保加利亚的政治前途及其南部疆界问题，是1944年10月丘吉尔访问莫斯科时讨论的问题之一，它是包括在英俄双方就巴尔干地区划定势力范围的协议范围之内的。在那以前，已经初步商定，用两次世界大战之间的保希边界作为领土划分线。10月11日，三个盟国政府发表公开声明，大意是说，作为停战的条件，保加利亚政府必须承诺在十五天内从希腊和南斯拉夫领土上撤走一切保加利亚军队和官员。这一撤退工作将在俄国代表任主席的联合军事代表团的监督下进行。保加利亚立即接受了这个条件。格奥尔基耶夫总理通知盟国说，从希腊领土上撤走保加利亚军队的行动实际上已于10月10日开始，至于官员的撤退和把行政权移交给当地人，则在10月10日以前就已完成。他保证，保加利亚当局将给予盟国军事代表团以最充分的协助。
10月19日，丘吉尔离开莫斯科时发表的公报宣称，已就保加利亚停战条件中的“其余各点”达成协议。10月26日，在莫斯科开始停战谈判。保加利亚外交部长斯塔伊诺夫一开始就宣读一篇准备好的声明，承认战时保加利亚政府所犯的错误和罪行，声称祖国阵线政府决定执行一种完全不同的政策。斯塔伊诺夫说，政府现正在对德国作战，并且已经在开始肃清战时政府的官员了。他说：“人民司法的巨掌将毫不容情地把他们统统打倒。”在第二天的会议上，斯塔伊诺夫接受了停战条件，他说，其中有些已经在履行了。保加利亚代表团对某些细节提出了一些问题并得到了解释。10月28日，停战协定签字。条件同罗马尼亚所接受的大致相同。应给予俄国军队在整个保加利亚领土上自由活动的权利，苏联最高统帅部的一切需要应予以供应。保加利亚政府保证释放盟国战俘并负责供应战俘和战时难民的生活需要；保证解散“法西斯类型”的组织，并对战犯采取行动。戏剧、出版物和通讯设施均置于苏联控制之下。保加利亚同意解除他们境内德军的武装；同意提供保加利亚部队，在红军司令部指挥下参加战斗；同意废除所有有关并吞希腊领土或南斯拉夫领土的各项立法，以补充他们早先承担的从战前疆界以外领土上撤走的义务；同意归还过去从苏联或从希腊或南斯拉夫领土上被德国或保加利亚搬走的各种财物。可能是由于保加利亚军队从未侵入苏联国境，没有规定它支付一定数额的赔款，这个问题留待以后再行决定；但是，保加利亚人应把一切属于保加利亚自己的或属于德国其他盟国的战争物资，包括战舰在内，统统交给苏联统帅部。保加利亚的商船也归俄国控制。主要是由于美国对罗马尼亚停战协定中关于盟国管制委员会权力在措词上不够清楚有意见，因而在保加利亚停战协定的相应条款中特别提到西方代表要参加该委员会的工作，同时也规定在整个对德作战期间该委员会应一直受苏联最高统帅部的全面领导。
甚至在停战谈判开始之前，斯坦切夫将军指挥下的保加利亚军队已向南斯拉夫境内发动进攻，以切断德国人从希腊撤退的后路。保加利亚和南斯拉夫的共产党领导人于9月间举行了一次会议，以协调他们的对德作战行动。斯坦切夫指挥下的保军攻占了德军主要交通线上的南斯拉夫重镇尼什，消息传来，使10月间在莫斯科谈判的保加利亚代表团的地位大为加强。1944年11月，保加利亚和南斯拉夫两国的共产党领袖就马其顿问题取得了一个勉强的妥协之后，正在考虑组成一个南部斯拉夫人联邦的方案，但无法就下面这一问题取得一致意见，即保加利亚是以现在的南斯拉夫联邦各成员国这样一种身分加入进去(也就是说，应当并入南斯拉夫)，还是以相当于整个南斯拉夫这样一种身分加入南部斯拉夫人的联邦(即作为南斯拉夫的一个合伙者，而不是作为它的一部分)。这个争论最后提请斯大林仲裁，但是由于种种原因，组织联邦的这些建议并没有什么下文。
1944年12月，希腊发生内战，英国军队进行干预，反对希腊全国人民解放军，引起了保加利亚共产党人的猜疑，他们担心英国已在着手采取一些行动，以镇压巴尔干各国“左派”政治集团和“左派”政府。这一形势对农民党领导人G·M·季米特洛夫的地位有不利的影响，战争时期他曾在英国人手下工作过，共产党人现在把他看成是英国的代理人，是来执行英国企图制止俄国向博斯普鲁斯海峡扩张的传统政策的。季米特洛夫为加强农民党实力所作的努力，引起了共产党人极大的敌视，因此他那农民联盟总书记的职务无法再保持下去了。1945年1月18日，他辞去了这一职务。
G·M·季米特洛夫的辞职，只是保加利亚共产党人和农民党人之间摩擦日益增加的迹象之一。城市和乡村中的祖国阵线委员会的工作从来就不是很顺利的，没有多久，共产党人和农民党人就相互大肆指责起来。1945年5月，共产党人采取了一些分裂农民党和社会民主党的步骤。继G·M·季米特洛夫担任农民联盟总书记的尼古拉·佩特科夫也被迫辞职，继任的是一个对共产党更顺从的农民党人奥鲍夫，他同时也控制了农民党的党报。大约在同一时间，共产党支持的社会民主党候选人奈科夫控制了社会党的报纸《人民报》，两个月后，奈科夫集团又夺得了社会党党组织的领导权。结果，农民联盟分裂成两派，一派由奥鲍夫领导，主张同共产党更紧密地合作，另一派人数更多，纠集在佩特科夫的周围。同样，社会民主党人中也分裂出一个小派，支持奈科夫同共产党合作的政策，而人数较多的一派，则追随社会党温和派领导人切什美季耶夫和卢切夫。社会党右翼在帕斯图霍夫的领导下，从一开始就是反对政府的。佩特科夫和切什美季耶夫暂时仍留在政府中，虽然他们的追随者实际上已组成了反对祖国阵线政府的新党派。
