蒋介石19日函中的两个问题很尖锐，何以在决定停售以后继续出售？何以在美券市值高涨后仍按最初所定低价出售？7月24日，孔祥熙致函蒋介石，试图回答：
（一）关于认购户。孔函说明，发行美金公债历时年余，债券分散各地，不能预计何时到渝，故主管局对于认购各户只能请其待券到后缴款交割，不能责其预缴价款，或交纳一部分定金。后来各地陆续缴到债券，黑市市价虽然略涨，但认购在先，自不应以黑市价涨而不交割，致失国家银行信用。孔称："以今视之，手续诚不无可议，而证以当时情形，实非故意草率可比。"
（二）关于损及国家。孔函说明：当初发行美债，原意在于协助民生经济、生产建设，战后据以购进机器材料，藏富于民。因此，就整个国家言，并无损失。抗战中，中国为美方在华人员垫付过大量经费，需要美方用外汇归还，因此，"必须尽力设法压制外汇黑市之上涨，方属于国有利"。
（三）关于购户。孔函说明：债券发行本属无记名交易，向无记录账册，仅记债券面额款项即可。券款交割之后，承购人在此战时迁徙无常，自难寻找。
（四）关于缴回停售后的余额债券。孔函称：钧命虽限期缴回，但据主管陈复，限于事实，无法奉行。经再三筹虑，反复研讨，都认为"此事处理设有不慎，影响国家信誉过巨"。孔建议，以"停付冻结"的办法"秘密取消"，请蒋考虑决夺。①
孔祥熙的这封信，强词夺理，不仅不承认有任何舞弊行为和任何不当之处，而且还企图证明，以每券二十元的低价出售是为了"压制外汇黑市"，"于国有利"云云。美金公债券由重庆中央银行发往各地销售。因此，孔函所称"债券分散各地，不能预计何时到渝"的情况，只能发生在宣布停售，命令各地将销售余额解送重庆之后。这时，既已停售，何能再次广泛发行，接受认购？此外，孔函并以"限于事实"为理由，拒绝缴回停售后的余额债券。蒋介石接读此函后，决定不能让孔继续担任中央银行总裁了。他在日记中写道："正午，发孔庸之辞中央银行总裁职照准，其遗缺由俞鸿钧补之命令。"以下蒋自涂约16字，当系对孔祥熙的极度愤怒谴责之词。可能事后蒋觉得过于粗鲁，所以又涂掉了。
蒋介石止步停损
7月24日，蒋介石发布命令，准予孔祥熙辞去中央银行总裁一职。同日，又手谕孔祥熙：
该行经办人员办事颟顸，本应严惩。姑念抗战以来努力金融，苦心维持，不无微劳足录。兹既将其经办不合手续之款如数缴还国库，特予从宽议处。准将国库局局长吕咸、业务局局长郭锦坤免职，以示惩戒为要。①
国库局美金公债舞弊案不是"办事颟顸"的问题，蒋介石这样写，是一种大事化小的提法，旨在为以后的进一步调查规定基调。
抗战期间，孔祥熙长期兼任财政部长和中央银行总裁，为从财政上支持抗战做了许多工作，"苦心维持"云云，则是对孔祥熙的抚慰。当时，宋子文很想安排自己的亲信担任中央银行总裁，曾向蒋表示，中央银行总裁必须由自己推荐，否则将不担负行政责任，暗示将不出任行政院长。②但是，蒋介石毫不为之所动。7月25日，蒋介石召宋子文谈话，告以"中央银行总裁人选，非绝对服从余命令，而为余所信任者不可，以此二十年来所得之痛苦经验，因此不能施展我建军、建政，而且阻碍我外交政策莫大也"。孔祥熙在其兼任财政部长和中央银行总裁任内，始终不肯将中央银行的实际存款数字告诉蒋介石，致使蒋在1944年向美方"强制要求"援助，导致中美关系紧张，"几至绝境"。蒋介石想起这一段历史，对孔祥熙更加不满，深悔撤孔不早。日记云："庸人不可与之再共国事矣。撤孔之举，犹嫌太晚矣。"①
与俞鸿钧接任中央银行总裁的同时，宋子文则接任孔的"四联总处"副主席。至此，孔祥熙在国民党党政系统中的重要职务，几乎全部失去。7月28日，蒋介石日记云："免除孔庸之中央银行总裁之职，实为公私兼全与政治经济之成败最大关键也。"所谓"公"，指的是当时国民党和国民政府的统治；所谓"私"，指的是蒋介石本人和孔祥熙之间以及和宋蔼龄、宋美龄的关系。蒋介石要"公私兼全"，自然不可能有彻底的调查和公正的处理。31日，蒋介石日记再云："免除庸之中央银行总裁与改组行政院实为内政重大之改革也。"
