快到10：00的时候，北塔楼的一个灭火队已经爬上54层楼，至少有两个另外的灭火队抵达44层楼的观光大厅，许许多多救援班组位于5层楼和37层楼之间。
纽约市消防局在南塔楼和万豪大酒店的救援行动。在南塔楼大厅里，扩音器系统一测试完毕，消防局一名高级负责人和一名消防队长马上就开始了救援行动。几乎同时,一名紧急事务管理办公室的现场指挥官也加入进来。然而，却没有适当数量的消防队立即加入救援，因为在9：03时，这些消防队正在北塔楼或正在去北塔楼的路上，他们还没有被改派遣往南塔楼。
一名消防队长和一个云梯班发现了一个仍能使用的电梯，他们乘坐该电梯到了第40层楼，然后继续沿着楼梯井B向上爬。另一个云梯班不久就到了，他们开始救援困在一层和二层的电梯间的平民百姓。大厅里一名高级负责人说他在开始处理南塔楼的救援任务时遇到了缺乏人手的困难。
不像北塔楼的指挥官，南塔楼大厅里的高级负责人和爬到楼上的消防班长通过扩音器系统（7频道）保持着无线电通讯联系。在救援开始的15分钟里，他们和云梯班长之间的联络相当通畅。从一名公司安全官员那里知道被撞击区域在第78层以上后，一云梯班传达了这个消息，一名消防队长命令在第40层楼实施救援的灭火班想办法找一个电梯以到达78层以上的区域。
就我们所知，南塔楼以外的消防局官员没人认识到扩音器频道还能使用以及正在被南塔楼的救援人员使用。南塔楼大厅里的高级负责人开始时不能把要求更多救援人员的请求转达到北塔楼大厅或者室外指挥部的负责人。
从大约9：21开始，楼上的消防队长与南塔楼大厅里的指挥部联系不上了，原因是大厅里的负责人停止使用了扩音器7频道。进入到南塔楼的大多数救援队员不能通过扩音频道进行交流。
纽约市消防局当天发生的第一例伤亡事故大约是在9：30，当时一个人从大楼上掉了下来，一位在西大街和自由大街交叉口附近执勤的消防队员被砸死。
9：30以前，南塔楼的负责人仍然需要消防队员增援，有以下几个原因：第一，在9：03以前，只有两个已被派往北塔楼的救援单位来到了南塔楼；第二，直到纽约市消防局局长命令派遣救援队伍5分钟以后，救援队伍才被派出；第三，那些在8：53被命令驻扎在布鲁克林—巴特利隧道——这里距世贸中心建筑群非常近的救援单位在南塔楼被袭击后并没有被派往南塔楼；第四，驻扎在西大街北边的救援单位，在向南步行前进后停在了位于西大街的纽约市消防局总指挥部，在这里他们被告知等待进一步的命令；第五，一些救援单位直接去了北塔楼（实际上，无线电通讯显示，在有些情况下消防队员以为南塔楼是世贸中心1号楼，但事实上它是2号楼）；第六，一些救援单位找不到南塔楼所在位置；第七，试图从位于自由大街的南塔楼的主要入口进入大楼的救援单位遇到了从大楼上跳下来的人和落下的东西的干扰，这些单位不得不寻找进入大楼的间接入口，大部分人通过万豪大酒店进入了南塔楼，但是也有些人呆在西大街原地不动。
一名在室外总指挥部的负责人很想协助南塔楼大厅里的救援工作，事实上他的助手已经在大厅里工作了。但是由于他对世贸中心建筑群不熟悉，不知道如何到达那里，大约9：35他来到了万豪大酒店。在酒店里他碰到了大约14家救援单位，这些单位中的大部分一直在寻找到南塔楼的安全入口。他带领他们找到电梯，并在万豪大酒店的高楼层实施救援工作。4个单位在酒店最高层（22层）搜救平民百姓，但是没有找到。
这名负责人由于对万豪大酒店的搜救工作感到满意，决定继续领着一些救援单位寻找他认为是南塔楼的地方。事实上他把他们带到了北塔楼。从万豪大酒店进入北塔楼的3个救援队在大厅南头的银行里找到了一个能使用的电梯，他们坐着电梯到了第23层楼。
为解决南塔楼人手短缺的问题，9：37，西大街和自由大街指挥部的负责人又拉响了二次警报。同时，先前驻扎在布鲁克林—巴特利隧道的布鲁克林一边的救援队伍被派到南塔楼。一些单位已经越过隧道进而对万豪大酒店实施救援，但是没有对南塔楼实施救援。
在9：45~9：58之间，楼上的消防队长仍然在南塔楼的高层指导着救援工作。9：58，一个云梯班在70层楼遇到了许多严重受伤的平民百姓。在一名安全警卫的帮助下，9：53，消防人员发现一群困在78层楼观光大厅的电梯里的平民百姓。9：58，这些平民百姓被救出电梯。那以前，消防队长已经到达78层楼的楼梯井里，他说看起来通往79层楼的门是开着的，容易进入被撞击区域。他还说这里有大量的平民百姓伤亡。
在塔楼外纽约市消防局的指挥和控制工作总指挥部由局长、其他高级负责人、现场联络官、南塔楼被撞后赶来的许多救援单位、紧急事务管理办公室负责人和工作人员组成。
现场通讯系统的两个主要职能是在总指挥部和纽约市消防局调度处之间传递信息，以及在一个大的电磁板上收集所有在现场工作的单位的信息。由于9月11日这场大灾难规模太大，这两个职能都被严重削弱了。第一，传输信息的方法不成功，例如，纽约市消防局调度处告诉现场通讯系统（据911报警系统报告），有100人被困在北塔楼的105层楼，现场通讯系统把这消息报告给了楼外指挥部的负责人，但是这个消息没有被传递到北塔楼大厅。第二，现场通讯系统跟踪救援单位作业地点的能力是有限的，因为许多单位直接向南塔楼、北塔楼或者万豪大酒店报告；第三，通过短波1号频道跟踪救援单位的努力被大量使用该频道的单位所严重干扰，由于许多人试图立即通话，他们提供的信息相互重叠难以辨认。根据现场通讯系统一位成员的说法，1号频道本来就不能辨认那天早上使用它的单位的代码。
原来有一辆现场通讯指挥车曾经和纽约市警察局紧急事务频道（由该局飞行队使用）联系上过，但是在9月11日那天它坏了，放在车库里需要修理，备用的指挥车没有这个能力。
消防局长、民政局局长和紧急事务救援队的高级警官组织西大街的救护车加快向医院运输伤员。
据我们所知，现场没有任何负责人认为大楼会整体坍塌。确实有一名高级负责人清楚地表达了这样一种观点：几小时后大楼的上部可能会倒塌，因此消防队员们不应爬到60层以上的楼层。这种观点没有被传达到北塔楼大厅里的负责人，也没有证据表明它被传达到南塔楼大厅里的负责人。
尽管消防局长对于如何采取救援行动有最终决定权，但是具体的决定仍由大厅里的指挥官作出。北塔楼的最高指挥官负责与消防局长联系。他们有两个简短的对话：在第一个对话里，该指挥官告诉消防局长自己的职位，并证实这次行动主要是救援而不是灭火；在第二个对话里，大约9：45，消防局长询问北塔楼的情况怎么样，该指挥官建议考虑撤出消防局的所有人员。
9：46，消防局长再次拉响5级警报。大约9：54，又有20个灭火班和6个云梯班被派到世贸中心。结果是该局1/3以上的消防班被派到世贸中心。大约9：57，紧急救援服务队的一名护理人员来到消防局局长面前，告诉该局长说世贸中心7号楼前的一位工程师估计这两座大楼正面临着整体倒塌的危险。
