觉华岛一战的结局是明军覆没而后金军全胜。此战，明军损失惨重，明军七千余名、商民七千余丁口都被后金军杀戮，粮草八万余石和船两千余艘都被后金军焚烧，主岛作为明朝关外的后勤基地也被后金军摧毁。于此对应的后金部队却伤亡有限，死亡官兵不过二百六十九名。辽东经略高第在战报上写道：“四营尽溃，都司王锡斧、季士登、吴国勋、姚与贤，艟总王朝臣、张士奇、吴惟进及前、左、后营艟百总俱已阵亡。”总督王之臣查报：“觉华兵将俱死以殉。粮料八万二千余及营房、民舍俱被焚。”同知程维楧报：“虏骑既至，逢人立碎，可怜七八千之将卒，七八千之商民，无一不颠越糜烂者。王鳌，新到之将，骨碎身分；金冠，既死之榇，俱经剖割。囤积粮料，实已尽焚。”
觉华岛一战之后，袁崇焕曾作了一篇《祭觉华岛阵亡兵将文》：
慨自战守乖方，屡失疆土。天子赫然震怒，调南北水陆舟师。谓尔乘船如马，遂调之来，为进取也。据尔等间关远至，岂不欲灭此朝食，一帆而金、复归，再帆而黄龙扫哉！奈未尽其用而敌即来。冱寒之月，冰结舟胶。窘尔之所长，乌得不及于难。说者谓谋之不臧，不臧固不臧矣，然排山倒海之势，以十八万而临数千之水卒，即臧可奈何？而尔等计无复之，愤然以死，略无芥蒂。视当年之弃曳倒奔者加一等也。人之罪，至死而免；人之品，至死而定。今将略尔罪而嘉乃忠。请命于天子，谅为之恤，所以不没汝等者，良有在也。
吁嗟！巨浪茫茫，空山寂寂，皆汝等忠灵之所洒荡也。望故乡以何日，即转劫而无期，苒苒游魂，何不相结为厉，歼仇泄愤？在生之志，藉死以伸，则虽死之日，犹生之年也。尔其勉之！不腆之奠，涕与俱之。尚飨！
在祭文中，袁崇焕刻意强调了敌我双方力量上的悬殊，“以十八万而临数千之水卒”这多少有些不够准确，因为努尔哈赤当时并没有把全部部队都投在觉华岛战场上。但总的来说这篇祭文情真意切，既表达了愤懑的同仇之情，也进一步表达了自己坚守战场的决心，抛开华丽的词句不谈，这份忠勇还是让人非常敬佩的。
宁远大捷是明朝与努尔哈赤正面对敌以来的第一个大胜仗，“辽左铁佛郎机子铳发难，各城望风奔溃，八年来贼始一挫”。八年来头一次打了个胜仗，虽然是守城之战，虽然后勤基地被对手一把火烧了个精光。但战役的结果依然让明帝国的君臣大为高兴。朝野之间对于袁崇焕的赞誉也第一次达到了一个高峰。兵部尚书王永光向皇帝盛赞袁崇焕的功绩言：“辽左发难，各城望风奔溃，八年来贼始一挫，乃知中国有人矣！盖缘道臣袁崇焕平日之恩威有以慑之维之也！不然，何宁远独无夺门之叛民、内应之奸细乎？本官智勇兼全，宜优其职级，一切关外事权，悉以委之。”木匠皇帝朱由校龙颜大悦：“此七八年来所绝无，深足为封疆吐气！”
与明朝的集体亢奋不同，这一战对于努尔哈赤和他新兴的后金帝国来说却充满了灰色的意味，挥兵十余万，他绝不是只想烧了一个觉华岛这么简单，他真正的战略意图在于夺取山海关进而虎视中原。然而天不遂天命汗的愿，六十八岁的老油条努尔哈赤败给了他眼中的小青年、四十三岁的袁崇焕手里。不光没能打下山海关，连宁远都没攻下来。这一仗是努尔哈赤用兵四十四年来最惨的失败。
努尔哈赤败退之后，袁崇焕又遣特使备礼物致谢努尔哈赤说：“老将横行天下久矣，今日见败于小子，岂其数耶！”这种羞辱让努尔哈赤“大怀忿恨而回”。天启六年八月十一日，纵横一生的努尔哈赤在离沈阳四十里的叆鸡堡一病不起，魂丧边疆，终年六十八岁。
宁远一战在表面上看是努尔哈赤战术运用不当，但究其深层原因，却不仅仅这么简单。从天启五年三月女真人定都沈阳开始，努尔哈赤的治国策略就发生了重大的偏移，这主要发生在对待其他民族的态度上。
在努尔哈赤起兵之初，对于汉族民众可以说是恩养有加，从不轻易地滥杀无辜，但进据沈阳之后，他却改变了态度，他开始把汉族人民视为眼中钉、肉中刺，进行了全面血腥的镇压。这样的举动让他丧失了民心，使汉族人民对他的态度大为转变，从开始的依附变为逃亡进而是反抗。天启五年十月，努尔哈赤以汉人众多，不能放心用兵为理由下令在其领地内大杀汉人。这种残酷的民族屠杀政策使辽东的汉族军民对努尔哈赤彻底丧失了信心，纷纷迁往关内，这种迁徙直接导致大批土地荒芜，后金的后勤保障出现了巨大的缺口。同时更为可怕的是，大批辽东居民加入了反抗努尔哈赤暴政的行列之中，举家投入了明政府保卫辽东的军队。除了大肆捕杀普通百姓之外，努尔哈赤对汉族官员也采取了极不信任的态度，在他起兵之初，曾任用了不少汉族官员，但随着后金与明政府进入正面冲突之后，他开始时刻防备这些对自己忠心耿耿的异族人。而如果我们仔细地分析当时东北的情况，就可以发现，在努尔哈赤起兵之初，汉族和女真人及蒙古人并没有太大的隔阂，在当地三个民族很大程度上处于一个融合的过程。在这个过程中对于普通百姓来说，民族差异不是最关键的因素，生存才是最关键的。努尔哈赤的“防汉”政策，不光让他走到了汉族政权的对立面，也让他逐渐走到了汉族民众的对立面。这种民族仇恨一旦形成就很难消解，直到近代满清政权灭亡时，国父孙中山的口号也是“驱除鞑虏”，由此可见，民族之间的矛盾是多么的恐怖。
