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松山城的战略位置十分重要，它处于锦、杏之间，为“宁（远）、锦（州）咽喉”，“关系最要”。如果松山城一破，“全局动摇”《明军守卫松山等城堡的六件战报》，载《历史档案》1981年2期。。因此松山成为双方会战争夺的焦点。太宗抵达松山后，将大军安置在松山、杏山之间，自乌欣河南山至海边，横截大路。绵亘扎营。第二天，八月二十日，清军自锦州至南海角掘三道大壕，各深八尺，宽丈余，把松山明军统统置于包围之中，并断绝了松山、杏山之间的通道，从而切断了明军的粮饷供应。同时，太宗派阿济格率军攻击塔山，夺取了明军在笔架山储备的粮食十二堆。二十一日，明兵向清军镶红旗营地发起攻击，太宗率数人，张开黄盖，往来指挥、布阵，明军望见，仓皇败退。太宗指示诸将回营，说：今夜敌军必逃。于是他一一布置兵力准备截杀。
果不出太宗所料，清军掘壕筑垣，断粮道，引起明军将士一片恐慌，人人都有逃跑之心。他们携带的军粮不足三天食用，眼看就要陷入绝境。在这危险的时刻，洪承畴于当日晚，要求诸将拼力一战。“解围在此一举”，但诸将意见很不一致，有的主张明日战，有的说今晚战，有的认为应缓战。严重的问题是缺粮，都想回到宁远得到给养后再战。陈新甲派来的心腹张若麒也同意回宁远支粮。洪承畴说：“虽粮尽被围，应明告吏卒：守亦死，不战亦死，如战或可死中求生。不佞（洪谦称）决意孤注，明日望诸君悉力。”《国榷》，卷97。谁知会议刚开完，胆小如鼠的王朴乘天黑先自逃遁，而各将帅也跟着争相驰逃，沿海岸奔杏山，马步兵大乱，自相蹂践，弓甲遍野。
早已严阵以待的清军从后面追击掩杀，事先埋伏在塔山、杏山等地的清军又在前面迎头痛击；太宗还派出数支清军分别到小凌河口西直抵海，绝其归路。到第二天黎明，只见“明兵窜走，弥山遍野，自杏山以南，沿海至塔山一路，赴海死者，不可胜计。”《清太宗实录》，卷57，25页。以上参见王一元《辽左见闻录》。吴三桂、王朴、白广恩、唐通、马科等及六镇残兵都溃入杏山城，张若麒从小凌河口乘船由海上逃走宁远。剩下曹变蛟、王廷臣两总兵和辽东巡抚丘民仰没有逃，撤入松山城，与洪承畴同守孤城。
太宗料杏山明兵必奔宁远，又遣精兵分别埋伏在高桥大路和桑噶尔寨堡，这是必经之地，所以在这里杀伤了大量逃离杏山的明兵。太宗又亲自来到高桥，指示多罗贝勒多铎率军继续设伏兵。二十六日，吴三桂、王朴等率残军出杏山，逃向宁远，遭清伏兵掩杀，两人仅以身免，短短几天工夫，歼灭明兵五万三千七百八十三人，获马七千四百四十四匹、骆驼六十六峰，甲胄九千三百四十六副。“明兵自杏山，南至塔山，赴海死者甚众，所弃马匹甲胄以数万计，海中浮尸漂荡，多如雁鹜。”《清太宗实录》，卷57，29页。
但是，这场战役还没有最后结束。明兵主帅洪承畴还有万余人同他坚守松山城。太宗已移营松山近前，缩小包围，再掘壕以困之。松山城地形是四周缘高，中间偏低，其状如一个大锅，城就建在锅底部的一块台地上，据说因北面有一松山，故取城名松山。从现存的遗址看，它是宽长各约三百多米的一座方城，城墙也不算高厚。太宗仍然围而不攻，静待城内粮尽援绝。九月，因宸妃病重，太宗离松山，返回盛京，从此他就再没有回前线。围松、锦的军务全委给杜度、多铎、阿济格、阿巴泰等诸王贝勒。到第二年（崇德七年）二月，守松山副将夏成德降清，做内应，于十八日夜引清兵登城，第二天擒获总督洪承畴。至今，据当地百姓传说，在南城冈有洪乘马逃跑时“马失前蹄处”，洪因马绊倒而被捉，其余诸将官曹变蛟、丘民仰、王廷臣等都被俘，不屈而死。后根据太宗的命令，“萨穆什喀率领步兵将松山城毁如平地”。《明清史料》，丙编第一本。松山一破，锦州军心瓦解，“城内粮尽，人相食，战守计穷”，《东华录》，崇德七年三月。朝廷无力救援，三月八日，迫于无计可施，献城投降。围锦州整整用了一年多的时间，终于不战而克。清兵进城后，“屠戮城中人民”，各家财物被清兵“收取一空”《明清史料》，丙编第一本。。接着，四月九日，清军用红衣炮轰开塔山，歼城内明兵七千。二十一日，炮轰杏山城，明将开门请降，收降人口六千八百余。从此，关外四座重要城堡已全部落入清军掌握之中。
太宗指令将祖大寿、洪承畴带到盛京。祖大寿背弃大凌河誓言，许多大臣将领要求处死他，但太宗不改初衷，耐心等待了他十余年，使祖大寿深为感动，诚心诚意投降了清朝。而说降洪承畴却是费了不少口舌。起初，他坚决不降，还骂不绝口。太宗派范文程劝降，他还是骂，文程仍善言安抚，并与他谈论古今事，恰巧房梁有积尘落到洪的襟袖上，他几次轻轻将尘拂去。文程回来报告说：承畴不会死的，他如此爱惜衣服，更何况对自己的生命呢！后轮番派文臣去劝说，洪也不答一句话。于是，太宗亲自到洪住的地方去看望，脱下自己身上的貂裘给他穿，慢慢说道：“先生不会感到冷吧？”洪茫然望着太宗，看了许久，叹了一声：“真命世之主也！”这才叩头请降。太宗高兴得不得了，当天就赏赐他很多东西，在宫中陈百戏以示庆贺。诸将很不高兴，都觉得优待过分，说：“洪承畴是被捉的一名囚犯，皇上为何待他这样优厚？”太宗说：“我们这些人栉风沐雨，究竟为了什么？”大家说：“想得中原呵！”太宗笑了，说：“比如行人，你们都是瞎子，现在得到一个引路的，我怎么不快乐呢！”众将听到这里，都心悦诚服《啸亭杂录》，卷1、卷8。。
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