日军在林加延湾的“神风特攻”行动并没有能干扰美军的炮火准备和扫雷作业，它的行动也没能持续很久。就在美军登陆的前一天，亲手发动了疯狂的自杀性攻击的第1航空舰队司令官大西泷治郎悄悄飞离吕宋岛，临行前扬言要到台湾重新编组“特攻队”。可是，直到战役结束，留下的飞行员也没有看到大西泷治郎的身影，没有看到来自台湾的增援。相反，海、陆军航空兵能用来作战的飞机很快就在“肉弹攻击”行动中消耗殆尽。到1月9日，第30战斗飞行集团竟连一架飞机也没有了，第4飞行师也只剩下4架联络飞机。第二天，富永中将率领陆军第4航空军军部撤退到卡加延河谷的埃恰圭。那里虽然不缺少粮食供应，但既无空军机场，也无通信设备，对外指挥联络陷于瘫痪。几天后，富永不待山下奉文发布命令，就匆匆转移到台湾，把没有任何飞机可用的航空兵残部扔在吕宋岛上，结果被大本营解除了职务，编入预备役。13日上午，留在吕宋岛上的日军航空兵残部利用云层的掩护，以仅存的几十架飞机发动了一次成功的攻击，撞毁了一艘美国航空母舰“萨拉托加”号，以后天上就再也难得一见它们踪影了。
1月9日，天刚刚破晓，林加延海湾里的几百艘登陆艇冲向海滩。奇怪的是，他们几乎没有遇到什么抵抗。对付日军在滩头阵地上配置的零星兵力，只用那些正在淌水上岸的步兵就足够了，聚集在海湾的大批战列舰和巡洋舰几乎无用武之地，通常登陆前进行的长时间炮火准备也临时取消了。当天太阳落山时分，滩头阵地向纵深扩大了近5公里，5万多名美军和装备都陆续上了岸。在一些地段，部队几乎是跑步上岸的。
入夜，备受“神风”特攻机折磨的美军舰船开始施放烟幕，以躲避日机的空袭。但这一招儿对来自水面的攻击却不起作用。
在夜色中，不知从哪里钻出来70多艘日本摩托艇，轰鸣着掠过水面，朝舰队锚地直冲过来——这是日军的水上自杀性攻击敢死队！
同日本航空兵一样，日军水面舰艇部门也很早就开始谋划发动水上的“肉弹攻击”。1944年2月，日本海军中央部下令“试制人操鱼雷”，随后相继开发了代号为“铁器”的“船外挂式冲击艇”、“人操鱼雷”等特攻兵器，准备发动“自杀性攻击”。“船外挂式冲击艇”是在艇首部位装满炸药的高速艇，由敢死队员驾驶撞向对方战舰，与敌人同归于尽。1944年8月这种冲击艇正式定名为“震洋”艇，每月生产400艘。“人操鱼雷”是由人操纵的鱼雷，定名“回天”，由大型潜艇搭载，原准备用于奇袭敌前进基地，后来部署于陆上基地，担任沿海防御。为了使用这些特攻武器，日本海军于同年7月特意在吴港基地组建了第1特别基地部队，训练“特攻艇”和“人操鱼雷”的驾驶员。很快，几十艘特攻艇被派往菲律宾前线，用来对付即将开始的吕宋岛反登陆作战。
不过，眼前这支序列为“海上挺进第12战队”的队员们还没有资格驾驶“震洋”艇，他们驾驶的冲锋艇是自制的，艇身由胶合板制成，艇上装满了烈性炸药。头缠白布条的日本敢死队员冒着美国军舰的炮火，疯子似的驾驶着摩托艇向锚泊的美国军舰冲来。如果他们的攻击行为得逞，将给美国军舰带来巨大灾难。幸亏美军舰炮火力密集，绝大多数摩托艇在强大的火力下燃烧翻沉或被迫退走，只有几艘小艇把炸药送到美军舰船的舷侧。这次袭击给美军带来的损失是：1艘步兵登陆艇沉没，1艘运输船、1艘步兵登陆艇和4艘坦克登陆艇受伤。
同一天夜晚，哈尔西率领第3舰队通过巴林塘海峡，进入南中国海。他的目标是击毁尚在印度支那沿海活动的日本战列舰“伊势”号和“日向”号，彻底解除它们对吕宋登陆地域的威胁。两天后，他派出上百架飞机把印度支那沿岸梳头发似的梳了一遍，最终发现了日本舰船的集结地。舰载机的袭击取了重大成果，包括12艘油船和“香稚”号轻巡洋舰在内的44艘日舰和100余架日本飞机被摧毁，日本海军残部受到沉重打击。哈尔西在返航途中，还顺便发动了对台湾高雄、中国大陆沿海和香港日军目标的空袭，虽然受恶劣天气和日军防空炮火猛烈等因素影响，袭击的效果不太理想，但令敌人龟缩在阵地内不再敢轻举妄动的目的已经达到。1月17日，当哈尔西率舰队再次穿过巴林塘海峡，返回乌利西海军基地时，他听到东京电台向全世界广播说 ：“美第3舰队被困在南中国海，已成瓮中之鳖。”
