第11潜艇部队 由第11潜艇战队司令指挥，其兵力为第11潜艇战队及“海云丸”，在濑户内海进行训练与休整。
在6月1日前，从第11潜艇战队调到其他各潜艇队的潜艇如下：
5月14日，“吕-47”号调到第34潜艇队，“吕-117”号调到第51潜艇队。
5月19日，“伊-53”号调到第15潜艇队。
联合舰队将龙卷作战（后述）延期到5月12日实施，并对预定参战的潜艇下达如下命令：
1．以“伊-10”号及中型潜艇对马绍尔群岛进行侦察。
2．约以2艘大型潜艇前去马绍尔群岛方向救援敢死队及飞行员。
3．约将3艘大型潜艇部署在“Ma”展开线，以及威瓦克与阿德米勒尔提群岛之间。
4．约以1艘大型潜艇在6月上旬对马绍尔群岛进行航空侦察。
从上述命令来看，先遣部队的任务是以部分潜艇实施作战运输，以多数潜艇在新爱尔兰岛以北海域及马绍尔群岛方向进行巡逻和侦察。新爱尔兰岛以北海域是美军进攻西加罗林群岛的通道。5月14日，先遣部队指挥官就各潜艇的部署等发布如下命令：
1．“伊-14”号潜艇进至阿德米勒尔提群岛与威瓦克之间，“伊-44”号和“伊-53”号潜艇进至“Ma”展开线侦察敌情。
2．“吕-42”号和“吕-44”号潜艇分别侦察夸贾林岛与布朗岛。
3．“吕-47”号潜艇进至马绍尔群岛以东海域，根据命令对所需地区进行航空侦察。
将马绍尔群岛以东海域从马洛埃拉普岛南端，沿70°方位线，划分为2个区域，该线以北为“伊-38”号潜艇的作战区域，以南为”伊-10”号（已在马绍尔群岛以东海域活动）的作战区域。
当日，第7潜艇部队指挥官命令甲潜艇部队在21日0时前到达“Ma”展开线，按“吕-106”号、“吕-104”号、“吕-105”号、“吕-116” 号、“吕-109”号、“吕-112”号和“吕-108”号的顺序由北而南展开，艇间间隔为30海里，敌人可能出现的方向为135°。
“Na”展开线的配置，是第6舰队司令部与联合舰队司令部协商决定的。现将作战输送计划记述如下：
由于损失了“伊-2”号和“伊-42”号两艘潜艇，以及“伊-41”号潜艇返回本土，东南线的运输只有“伊-16”号和“伊-176”号潜艇担任。4月 26日，中太平洋舰队司令长官，将在东南线实施运输的潜艇改为4艘，增派了“伊-36”号及“伊-183”号两艘潜艇。可是，“伊-36”号潜艇在马绍尔群岛一带被击伤，因而返回本土；“伊-183”号艇在航进途中下落不明，实际上担任运输的潜艇还是2艘。
为向马绍尔群岛一带进行运输，曾经发过如下命令：
5月17日，命令“伊-184”号潜艇19日从横须贺出航，驶向米利岛，“伊-5”号24日从横须贺出航驶向沃特杰岛（后改为库赛埃岛）。
5月18日，命令“吕-41”号潜艇作好出航准备后，立即从特鲁克启航，驶向库赛埃岛，并指定“吕-115”号潜艇担任帛琉与威瓦克之间的运输。
以上就是先遣部队在“阿”号作战中的行动计划，还准备按照原定的“龙卷”作战采取种种行动，因此，先遣部队指挥官于5月2日向联合舰队司令长官提出下述意见：
“拟于5月下旬，将我海、空兵力集中于加罗林群岛或新几内亚西部，以期歼灭敌人。值此重要时机，先遣部队的潜艇不得不分别实施截击。‘龙卷’和运输等三种作战。于是，本来为数不多的潜艇就更加分散，必将目标不一，事事无成。
“因此，必须当机立断，暂时停止使用潜艇进行运输作战（尽管有种种困难，但应顾全大局，暂时忍耐为要），将兵力集中用于截击作战，务请再加考虑。”
对此，联合舰队未予另行采取措施。即使“阿”号作战极为重要，但是已把相当数量的潜艇兵力派到西南战线和东北战线，先遣部队对联合舰队如此集中潜艇兵力的作法，不能不有所疑惑。先遣部队除极力集中兵力为“阿”号作战进行准备之外，不能实施其他的作战准备了。在此顺便提一下雷达装备的情况。
吉尔伯特群岛作战后，先遣部队强烈要求大本营采取有效措施，以减少潜艇的损失。
大本营及联合舰队以不影响作战为原则，尽可能使多数潜艇归建，逐步采取措施，以减少潜艇的损失。
这时，雷达、防止漏油装置及自动悬浮装置等，一般皆可装备部队。可是，约至1944年3月，潜艇用的雷达，才刚刚通过实验，只在极少数潜艇上开始安装。“吕-113”号潜艇安装的是一部从“大和”号战列舰上调来的雷达。
四、“龙卷”作战
海军早就开始研究在潜艇上搭载水陆两用坦克的问题。关于建造“J”型潜艇的情况，前面已经提过，中途岛海战后，为了实施出敌不意的登陆，就提出了这种要求。
为了制造水陆两用坦克，首先研究“特二”式内燃机艇（即轻型坦克），随后又研究“特三”式内燃机艇（即中型坦克）。除此之外，吴海军工厂造船部的堀元美技术少校，吸取了瓜岛作战的教训，还设计一种运输用的水陆两用坦克，后来称之为“特四”式内燃机艇。
关于“龙卷”作战的来历，还不很清楚。据当时在军务局工作的吉松田守中校回忆，是在特鲁克岛受到空袭后不久（1944年2月），由军令部第二部部长黑岛龟人突然提出的。军令部负责潜艇业务的藤森康男中校认为，瓜岛作战之后，必须采取出敌不意进行袭击的战法，因而考虑能否越过防潜网进行攻击的问题。约至 1943年底，得到吴工厂提出的方案，于是便进行了实验，并取得一定的成果。
黑岛部长可能是因接到藤森的报告而得知“特四”式内燃机艇的。黑岛部长提出方案后，迅速进行了准备。接着，就由袖珍潜艇的艇员在情岛（吴港附近）的“Q”基地开始进行训练。
关于这项作战行动的有关事宜，联合舰队参谋3月中旬到特鲁克，与第6舰队的主管参谋在帛琉作了进一步的商讨。中太平洋舰队司令长官南云忠一，以不符合形势需要为由，提出反对意见。但是，联合舰队司令部经将已商定的计划作为“阿”号作战的组成部分于5月3日下发执行了。
联合舰队下发的“龙卷”作战要点是，由先遣部队航空兵的部分兵力进行侦察，以“特四”式内燃机艇（携带2条鱼雷）攻击停于马绍尔群岛的美特混舰队，尤其是攻击其中的航空母舰。“龙卷”部队的兵力区分如下：
龙卷队 辖有大型潜艇约5艘；
侦察队 辖有“伊-20”号艇及中型潜艇约4艘，负责预先侦察；
收容掩护队 辖有大型潜艇约2艘，负责救援袖珍艇艇员，并进行掩护。
预定的攻击日期为5月20日。指定参加“龙卷”作战的潜艇为：“伊-36”号、“伊-38”号、“伊-41”号、“伊-44”号和“伊-53”号。约自5 月6日起，除“伊-36”号艇以外，其他4艘潜艇均与“特四”式内燃机艇开始进行合练。但是得出的结论却是，由于“特四”式内燃机艇性能欠佳，无法实施这项作战。作出这一结论的理由，有关人员认为有以下几点：
1．发动机噪音太大；
2．速度较慢；
3．履带一碰石头就坏。
于是，5月12日，便根据第6舰队提出的意见，下令延期实施“龙卷”作战。
五、美军进攻马里亚纳群岛之前
(—)部署在特鲁克以南海域的潜艇
“伊-41”号、“伊-44”号和“伊-53”号潜艇，5月15-16日从吴港出航驶向指定的配置水域。5月27日，“伊-44”号在水深35米处悬停（潜航中停住，保持静止状态）时被深弹炸伤，此后返回本土。
“吕-104”号、“吕-109”号、“吕-112”号以及从本土开来的“吕-105”号、“吕-106”号，从塞班岛出航；以上各艇均于22日前后进入“Na”展开线。
5月23日，先遣部队指挥官根据通信部门报告的情况判断，“吕-104”号潜艇大概已被敌巡逻机发现，则令位于北部的3艘潜艇沿135°方位线移动50海里，第7潜艇部队指挥官将这几艘潜艇配置在A展开线。
图16 新爱尔兰群岛以北海域潜艇配置示意图
5月14日，下令组成“Ma”展开线、“Na”展开线
5月22日，“Na”展开线组成，“吕-106”号沉没
5月23日，下令组成“A”展开线，“吕-104”号沉没
5月24日，“吕-116”号沉没
5月25日，“吕-109”号擅自沿320°方位线移动100公里
5月26日，“吕-108”号沉没
5月28日，下令组成“B”展开线
5月31日，“吕-105”号沉没
注：△为潜艇被击沉的位置。①-“吕-106”号、②-“吕-104”号、③-“吕-116”号、④-“吕-108”号、⑤-“吕-105”号
5月25日，“吕-109”号潜艇，以为自己已被发现，擅自沿320°方位线移动60海里。
5月28日，“Na”展开线多次被敌机发现。因此，第7潜艇部队指挥官命令甲潜艇部队向西移动100海里，组成B展开线。
“吕-106”号、“吕-109”号潜艇于5月31日，“吕-108”号、“吕-112”号、“吕-116”号潜艇于6月6日，“吕-104”号、“吕 -105”号潜艇于6月8日奉命停止巡逻，返回特鲁克，但除“吕-109”号和“吕-112”号外，其余潜艇均未能返回。美国战史文献对此是这样记述的。
美军根据巡逻机的侦察、无线电的测向以及日军的企图，从理论上推断出日本潜艇的搜索线，便派出3艘装备有新式武器（可向前投射的刺猬弹）的护卫舰组成猎潜群前去反击。这种刺猬弹是一次投射多枚，其落点散布成椭圆形的一种新式反潜武器。这个猎潜群多次发现日本潜艇，其中的“英格兰”号护卫舰以刺猬弹实施数次攻击，击沉日潜艇多数。
“英格兰”号等护卫舰发现日本潜艇的情况
(二)马绍尔一带的潜艇部署
“伊-10”号于5月9日从横须贺，“伊-38”号及“吕-44”号于15日从吴港，“吕-42”号于15日从横须贺出航，前往指定水域。
它们在指定水域进行巡逻，并遵照上级的命令对某些要地进行侦察。
6月9日，岸基航空兵的侦察机对马朱罗岛进行了侦察，发现该地的美特混舰队已经出动。因此，“伊-10”号、“吕-42”号和“吕-44”号潜艇按照原来的命令迅速进行侦察，“伊-38”号奉命取消侦察夸贾林岛的计划，而改为12日对马朱罗岛实施侦察，“吕-44”号10日对布朗，“伊-10”号12日对马朱罗岛进行了侦察。只发现在马朱罗岛停有1艘运输船。
“伊-176”号于5月10日，“伊-16”号于24日从特鲁克出航，分别前往布喀岛和布因，这2艘潜艇出航后便下落不明，未能返回。这样，在东南线进行运输的潜艇就1艘也没有了。6月5日，第7潜艇战队司令官提出意见，要求重新考虑东南线的作战输送问题。当天，联合舰队司令长官命令停止东南线的潜艇运输。
“吕-115”号潜艇5月19日离开特鲁克，27日完成了向威瓦克的运输后，6月3日回到帛琉，6月7日又驶向新爱尔兰岛以北海域。向威瓦克的运输，本来只想派“吕-115”号潜艇前送一批文件，后来根据陆军的要求，改由“伊-185”号潜艇承担这项任务，该艇于6月10日从吴港向威瓦克进发。
我于9月下旬乘飞机从腊包尔返回本土。随即被任命为“吕-41”号潜艇的舾装长。在所罗门群岛经过旷日持久的战斗之后，仍然无暇休息一下。
1944年3月中旬，“吕-41”号潜艇完成就役训练后来到特鲁克。这里既有餐厅，也有旅馆，这是前线的一个热闹地方，但是也因连日遭到空袭而变得冷冷清清。能对我们艇员进行慰问的，大概只有潜艇基地的电影了。即使看电影，也常因空袭而中断，不得不迅速跑进防空洞。
“吕-41”号艇的任务是，为库赛埃岛进行运输，并对马绍尔群岛进行警戒。5月24日，“吕-41”号艇离开特鲁克，30日进入库赛埃港。美军破译了密码，发现了“吕-41”号潜艇的行动。美军水上飞机往日只有上午在库赛埃岛出现5分钟左右，但从30日傍晚开始，连续3天不断来袭，还有驱逐舰及猎潜艇等（3艘）也在港外巡逻。
“吕-41”号于31日卸下物资，美军舰艇撤离后出港，前往马绍尔群岛一带作战。
31日，“吕-41”号潜艇除报告自己情况外，还说明原用的密码已被破译，请上级改变“伊-5”号潜艇近日向库赛埃岛进行运输的计划。
据此报告，上级改变了“伊-5”号艇的行动。后来采用的方法是，潜艇实施运输时，不事先与当地联系，等潜艇到达目的地后，用信号进行联络。
“吕-41”号潜艇的配置位置，改为离贾卢伊特岛150海里，270°方位的水域，7日到达上述位置。
“伊-5”号潜艇5月26日离开横须贺（经由塞班岛），前往库赛埃岛，因出现前述情况而将运输地点改为波纳佩岛，后因油舱漏油而驶往特鲁克岛。
“伊-184”号潜艇5月20日从横须贺出航，6月13日为米利岛进行了运输。
(三)第6舰队司令部迁至塞班岛
4月底，第6舰队司令部从特鲁克迁往濑户内海西部，设在“筑紫丸”上，有关人士回忆这次转移时，曾说：
“认为第6舰队司令部不宜设在特鲁克岛的想法，是2月份特鲁克遭到空袭后提出的。深受长官在前线指挥作战的思想影响，进至特鲁克实施作战指挥。可是由于帛琉已经遭到空袭，还有遭到大型飞机空袭的可能，以及第7潜艇战队司令部在此地，所以第6舰队则决定将司令部转移到塞班岛。后又因‘龙卷’作战而迁到本土，以至将司令部设在‘筑紫丸’上。”
“龙卷”作战延期实施后，第6舰队决定的方针是，进驻塞班岛实施指挥，便于与中太平洋舰队取得联系。于是，于6月6日来到塞班岛。参谋长等留在“筑紫丸”上，负责领导潜艇的训练与休整。
六、马里亚纳海战
5月20日，联合舰队发布“‘阿’号作战开始”的命令，各部队将用于截击作战的兵力展开。
5月27日，盟军在新几内亚北岸附近的比阿岛开始登陆。如盟军从这个方向来袭，日军不实施决战。尽管联合舰队制定了这样的作战方针，但是，联合舰队司令长官认为比阿岛的地位十分重要，因此将第1航空舰队3个突击集团中的2个派到这里。此外，还将第1战队等强而有力的编队派来，以期巩固该岛，陆军也决定派出部队来增援，并将这项行动称为“浑”号作战。
当日军的注意力逐渐被吸引到比阿岛方向时，美特混舰队于6月11日袭击了马里亚纳群岛。13日，美军开始对塞班岛和提尼安岛进行炮火准备，并派驱逐舰进行扫雷。因此，联合舰队司令长官发布“‘阿’号作战兵力准备决战”的命令；后于15日，美军在塞班岛开始登陆时，则下令“‘阿’号作战开始”。
已经进至菲律宾中部的第1机动舰队，即向塞班岛以西海面前进。但是，第1航空舰队的突击集团集结迟缓，因而无法策应机动编队的决战。在6月19日及20日所进行的马里亚纳海战中，第1机动舰队遭到彻底失败。
(一)潜艇部队在马里亚纳群岛一带集中使用
6月21日，美特混舰队袭击马里亚纳群岛时，中太平洋方面的先遣部队的状况如下：
特鲁克以南海域有“伊-53”号潜艇在“Ma”展开线活动，“伊-41”号在阿德米勒尔提岛以西海域，“吕-111”号、“吕-113”号、“吕-115”号和“吕-117”号在特鲁克以南海域巡逻警戒。
部署在马绍尔群岛一带的有“伊-10”号、“伊-38”号、“伊-184”号、“吕-41”号、“吕-42”号和“吕-44”号潜艇。
部署在特鲁克一带的有“吕-109”号、“吕-112”号（停泊）和“伊-5”号（正向特鲁克航进）潜艇。
停于塞班岛的有：“吕-36”号、“吕-43”号和“吕-114”号潜艇。
已从本土出航或准备出航的潜艇有“伊-185”号，6月10日从吴港向威瓦克运输；“伊-6”号，6月15日从横须贺出航；“伊-36”号，6月19日从吴港出航；“伊-45”号，6月28日从横须贺出航；“伊-47”号，6月14日从吴港出航。
后来编入并出海执行任务的有“伊-26”号，6月27日从吴港出航；“吕-46”号，6月23日从吴港出航；“伊-54”号，7月7日从吴港出航；“伊-55”号，7月5日从横须贺出航；“吕-48”号，7月5日从吴港出航。
返回本土的潜艇有“伊-44”号，6月5日到达吴港。
6月11日，因为无法判断美军的企图，先遣部队指挥官命令停于塞班岛的潜艇出海，在塞班岛附近海域活动。12日，美特混舰队继续进行空袭。据第7潜艇部队指挥官判断，美特混舰队返航时可能会空袭特鲁克，便命令停泊于该地的“吕-109”号（12日出航）、“吕-112”号（14日出航）到特鲁克周围海域活动。这2艘潜艇均有一舷的主机不能使用。
13日，联合舰队司令长官命令先遣部队，将部署于马绍尔群岛一带及加罗林群岛以南海域的潜艇调往东加罗林群岛以北海域。为此，先遣部队指挥官发布如下命令：
1．“伊-10”号、“伊-38”号、“伊-184”号、“吕-41”号、“吕-42”号及“吕-44”号潜艇，立即前往关岛以东海域；“伊-41”号、 “伊-53”号潜艇及第7潜艇部队的所余兵力，立即前往关岛以南海域，“伊-6”号及“吕-47”号潜艇立即前往塞班岛以西海域。
6月17日前，如无新的命令，则由第7潜艇部队指挥官组织实施上述部署。
2．“伊-5”号潜艇按原定计划实施运输。
这一天，“伊-33”号潜艇发生事故，在伊予滩沉没。高木长官因在塞班岛难以指挥作战，便命令第7潜艇战队司令大和田指挥第1和第7潜艇部队。第7潜艇部队指挥官于16日发布如下命令：
1．第7和第1潜艇部队由本职指挥。
2．兵力区分
甲潜艇部队 由第15潜艇队司令指挥，下辖“伊-38”号、“伊-10”号、“伊-184”号、“伊-53”号和“伊-6”号潜艇。
乙潜艇部队 由第34潜艇队司令指挥，下辖“吕-42”号、“吕-44”号、“吕-41”号和“吕-47”号潜艇。
丙潜艇部队 由第22潜艇队司令指挥，下辖“伊-185”号、“伊-5”号和“伊-41”号潜艇。
丁潜艇部队 由本职直接指挥，下辖第7潜艇战队以及“吕-36”号、“吕-43”号潜艇。
3．应敌部署
甲潜艇部队在C展开线，乙潜艇部队在D展开线，丙潜艇部队在E展开线，丁潜艇部队在塞班岛周围活动……
在此之前，丰田联合舰队司令长官于15日向先遣部队下达如下命令：
1．将其全部兵力的二分之一部署在X、Y展开线；
2．将另二分之一的大部分兵力部署在塞班岛及关岛。
3．将其余的兵力部署在Z展开线。
第7潜艇部队指挥官接此命令后，对原来的部署作了如下变动（16日23时17分）：
1．“伊-184”号和“伊-6”号潜艇从甲潜艇部队调往丙潜艇部队，“吕-43”号潜艇从丁潜艇部队调往乙潜艇部队。
2．各部队的部署是，甲潜艇部队进入Z展开线，自北而南的顺序为“伊-10”号、“伊-38”号和“伊-53”号艇；乙潜艇部队进入Y展开线，自北而南的顺序为“吕-47”号、“吕-42”号、“吕-44”号、“吕-41”号和“吕-43”号艇；丙潜艇部队进入X展开线，自北而南的顺序为“伊-6”号、 “伊-185”号、“伊-184”号、“伊-5”号和“伊-41”号艇（X、Y、Z展开线都在马里亚纳群岛东南）。
于是各潜艇便急速驶往指定海域。“伊-5”号潜艇15日从特鲁克岛出航，“伊-185”号潜艇停止向威瓦克岛运输，驶往塞班岛以西海域。
16日，联合舰队司令长官为了防止在机动部队决战时混乱，便命令先遣部队，“在马里亚纳一带执行任务的潜艇，18日18时后，如无特别命令，不准进入塞班岛与乌利西群岛一线以北，东经145°线以西的海域”。
10日，第7潜艇部队指挥官就丁潜艇部队的部署与作战要点发布命令如下：
1．敌特混舰队已出现于罗塔岛及关岛以西海面。
2．丁潜艇部队对能够攻击之敌反复实施攻击。
(1)18日、19日在塞班岛及提尼安岛一带的潜艇为“吕-36”号，“吕-112”号、“吕-114”号；在关岛一带的为“吕-115”号。
(2)20日以后在塞班岛及提尼安岛一带的潜艇为“吕-113”号、“吕-109”号、“吕-117”号，在关岛一带的为“吕-111”号。
(3)各艇围绕岛的周围，逆时针机动，如将鱼雷耗尽，则到外巡逻区待命。
接着，又发布命令将塞班岛一带的巡逻区作了如下变动：
1．以罗塔岛为基点，在100及200海里的范围内，从0°开始，每隔30°划为1区，各区名称从内圈开始，顺时针排列为“I YO Ha Ni……U”
2．丁潜艇部队的潜艇，鱼雷用完后，分别到下述巡逻区进行侦察。
“吕-36”号到“Wa”区，“吕-114”号到“Ka”区，“吕-112”号到“Yo”区，“吕-115”号到“Ne”区。
19日，为了配合机动部队的决战，联合舰队司令长官命令丁潜艇部队向P、Q展开线移动，命令丙潜艇部队向西进击。20日，联合舰队司令长官下达命令：“各潜艇部队责令性能较差的潜艇返回特鲁克，其余潜艇在各展开线展开，尽可能配置在塞班岛及关岛周围。”这样就起了为配合机动部队的决战而对潜艇所作的限制。
这期间，各潜艇与敌交战的情况如下：
“吕-43”号艇26日遭到敌驱逐舰的炮击及深弹攻击，因而丧失作战能力。
“吕-115”号艇19日在罗塔岛以西50海里水域用鱼雷攻击1艘美航空母舰，但效果不明（美方资料无此记载）。
另有“伊-36”号潜艇19日离开吴港，装载燃料及弹药前往特鲁克岛。
以上为6月20日前先遣部队的作战概况，后因美军出乎意料地来攻马里亚纳群岛，便将大部分潜艇从马绍尔群岛及新爱尔兰岛一带勿忙北调，使潜艇在马里亚纳一带的集结较迟。各潜艇是否都已到达指定水域，还不完全清楚，但据估计到20日这天基本上都可进入指定部署。
七、马里亚纳海战后的潜艇作战
6月21日，联合舰队司令长官命令派遣1艘大型潜艇前往关岛，尽量将多数飞行人员接出并送到濑户内海西部（22日责成“伊-41”号潜艇执行这项任务）。还令潜艇接出在塞班岛的第6舰队及第3驱逐舰战队司令部（下令日期不明），第7潜艇部队指挥官派遣“伊-10”号潜艇执行此任务。
22日，第7潜艇部队指挥官命令各艇行动如下：
1．甲潜艇部队（缺“伊-10”号，另加“伊-6”号和“吕-47”号潜艇）前往塞班岛巡逻区攻击敌人。（甲潜艇部队辖有“伊-38”号、“伊-53”号、“伊-6”号、“吕-47”号4艘潜艇）。
2．其余各潜艇行动如下
(1)“伊-10”号及“伊-41”号执行特殊任务。
(2)丁潜艇部队及“伊-5”号、“吕-42”号、“吕-44”号艇返回特鲁克。
(3)“伊-185”号及“伊-184”号根据司令部的指示，返回帛琉群岛，“伊-184”号进行补给后待命，“伊-185”号实施运输。
(4)“吕-41”号艇驶回濑户内海西部，进行休整。
被击伤的“吕-43”号潜艇于21日奉命返回本土。还另有命令，将塞班岛一带的巡逻区作了规定：以塞班岛南端为基点，在100及200海里的范围内，从0°开始，每隔30°划为1区，内圈的各区名称从“i”，到“O”，外圈从“Wa”到“U”，均为顺时针排列。
甲潜艇部队的潜艇部署于下述巡逻区：
“伊-38”号在“I、RO、Ha”区，“伊-6”号在“To、Chi、Ri”区，“伊-53”号在“Ni、Ho、He”区，“吕-47”号在“Nu、Ru、O”区。
按照上述命令从各地返回的潜艇情况如下：
回到特鲁克的潜艇有“伊-5”号、“吕-109”号、“吕-111”号、“吕-113”号及“吕-115”号5艘。
返回本土的潜艇有：“吕-41”号和“吕-43”号2艘。
下落不明的潜艇有“伊-184”号、“伊-185”号、“吕-36”号、“吕-42”号、“吕-44”号、“吕-111”号、“吕-114”号及“吕-117”号8艘。
加上前述在“Na”展开线损失的5艘潜艇，自“阿”号作战以来，共损失13艘潜艇。
24日，“伊-41”号潜艇抵达关岛，接下106人，后于6月30日回到大分。在接援第6舰队司令部以及其他单位的行动中，因“伊-10”号潜艇未在6月 25日到达规定地点，28日则派“伊-38”号、接着又派“伊-6”号潜艇去执行这项任务，但都未成功，7月2日停止这一行动。
26日，联合舰队宇垣参谋长就以后的潜艇作战问题作了指示：“回到特鲁克的潜艇，避免逐次投入战斗，而应进行休整，以便7月15日前后实施全力出击！”
这个指示的意图是，要在马里亚纳群岛一带继续进行潜艇作战。
然而，7月2日联合舰队司令部又作了如下指示：
1．休整后的潜艇对马里亚纳群岛的敌特混舰队实施攻击，正在海上作战的潜艇完成任务后，逐次返回本土进行休整。
2．在马里亚纳群岛一带执行特殊任务的“伊-54”号和“伊-55”号潜艇，完成任务后直接返回本土。
3．停泊于特鲁克的潜艇返回本土。
4．在本土的潜艇，要立即采取措施，以防被敌击毁。
下达这个指示的原因不明，但截至7月2日，已有13艘潜艇被毁，大概如不采取防止潜艇被毁的措施，就难以继续作战了。
部署在马里亚纳群岛周围的潜艇，根据6月22日的命令来看，有“伊-38”号、“伊-6”号、“伊-53”号和“吕-47”号4艘（6月24日到达规定地点）。6月23日，从吴港出航的“吕-46”号潜艇，因发生故障而返回本土，28日又增派了“伊-10”号潜艇。“伊-53”号潜艇因发生故障而撤出巡逻区，7月2日向特鲁克返航。
7月7日，撤消甲潜艇部队的建制，并令“伊-10”号潜艇返回特鲁克，“伊-38”号潜艇返回濑户内海西部。“吕-47”号潜艇于10日撤出巡逻区，返回濑户内海西部。7月5日从本土出航的“吕-48”号潜艇于16日奉命返航，从而结束了马里亚纳群岛周围的袭击作战。
关于由本土出航的大型潜艇以运炮罐或运输罐进行输送以及从马里亚纳的几个海岛接下人员（包括提尼安岛的第1航空舰队司令部）的问题，一再改变后，作出如下决定：
“伊-26”号在关岛卸载后，去提尼安岛接援人员。
“伊-45”号在关岛卸载后，接援当地人员。
“伊-54”号在提尼安岛卸载后，接援当地人员。
“伊-55”号同上。
上述潜艇的行动，仅“伊-26”号于7月9日成功地向关岛运送了运炮罐。7月27日“伊-45”号返回横须贺，此后就停止了中太平洋的潜艇作战，决定所有潜艇均采取对策，以防被敌击毁。
但是，还有几艘潜艇正在执行任务。
“伊-36”号正向特鲁克运送燃料，6月30日到达目的地，7月5日离开该地（并接下人员90名），16日回到吴港。
“伊-5”号7月7日离开特鲁克，9日成功地向波纳佩进行输送后，驶往横须贺，但下落不明。
“伊-53”号在第7潜艇战队司令指挥下，7月15日离开特鲁克，25日到达吴港。
此外，高木长官在塞班岛阵亡，由三轮茂义中将接任第6舰队司令长官。三轮中将于12日到“筑紫丸”上任。
6月下旬，丁潜艇部队所属的潜艇回到特鲁克后，第7潜艇战队司令多次召集回到这里的潜艇军官开会研究。最后决定向大本营陈述必须装载特攻武器的意见。并派首席参谋泉与“吕-113”号潜艇艇长渡边久上尉，乘“伊-36”号潜艇于7月5日从特鲁克出发，返回本土。渡边上尉将“吕-113”号艇的指挥委托给新上任的第51潜艇队司令杨田清猪上校。
7月底或8月初，在吴港召开了一次规模较大的潜艇作战研究会。这次会议的主要议题是，讨论如何防止被敌击毁的问题，此外还强调使用特攻武器。日潜艇面对美军的反潜战难以行动，因此希望彻底改变潜艇的使用方针。
八、“阿”号作战中的潜艇战
如所如述，在6月22日命令返回特鲁克、帛琉及本土的潜艇中，回去的只有7艘，未能回去的有8艘，加上在“Na”展开线—带损失的5艘，以及在东南线执行运输任务时下落不明的2艘，一共损失15艘潜艇。
接着又有“伊-5”号、“伊-6”号、“伊-10”号、“伊-55”号及“吕-48”等5艘潜艇未能返回。这就是说，在“阿”号作战中损失的潜艇为参战 36艘中的20艘。而战果方面，据陆军或侦察机报告，击沉、击伤敌航空母舰及战列舰多艘。以实际上并非如此，“阿”号作战中的潜艇战遭到了彻底失败，研究其失败的原因，主要有以下几点。
1．对敌人的反潜能力估计不足
“阿”号作战中潜艇损失惨重的最大原因是美军反潜能力已有很大提高，而日方对此缺乏认识，以为美军的反潜能力比吉尔伯特群岛作战时强不了多少。
在对付敌人的雷达方面，第11潜艇战队在训练中没有采取措施，舰队司令部也未发出什么指示。访德归来的潜艇，就突破比斯开湾的战法作了报告，认为应当昼夜潜肮，日出日没时上浮充电。
各艇艇长根据亲身体会，讨论了上述战法。“伊-41”号潜艇在向布因运输时，成功地运用了突破比斯开湾的战例。
2．对敌人的进攻方向判断不准，巡逻部署不当
根据对敌人进攻方向的判断，将潜艇集中部署在敌人进攻可能经由的航线上，即特鲁克岛与新爱尔兰岛之间。但因敌人的进攻方向是马里亚纳群岛，则使这一部署不仅无所作为，反而耽搁了潜艇向马里亚纳方向集中。
其次要研究的问题是在巡逻部署中如何捕捉敌人，是否要构成展开线。
当时我是“伊-41”号潜艇艇长，在特鲁克停泊时，我就知道了“Na”展开线。我向第7潜艇战队司令部提出如下建议：
“在警戒严密的海域，这样的部署是危险的，有可能遭到严重损失。如1艘潜艇已有被发现的征兆，就必须大幅度地分散转移。”
提出上述意见后，我就出海了。从“Na”展开线作战指导的后果来看，是不胜遗憾的。
这里不妨谈一下当时美国的潜艇战。马里亚纳海战前，美国潜艇的部署如下：
在塔威塔威海域有3艘，棉兰老岛东南海域有3艘，吕宋岛以北海域有3艘，圣贝纳迪诺海峡东口有1艘，苏里高海峡东口有1艘，巴士海峡有3艘，马里亚纳群岛以北海域有1艘，马里亚纳群岛以西海域有4艘，另在菲律宾海、塞班岛以西及帛琉群岛以北海域有9艘，共计28艘。
美潜艇以上述部署来察明并通报日本机动编队的行动，在马里亚纳海战中，取得击沉2艘航空母舰（“大凤”号和“翔鹤”号）的战果。在敌我反潜能力相差悬殊的情况下，虽然不宜简单地加以对比，但是总可看出，美国潜艇的巡逻布势是有效的。
从美军的反潜能力看，我认为日军不宜将多艘潜艇集中用在一个海域，而应在敌人可能经过的几条航线纵深配置潜艇。
3．向马里亚纳一带集结潜艇重蹈覆辙
在研讨吉尔伯特群岛作战时曾经指出，由于对敌人进攻的地点与时间作出了错误判断，不得不使潜艇以其几乎是最大的作战能力进行活动。在“阿”号作战中也是这种情况。
4．要地攻防战中的潜艇部署欠妥
总结吉尔伯特群岛的作战时认为，“在警戒严密的局部地区投入较多的潜艇，虽能期望取得较大战果，但其损失也颇大”。可是，从当时潜艇的作战能力看，如部署在局部地区，是无法期望取得较大战果的。
九、其他地区的潜艇战
(一)西南线
西南线潜艇部队1943年12月1日时的兵力如下；第14潜艇队（“伊-27”号和“伊-37”号）、第30潜艇队（“伊-162”号、“伊-65”号、 “伊-166”号、“吕-110”号和“吕-111”号艇）、“伊-10”号、“伊-26”号及执行访德任务的“伊-8”号和“伊-29”号艇。12月 10日，撤消第14潜艇队的建制，其所属潜艇配属给第8潜艇战队。于同一天，“吕-112”号潜艇编入第30潜艇队。第8潜艇战队的“伊-10”号潜艇，自1944年1月1日起归第6舰队直接指挥。
1944年2月，“伊-27”号和“吕-110”号潜艇被敌击沉。3月25日，撤消第30潜艇队的建制，其所属潜艇“伊-162”号艇调往吴港守备战队， “伊-165”号和“伊-166”号艇调往第8潜艇战队，“吕-111”号和“吕-112”号艇调往第51潜艇队。
此外，先后于1月及2月编入第30潜艇队的“吕-113”号和“吕-114”号艇，并未进至西南线，而于3月25日编入第51潜艇队。还有完成访德任务后返回本土的“伊-8”号潜艇，于1944年3月初近至槟榔屿。
4月20日，“伊-26”号潜艇编入先遣部队（6月20日编入第15潜艇队）。4月，“伊-37”号潜艇触雷。至5月1日时，西南线潜艇部队的兵力如下：
在印度洋实施破交作战的潜艇有“伊-8”号、“伊-165”号及“伊-166”号3艘。
执行访德任务的是“伊-29”号和“伊-52”号潜艇。
正从德国远航的是“吕-501”号潜艇。
“伊-8”号，3月上旬进至槟榔屿，3月下旬至5上旬在印度洋作战，击沉敌船2艘（12376吨）。
“伊-26”号，2月26日从槟榔屿出航，对查戈斯群岛进行侦察后，去马尔代夫群岛一带活动，4月下旬向槟榔屿返航。其战果为击沉敌船3艘（23591吨）。
“伊-37”号，从2月10日至4月底在马达加斯加岛一带作战，击沉敌船3艘（19312吨）。在从槟榔屿驶往新加坡的途中触雷，后又返回槟榔屿，于8月驶回本土。
“伊-162”号潜艇在1943年12月14日到1944年3月25日期间出航2次，击沉敌船1艘（7127吨）。
“伊-165”号潜艇从1月7日到4月上旬在印度洋中部进行2次作战，击沉敌船2艘（14202吨）。5月底从苏腊巴亚出航，前往澳大利亚西北海域活动，7月上旬返回苏腊巴亚。
“伊-166”号潜艇从2月上旬到5月前后，两次去孟加拉湾作战，未取得战果。
“吕-110”号潜艇2月2日从槟榔屿出航，前往印度以东海域作战，出航后未能返回。该潜艇于2月11日击伤英国商船1艘（6274吨），当天被澳大利亚军舰击沉。
