崔军赶到位于重庆市长寿县附近的狮子滩，那是龙溪河四级梯级电站的龙头工程。这个电站并不大，但是“一五”计划中巧6项重点工程之一。新中国刚建立，到处都在搞建设，水泥很紧张，狮子滩也不例外。崔军发现当地山上的条石很多，他想，如果利用条石砌盖厂房的上半部分，岂不可以节约许多水泥？他的建议厅很快就被采纳了。
传统的拼装尾水管的办法是，先在后方将一个尾水管做成两半，然后拖运到工地上去。这东西又大又重，拼起来后要用吊机起吊。狮子滩没有吊机，只好用土卷扬机拖，费时又费力。崔军说：“为什么不到现场一次安装成功？那样做不是又省时又省力吗？”
“这个……以往都是这么干的，从来没有到现场安装过。”老师傅们回答。
“如果把材料直接运到工地，在现场一次拼装成功多好，那会省去许多麻烦。至于说以往没千过，这次干一下，以后不就干过了？”
“对，对，”来自丰满电站的老师傅杨宗培高兴地说：“崔主任的意见太好了！我干了这么多年，只是照搬老方法，怎么就想不到呢？我们马上照办！”就这样，一项新的施工法― 尾水管现场安装法诞生了。这种简化工序、节约用料、提高工效的尾水管拼装法，电站至今仍使用着。
1974年，陕西省委第一书记李瑞山到石门电站视察，发现工区到处贴的都是打倒崔军的大字报，就问陪同他前来的地委书记：“这个崔军是什么人？怎么这么多大字报？”
“他是个技术干部，到苏联留过学，听说是‘4821’成员之一。”
李瑞山知道“4821”就是指那21名留学生，就又问：“崔军的父亲是谁？叹“崔田夫，陕北革命领导人之一。崔军是他的长子。”
李瑞山听后没有作声。他是崔田夫的老部下，非常了解和敬重这位老首长。
老首长的儿子在自己管辖之内遭了难，自己有义务和责任加以保护。
李瑞山经过了解，崔军除了“4821”外没有其他问题，是属于水电部的干部，看来在原单位已无法继续工作，就把他调到陕西省水电局任副总工程师兼工程处处长。
其实，水电部领导也十分器重这批留苏学生，只是在“文化大革命”中，部领导也没有办法，只好同意把崔军调到陕西暂避一时。
1975年，基建工程兵在北京成立水电部队办公室，简称“兵办”。经过十年内乱，许多权威都被打倒了，技术职称也被取消。水电部只有几个人还保留“工程师”职称，贺毅还是工程师。就调他到水电部队“兵办”任生产组长。
这年7月，崔军也被借调到“兵办”帮助工作，住在潘家口工地，主要任务是在施工技术和组织施工方面做咨询工作和调查研究工作。
这支水电部队的前身是水电部四川水力发电工程局，也就是崔军在四川时的狮子滩工程局。1966年8月奉命改编为基建工程兵水电部队第61支队。当时“兵办”主任是朱国华。第61支队党委书记也由他兼任。
崔军一接触部队，便感到担子不轻。但在困难面前他决心上靠党的领导，下靠官兵群策群力，竭尽全力做好工作。他到部队不久，就给部队提出了几项建设性意见。
潘家口原有座坝后桥，又窄又短，汽车通过时没法错车。车子又多，行人穿来过去很危险。崔军提出了将坝后桥“加宽、加长、加高”的具体方案，部队采纳后，从而解决了车辆、行人的过渡和大件运输问题。他接着又建议，从黄石哨砂石场到大坝岸拌和楼重修一条公路。这两地虽不到两公里，但原有的公路弯弯曲曲很不好走。在大浇筑时，骨料运输任务繁重，重修一条直路，使用皮带运输机输送骨料，就可省时省力，提高功效、节省开支。部队又立刻采纳了他的建议。
崔军为部队提了两条看起来不起眼儿的建议，结果在官兵中名声大振，在工地上产生了轰动效应。官兵们说：“毕竟是留苏的，一到工地就看出了问题，一张嘴就是个好点子、大点子。”“那还用说？人家本来就是水电专家嘛！”
1979年10月4日，上级正式任命崔军担任水电指挥部副参谋长，他仍然负责工程技术管理工作，但不光是第61支队了，所有的水电部队，都要去管。
1980年7月，崔军到了江西万安的第63支队。万安电站是江西省的第一大电站，总装机容量50万千瓦，电站坝址就在惶恐滩心。惶恐滩是十八滩最后一个锁口大滩，激流汹涌，历来被船只视为畏途。大文豪苏东坡和民族英雄文天祥船行至此，都惶恐不已，以致吟出“地名惶恐泣孤臣”和“未到滩头惶恐声”那样的千古绝唱。崔军视察第63支队后，感到部队营房的布局不合理。支队机关设在县城边上，几个大队和修配厂都建到了山上，而且七零八落非常分散。
“怎么能这样乱盖营房呢？如果把这些基本建设规划在一起，不就可以为万安县建设一条街嘛！现在这种建法，电站修好部队撤走后，那山上的房屋和其他基本设施还有什么用？”
支队领导说：“这个问题当年修建时曾向县里领导提出过，无奈县长没有那个远见，没办法才上山的。”
崔军听后说：“原来如此，不拿枪的县长，把拿枪的师长赶到了山上。”
说得大家都笑了。
崔军喃喃地说：“还是我们没有把道理讲清楚，造成了这种浪费，这很费的是人民的血汗钱呐！”
国务院、中央军委决定：从1985年1月1日起，水电部队正式转人中国人民武装警察部队序列，正式改编为中国人民武装警察部队水电指挥部，简称“水指”。确保了部队的稳定和工作的连续性。这年3月，崔军被任命为“水指”副主任兼参谋长，分管万安工程。
万安水电站的大围堰施工进人高潮，崔军亲临坐镇指挥。为了加速大围堰合龙的速度，连部队的退役老战士、放假的学生和临时来队探亲的家属都上了工地。
11月3日，截流的日子到了。围堰工地上红旗招展，人如潮涌，车似流水。经过这些天的奋战，围堰合龙口还有80米宽了。原本300多米宽的河道，一下子缩小到几十米，流速自然增快。到规定的合龙时间了，截流总指挥一声令下，早就等在那里的电铲、吊机、装载机挥动巨臂，50多辆大型自卸车往来穿梭，一个劲向江心的合龙口抛掷石渣，一车车排成队的“小山”倒进龙口，激起一阵阵飞溅的浪花。龙口缩得越来越小……
下午5点18分，万安水电站大围堰胜利截流。
1989年元月，国务院、中央军委肝贺毅、崔军“少将”警衔。
1989年9月，中央政治局决议，要上西藏的羊湖电站。这是震惊中外的“世界屋脊”工程。当任务下达到武警水电部队时，贺毅主任正在生病住院，马上在医院召开“水指”党委扩大会议，在确保天生桥、潘家口、万安三个水电站建设的情况下，抽调骨干力量和精良装备前往建设羊期水电站。会后崔军带领先头部队二次上羊湖……
