前往美国的最后训练和安排
暴力劫机者在沙特阿拉伯获得美国签证后，于2000年底至2001年初返回阿富汗接受特殊训练。据说，训练由阿布·图拉布·艾尔·乔达尼负责，在艾尔·玛塔训练营进行。据哈利德·谢赫·穆罕默德所言，乔达尼是少数几个知道劫机计划全部细节的“基地”组织成员之一。阿布·塔拉伯教他们如何进行劫机，解除空乘人员武装和处理爆炸物。他还教他们健身，教他们一些基本的英语单词和短语。
据哈利德·谢赫·穆罕默德所言，乔达尼甚至让受训者用刀子宰羊杀骆驼，以准备在劫机时使用刀子。新招募的人学习在飞机驾驶舱门初次打开时如何尽早抓住机会重点突袭飞行员的座舱，并在其后如何进一步控制飞机的其他部分。他们也学习实施其他类型的袭击，例如，汽车炸弹，这样他们就不会在被抓住时泄漏行动的真实性质。据哈利德·谢赫·穆罕默德所言，在抵达美国之前，暴力劫机者并没有学习所有细节——包括劫机和将飞机撞入大厦的计划。
在阿富汗受训后，“基地”组织人员到了由哈利德·谢赫·穆罕默德在卡拉奇建造的一个安全点，在经由阿联酋前往美国之前暂时停留在那里。这一安全点由“基地”组织成员阿布德·艾尔·雷西姆·拉巴尼（又名阿布·拉赫马赫）经营。拉巴尼是哈利德·谢赫·穆罕默德的亲密助手，通过给其派来的“基地”组织成员寻找住处和提供后勤支持，为其提供了长达3年的帮助。
据一名“基地”组织支持者所言，一位叫阿布杜拉赫·圣德赫的可靠的巴基斯坦信使将这些人带到安全点，他也为哈利德·谢赫·穆罕默德工作。这些后来的劫机者通常三三两两抵达，在此处最长停留两个星期。这名支持者已经辨认出他于2001年春季根据哈利德·谢赫·穆罕默德的指示帮助过的每名成员。在这些人离开巴基斯坦前，他们都从哈利德·谢赫·穆罕默德那里得到了10,000美元作为将来的费用。
这些人从巴基斯坦转道阿联酋前往美国。在阿联酋，他们主要得到了“基地”组织成员阿里·阿布杜尔·阿齐兹·阿里和穆斯塔法·艾尔·豪萨维的帮助。阿里显然在2001年4月至6月9个后来的劫机者经过迪拜时为他们提供了帮助。他帮助他们购买机票，办理旅行支票和预订旅馆；他还教他们西方的日常生活，例如，购买衣服和定购食物。迪拜是一个现代都市，容易进入大型机场、旅行社、旅馆和西方式商业设施，是一个理想的中转站。
据说，阿里估计他正在帮助的这些“基地”组织人员将在美国干一件大事，但他并不了解细节。112他要求哈利德·谢赫·穆罕默德为他派一名助手，哈利德·谢赫·穆罕默德派出了穆斯塔法·艾尔·豪萨维，后者曾经在“基地”组织位于坎大哈的宣传委员会工作。豪萨维帮助把最后4名劫机者（米赫德哈除外）从阿联酋送到美国。他与阿塔商议劫机者前往美国的旅行时间表并在之后与阿塔确认他们都已抵达。他告诉这些劫机者，阿塔将在机场与他们会面。他也协助进行这次行动的一些资金筹集工作。
暴力劫机者于2001年4月底开始抵达美国。多数情况下，他们都是两人一起凭旅游签证进入美国的奥兰多或迈阿密、佛罗里达、华盛顿特区或者纽约。进入佛罗里达的人由阿塔和谢西提供帮助，其他的人则由哈兹米和哈居尔关照。到6月底，15名暴力劫机者中的14名已经飞越了大西洋。
暴力劫机者为行动注入了资金，他们携带了现金和在阿联酋以及沙特阿拉伯购买的旅行支票。现在已经知道，其中的7名劫机者购买了总值接近5万美元的在美国使用的旅行支票。此外，紧随着其他暴力劫机者进入美国，大量的款项立即注入“基地”组织人员在美国开立的银行账户。这说明新来者也随身带着钱。此外，暴力劫机者巴尼汉姆德在来美国之前，于2001年6月25日在阿联酋开设银行账户，存入了近3万美元的等价物。巴尼汉姆德于6月27日到达美国之后，用信用卡和自动取款机从他在阿联酋的账户上提款。
劫机者广泛利用美国的银行。他们既选择大的国际性银行的分行，也选择较小的地方性银行。所有劫机者都以自己的名字开设账户，使用护照或其他表面上看起来有效的证明文件。与大量公开出版的报告相反，没有证据显示劫机者曾经使用过虚假的保护社会安全号码开设任何银行账户。虽然劫机者在使用美国金融系统方面并非行家，但是他们的所作所为也不会让银行怀疑他们有犯罪行为，更不用说实施大屠杀的恐怖阴谋了。
最后抵达的暴力劫机者是哈利德·艾尔·米赫德哈。正如前面提到的，他于2000年6月在圣地亚哥离开哈兹米回到了他在也门的家中。据传在哈莱德劝说米赫德哈返回阿富汗之前，米赫德哈在也门停留了大约一个月。米赫德哈抱怨在美国的生活。他和哈利德·谢赫·穆罕默德见了面，后者仍然为他的擅离职守而恼火。哈利德·谢赫·穆罕默德希望让他撤出行动，但还是对本·拉丹坚持要求保留米赫德哈作出了让步。
2000年末，米赫德哈回家看望家人，在麦加与一名堂兄一直呆到2001年2月，然后返回阿富汗。2001年6月，米赫德哈再次回到麦加与他的堂兄又呆了一个月。米赫德哈说本·拉丹计划对美国发动5次袭击。离开前，米赫德哈要求其堂兄照顾他的家庭和家人，因为他有工作要做。
2001年7月4日，米赫德哈离开沙特阿拉伯回到美国，抵达纽约的肯尼迪国际机场。米赫德哈已经预订了纽约市的万豪旅馆（中间插页，有19名劫机者的照片和所乘航班等说明文字），但他却在纽约另一家旅馆住了一晚。然后他加入帕特森的劫机者群体，时隔一年多后与纳瓦夫·艾尔·哈兹米再次会合。停留两个月后，所有19名劫机者均已进入美国，开始为实施袭击做最后的准备工作。
美利坚航空公司第11次航班从左到右依次为：穆罕默德·阿塔，飞行员；瓦利德·艾尔·谢瑞，韦尔·艾尔·谢瑞，萨塔姆·艾尔·苏卡米和阿布杜尔·阿齐兹·艾尔·奥马瑞，均为劫机者。
联合航空公司第175次航班从左到右依次为：马万·艾尔·谢西，飞行员；费耶兹·巴尼汉姆德、阿哈迈德·艾尔·哥汉姆迪、哈姆扎·艾尔·哥汉姆迪和穆罕德·艾尔·谢瑞，均为劫机者。
美利坚航空公司第11次航班从左到右依次为：哈尼·哈居尔，飞行员；纳瓦夫·艾尔·哈兹米，哈利德·艾尔·米赫德哈，迈杰德·默克得和塞尔姆·艾尔·哈兹米，均为劫机者。
联合航空公司第175次航班从左到右依次为：吉亚德·亚拉赫塞、伊德·艾尔·哥汉姆迪、阿哈迈德·艾尔·哈兹纳维和阿哈迈德·艾尔·纳米，均为劫机者。
