1935年的一天，瞿独伊正和一批小朋友在乌克兰的聂伯河彼特罗夫斯克参观。忽然，在“共青团真理报”上，看到了父亲瞿秋白牺牲的消息，她惊呆了，随即失声痛哭地晕了过去……独伊被救醒后，脑子里回荡着父亲的身影。那是5年前，因为中国革命的需要，父母秘密取道欧洲回国工作。不料那次分别，竟然成了和父亲的永诀。就是那一年的8月1日，父母从柏林给她寄来一封信和一张含义深切的明信片，明信片上有一束美丽的“勿忘我”花，封面左下侧写着“独伊”，背面用俄文写着：“送给独伊。妈妈，1930年8月l日，克里米亚。”但独伊能够看得出，明信片上的俄、中文都是父亲的笔迹。父母写给她的为数不多的信件几乎都已散失，唯独这张明信片保存至今。她从这张小小的明信片上，时时看到父亲的身影，是父亲留给她的一件最珍贵的纪念品。
瞿秋白牺牲后，杨之华于1935年第二次来苏联，参加共产国际第七次代表大会。会后，她留在莫斯科任国际儿童红色救济会中国代表。当杨之华来到国际儿童院看望独伊时，许多中国孩子跑过来包围了她，大家都亲切地喊她“妈妈”，问她各自父母在国内的情况。杨之华妈妈含着激动的眼泪，把她所知道的情况一一告诉孩子们。直到晚上，杨之华才抽出时间，把瞿秋白牺牲的详细情况告诉了女儿，母女俩边说边哭边回忆那些令人终生不能忘怀的往事。
1941年6月22日，苏德战争爆发后，我党在苏联的干部陆续分批回国。这一年的9月，瞿独伊随母亲等一行5人回国到达新疆时，因回延安的路已被切断，只好暂住在新疆八路军办事处。当时留在新疆的同志有三部分：一是军阀盛世才从延安请来在新疆各部门帮助工作的同志；二是由苏联教官训练的红军航空队员；三是从苏联回国路经新疆的同志和部分在新疆养病的红军伤残人员。
盛世才错误地估计了苏德战争的形势，撕掉了他亲苏亲共的假面具，完全投靠了国民党，并把我党在新疆的三部分同志150余人分别软禁起来。之后，他们又分别逮捕了陈潭秋、毛泽民等人，随即逮捕了妇女、孩子及伤病人员。瞿独伊和妈妈一起被捕后，先把她们转到女子被服厂，强迫她们做工，遭到集体拒绝后，就把她们全部关进迪化市第四监狱。瞿独伊在这里度过了近四年的监狱生活。
