。秀吉的战斗还远未结束。
后记
光秀生存传说
光秀于天正10年(1582年)6月2日，在本能寺袭击了信长后，6月13日被羽柴(丰臣)秀吉在山崎击败，想逃往近江坂本城东山再起，不想在途中，在京都山科小栗栖，被一个农民中村长兵卫用竹枪刺成重伤后，自刎了。
以《太阁记》为首的几份资料都有详细的描写，‘光秀一行，在小栗栖的竹薮细道中行驶。突然，光秀侧腹被路旁刺出的竹枪所刺中，光秀切断竹枪后翻身落马。虽然暂时可以忍受痛苦，可是光秀知道自己已命不久矣，随即切腹。跑至跟前的沟尾庄兵卫为其切错。进士作左卫门、比田带刀二名家臣殉死。庄兵卫用鞍布裹住光秀的首级，消失在附近薮的沟中。第二天早晨，村民发现三具遗体，其中两具脸皮刮花，难以辨认。还有一具没有首级，但是凭他所穿戴的刻有桔梗纹的豪华铠甲，人们推断出那便是光秀。在附近探索过后，找到了光秀的首级，在进行‘整理’后送往秀吉处。6月15日，检验首级后，放置在本能寺里。’
在这段文字后，还有着两段很奇妙的描写，一个是‘送光秀首级的农民被秀吉杀了(秀吉认为其撒谎)。’还有一个是‘离天正十年大概六○年后的宽长年间，有人去小栗栖探听情况，但是在那里，竟然没有一个人知道中村长兵卫这个人。’。
《川角太阁记》的记载是，‘光秀主从三骑，在谷越地区，农民们挡住了去路，光秀被埋伏的人们用长枪刺下，在松树下死去。’
《言继卿记》记述的是，‘6月15日光秀在醍醐(京都市伏见区)附近被乡人抓住，首级送到了本能寺’。
六月十四日 删除 空白
六月十五日 惟任日向守被关在醍醐边监狱里，被乡人打死。首级献给了本能寺。
六月十六日 删除 空白
六月十七日 齐藤内藏助(齐藤利三)，此次计谋叛乱第一人也。关于坚田监狱，一度逃出，再次抓住后送往京都，在六条河原斩首。
《天正十年夏记》，也记着相同的事：‘六月十五日 明智被劝修寺院附近农民捕获。送其首级至本能寺。’
揭开薄雾，从各种现象可以推测出，6月15日光秀在醍醐附近(小栗栖)被抓住，首级被送往了本能寺，不过，检验首级后，发现与光秀本人样貌明显不同。因此，秀吉为了制造声势，就自己设定了在6月13日，光秀被小栗栖农民的竹枪所杀死的‘事实’。
光秀被刺‘死’的小栗栖，在本能寺兵变当时，是朝廷公家劝修寺晴丰的领地。之前讲过，很明显光秀和朝臣之间有着什么密谋。在晴丰的领地内光秀被杀死，此处也是令人感到怀疑的地方。
在这里，介绍一下关于岐阜县山县郡美山町中洞的光秀生存传说。‘在山崎之战中死去的是光秀的影武者荒木山城守行信，光秀改名为荒深小五郎(《兵家茶话》中译为荒泽又五郎)，隐藏在一个叫中洞的地方伺机再起。庆长5年，关原合战爆发，光秀作为家康方的一族郎党出阵，在岐阜县揖斐郡川合村骑马渡河时，连马一起被水冲走，溺死。(享年75岁)’《兵家茶话》《翁草》直到今天，在中洞古屋敷白山神社一角还有着光秀的墓，光秀的后裔都把名字刻于荒深后面，有着详细的家谱。
光秀的为人
如今，并没有任何一篇描写光秀是如何如何优秀的详细的资料。凡是描写光秀，都是把他写成一个城府极深，躲在信长和秀吉背后，伺机而立，是个彻底的恶人。有两件著名的逸话,不过，全都被后世的风流人士巧妙改造了。
其一，‘光秀还年轻的时候，在芥川捡了一个大黑天的木雕像。周围的人们说，‘这个东西拣得好啊。捡到大黑天的像象征你将来必定会统领一千人。说明你将来会出人头地啊’。 听到如此言语的光秀并没有像常人一样非常高兴， ‘什么叫出人头地,难道只是统领一千人吗？我要是现在想建功，想当上千人长简直易入反掌呀。可我想得到的并不只是那样。’ 说完，就把木雕像给了其他人。其二，光秀经常说，‘僧侣为了方便而吹嘘，武士为了武略而吹嘘，还是土民百姓讨人喜欢啊。’(《老人杂话》) 由于听者的观念不同，有人觉得他是在笑百姓很愚蠢；但是反过来看，这却是辱骂武士僧侣，喜爱百姓的言词。
路易斯在《日本史》写道，‘他(光秀)与主人(信长)有着互惠互利的关系。(中略)。他(光秀)喜欢叛变和密会，所定刑罚残酷，会伪装他的独裁，在战争中擅长谋略，忍耐力强，是计谋和阴谋的高手’。 好象这个记述，是在兵变后，在山崎之战光秀战死的一年后写的。路易斯亲自会过光秀，光秀的下克上，与基督教的伦理观相异，所以说，在路易斯眼中，光秀是十足的恶人。
坂本城明智一族被灭，明智的两个孩子虽然死了,但是，他们却是非常高雅的孩子，令人想到欧洲的王子一般，长子十三岁。所以，从孩子身上我们可以看出光秀对孩子的教育非常严厉。
天正2年(1574)，在进攻摄津的光秀给正在扑灭长岛一向一揆的信长写了一封报告战况的‘注进状’，7月29日信长的回信写了‘书中つぶさに候えば、见る心地に候’的文言，光秀则再次详细报告了进攻摄津的情况。
除此之外，仅有少数资料,还有表示明智一族人品的事迹。‘进入大和多闻城的光秀，命令奈良的大乘院寻宪交出寺宝、法性五郎的长太刀。光秀得到寺宝后，很快觉悟到自己的蛮横，立即归还了寺宝，并不奢望寺宝会归还的大乘院大吃一惊。’(《多闻院日记》)。 又，光秀的女婿明智秀满山崎战败后，明智一族在坂本城面临落城的那一刻，秀满道《天下至宝不该化成灰烟。》，将收藏的艺术品和目录交于秀吉后，切腹自杀了。 西教寺(大津市坂本)，为了吊唁元龟元年(1570)9月的坚田之战所战死的官兵18名，光秀亲自一个一个记录每个人的姓名，现今还留有捐赠大米的书信。丹波福知山还有称赞光秀善政的盆踊舞歌。
天海就是光秀？！
德川幕府时期，元禄年间(1688～1703)初开始，流传着德川幕府的‘智囊’，被称为‘黑衣的宰相’并侍奉德川三代的天台宗的天海大僧正就是明智光秀的传言。
这个传言的来源根据，有着以下几条。
一，德川幕府对于丰臣家赶尽杀绝，毫不留情。(方广寺钟铭事件、大阪冬之阵和平方案和内堀的填拓都是天海在背后提的主意。)
二，信长命令火攻腐败的天台宗的总寺院比叡山山延历寺，和光秀注入心血去复兴领土内的近江坂本城。[光秀的妻子熙子以及明智一族的坟幕都葬在天台真盛宗西教寺(滋贺县大津市坂本)。]
三，在比叡山饭室谷长寿院附近的不动堂的庭园上，有着刻上了‘布施许愿者 光秀 庆长二十年二月十七日’的石灯笼。
四，日光山轮王寺(现在的日光第2伊吕波)那华严的瀑布，此绝景地域名为‘明智平’。
五，天海死后，谥号为慈眼，慈眼(以慈悲的心看众生，有着菩萨的菩萨眼的意思)大师，在京都府，有着同样名号的慈眼寺(北桑田郡京北町周山)有着光秀的座像，座像表面刻着‘主一院殿前日州明叟玄智大居士神仪’，背面供奉有‘顺逆无二门大道彻心源五十五年梦觉来归一元’字样的光秀灵牌。
六，因为天海的关系，本能寺兵变的活跃者、在山崎战役后被斩首的光秀家家老齐藤利三的遗子於福(以后的春日局)，被重用。
七，家康后继者取了光秀和光秀父亲的名谓。
八，秩父神社(崎玉县秩父市:保藏着家康人像的日光东照宫，有一具身上刻有明智家家徽桔梗花纹的谜一样人物。
九，秩父札所三四所 ?有九番?明智寺、十三番?慈眼寺等名号的牌子。明智寺被称作慈眼寺坛下的明地正观音,研究后那应该是在天海时代被改名了。
十，现在还有作为僧侣的天海穿了铠甲的模样。
关于光秀改名为天海的可能性，可以以二人的年龄试着验证。
本能寺兵变发生在1582年6月2日。那时，信长是49岁。光秀的年龄并不清楚，《明智一族宫城家相传系图书》记载着光秀是享禄元年(1528年)八月十七日出生。
根据《阴德太平记》，信长午(马)岁出生，光秀子(鼠)岁出生。1528年正是子鼠年，光秀终年55岁。
《明智军记》(江户时代?作者不明)记述的光秀辞世词句：
逆顺二门无シ 大道心源二彻ス
五十五年ノ梦 覚メ来テ一元二帰ス
以此为证的话，本能寺兵变时光秀正是55岁，与《明智一族宫城家相传系图书》，《阴德太平记》相符。
但是，以防此词句乃他人所乱造，所以，不能认定这是光秀的确实年纪。
根据延宝九年(1681年)松平家越後高田藩的御家骚动，就是所说的‘越後骚动’，被冤枉而切腹的小栗美作(享年54岁)的辞世句：
五十余年ノ梦 覚メ来テ一元二帰ス
截箭弦ヲ离ルル时 清飨乾坤ヲ包ム
‘越後骚动’ 是《明智军记》编写之前发生的，所以《明智军记》的‘作者’不可能不知道这件事。而且，《明智战记》很大可能是在幕府的监督下进行的编写，从《明智战记》内容可以看出，‘作者’本人十分拥护光秀。小栗美作的‘无实’和光秀的‘无念’想近，为拥护光秀而编改美作的辞世句，来作为光秀的辞世句，这是非常有可能的事。而岐阜县美山町的光秀生存传说中，本能寺兵变当时，光秀其实57岁。不过，无论如何，光秀从兵变13日后的6月15日(《言继卿记》)后，从历史中消失了。天海是在1643年死去的事如果是史实的话，那光秀以天海之名而活着有61年，那如果是光秀改名的话，他活了有111岁，而相传，1643年时天海是108岁，两人年纪大致相符。
虽然如此，但对于生物学来说，在100岁以上的3岁之间差异极大，特别是医疗不像现代一样的发达。还有天海的年龄 并不能证实，如此，光秀在‘山崎之战后改名为天海'的推断基本上并没有史实资料可以证实。
其次，从桔梗花纹处考虑。从结论来看，光秀=桔梗花纹这个短路构思还需谨慎处理。因为，桔梗花纹也曾被武田家四名臣之一的山县昌景使用过，加藤清正也曾使用的。江户城西的丸下到三丸之间有个边门叫桔梗门(别名:内樱田门)。这个据说是太田道灌的家徽桔梗，与光秀没有关系。日光东照宫的武士的和服裙子上花纹，确实是桔梗花纹,不过，好象周围还有瓜纹。
再看比叡山延历寺和光秀复兴居城坂本。坂本城的城下町与延历寺有着密切的关系，延日历寺僧侣的生活物资都是由城下町购得，朝山的人们也都是住在延历寺的房舍，延日历寺对于坂本城来说好似厨房入口一般，所以，在延日历寺被烧之后，坂本城的城下町必定受到损失，光秀为之复兴，这与天台僧天海来说，好像并无挂钩。
关于德川二代将军秀忠及三代将军家光名字中‘光’和‘秀’的文字，二代将军的‘秀’字是从丰臣秀吉那得到的名，三代将军的‘家’则是从德川家康处继承的。四代将军家纲，五代将军纲吉，看似用了光秀父亲‘光纲’的纲字，但事实上，‘光’‘纲’等文字是当时的武将所喜好的名字。如果定要牵扯到光秀，虽然可行，却也是非常的勉强。
而‘明智平’是被天海所命名之事并不能被证实。再者，在旧日本地图也找不到‘明智平’的地名。关于比叡山的光秀刻的石灯笼，也没有证据证明是明智光秀亲自捐赠的。这样的话，先前介绍的传言的一个一个的都被否定了。
关于光秀的死还是个谜,不过，因为年龄关系，与天海应该是没有关系。不能否定的是，天海与明智一族直接有着某种关系。也有可能光秀的女婿明智秀满就是天海。顺便一提，平成12年8月5日，日本TBS电视《世界?惊奇发现》‘东照宫的谜-德川埋葬金传说的谜！’中播放了光秀和天海的笔迹鉴定结果。结论是，天海和光秀不是同一个人,不过，应该是兄弟、父子一般的近亲者。
光秀对于天正8年信长的‘天下布武’十分欣赏。当时，光秀和信长的价值观是相同的，主从关系融洽，都是以建设理想的日本社会为方向而全力以赴。以信长的意志为方针，光秀则在背后默默支持。信长的‘多数革命’，都是与光秀遇见以后发生的，而信长的各大战役，光秀也都几乎随军参与。光秀一直相信能与信长一起走进新时代，直到天正9年6月，可以从《明智军规》制定的时候，因为手中的权力与日俱增，信长的言行就逐渐表现出了对光秀的不信任。他的悲剧也是从此开始，如果他顺从信长，跟着信长一起走下去，他也许会有一个轻松的人生。但是，因为坚定的信念，包围了本能寺，逼死了信长。对于光秀自己，信长的死，使自己背上了恶名；对于织田家诸家，正是一个证明自我价值的机会；而对于整个日本，却使对战乱已经十分疲劳困扰的社会再次安定了下来，迎来了桃山文化这个文艺复兴。如果没有本能寺兵变，信长肯定会建立绝对君主制的日本国，朝鲜的悲剧，会更早更大规模的实行，如果那样，日本的现况就会大为不同。
非常遗憾的是，现在留有对光秀的描写，都是一些否定其为人的言语。譬如，在接待家康的时候，因为鱼的不新鲜而被信长责备；攻占八上城时，因为信长的违约，作为人质的亲生母亲被杀等；如此有趣可笑的‘史实’到现在还会被大河剧等选为历史剧情。史学家和小说家还把其设为历史剧情，编写出娱乐百姓的杜撰小说。光秀的魅力使后世的人们对他有着一层又一层的崭新看法，从他在历史舞台的出场，到他死去后，他所造成的影响和疑团，使人们对他的逸事的追求孜孜不倦；他的事迹，永远使人感到诧异；他拥有的知识与文化，又总使人感到惋惜......
