从此，华佗开始对臭麻子花进行试验，他先尝叶，后尝花，然后再尝果根。经过实践证明，臭麻子果麻醉的效果很好。华佗到处走访了许多医生，收集了一些有麻醉作用的药物，经过多次不同配方的炮制，终于把麻醉药试制成功。他又把麻醉药和热酒配制，麻醉效果更好。于是，华佗将这种麻醉药命名为麻沸散。
华佗曾利用麻沸散为关羽疗过伤。关羽在樊城一战中，右臂被毒箭射中，而且箭毒已渗入骨头，整个右臂也已青肿，不能活动。关公为了不贻误战机，不肯撤至荆州休息。全军将士正在为这件事着急时，华佗来到中军帐前，愿为关公治病，在看过伤势之后，华佗决定立刻进行手术，可又担心关公受不了疼痛。关公笑道："吾视死如归，有何惧哉？"关公喝完几杯酒，一面与马良下棋，一面伸出右臂让医生进行手术。华佗用一把锋利的刀将皮肉割开，见到箭毒果真已渗入骨头，就用刀在骨头上刮箭毒，悉悉作声。箭毒刮干净后，敷上药，用线再将皮肉缝好，顺利结束了手术。又过了些日子，关公的箭伤就痊愈了。关羽的大将风度和英雄气概在刮骨疗毒这件事上得到了充分的体现。人们大概不会想到刮骨疗毒手术所引起的疼痛竟是微乎其微的，因为华佗在手术前已经使用了麻沸散局部麻醉。
还有一次，一名船夫来找华佗看病。这个船夫的肚子痛得非常厉害，华佗经过诊断，认为问题出在脾上，而且他的脾脏可能已经烂掉了一半，必须尽早割掉，船夫同意了。华佗拿出一包麻沸散，让船夫和在酒里喝下去。过了一会儿，船夫像喝醉了似的昏昏沉沉地睡了过去。华佗拿出手术刀，迅速地把船夫的肚皮剖开，看到果然是脾脏烂了一大块。华佗敏捷地把烂脾切下来，止了血，又迅速地把船夫的肚皮缝合好，在伤口上涂上生肌收口的药膏。船夫醒来以后，肚子不再疼痛难忍了。华佗又给船夫开了些药，经过大约一个月左右的服药、调养，伤口渐渐愈合，肚子也不痛了。
麻沸散是世界医学史上最早记载的麻醉药品。欧洲人发明麻醉药，则是19世纪中期的事情了。1842年，法国人黑克曼开始用二氧化碳作为麻醉药，可这二氧化碳只能用来麻醉动物，在人身上不能用。1844年，美国人柯尔顿用一氧化二氮（也就是笑气）作为麻醉药，效果也不理想，直到1848年，从美国人莫尔开始使用乙醚来做麻醉药。现在的西医动手术前，仍会使用乙醚来麻醉全身，西医所用麻醉药至少比华佗晚了1600年左右，可见华佗不仅仅是外科医学的鼻祖，也是药物麻醉的先驱。
编制五禽戏
华佗治病的故事流传很广，他的医术也得到了大家的认可。广陵太守陈登感觉胸中烦闷，不想吃饭。华佗诊脉后说："你胃里有病，是吃了过多的生腥物所致。"立即为陈登煎了汤药，服下之后不久，陈登果然吐出了许多未消化的生鱼，感觉立刻好了。华佗说："此病三年后还会复发，遇上良医可救你。"三年过后，陈登旧病复发，不巧华佗外出，陈登不治而亡。
一次华佗走在路上，见到一个感觉咽喉堵塞不能进食的患者，华佗对他说："我来的路边上有家卖面条的，你到那要三升蒜泥醋汁喝下去病就会好。"患者照样做了，果然吐出一条大虫子。为了表示感谢，患者把虫子挂在车边到华佗家拜访。华佗还没回家，他的小孩在门前玩耍，孩子们说："看这客人挂在车边上的东西，一定是父亲的病人。"等到进房门一看，原来北边墙上挂着十几条虫子。
还有一名叫李成的军吏，久咳不止，不能躺卧，还不时吐脓血。华佗诊视后说："你的病源在肠，吐的脓血不是从肺中来的。给你两钱药末服下后会吐出两升多脓血，好好注意保养，一月左右就能有起色，一年过去就能恢复健康。但是这病18年后还会小发作一次，吃了相同的药就能治好，否则就会丧命。"又给了李成二钱药末。过了五六年，李成的亲戚得了相同的病，找李成索取华佗给的药。李成不愿给，亲戚说："你现在很健壮，我却病得要死，你就忍心拿着能救命的药眼睁睁看着人死吗？先借给我，等我病好了一定再去找华佗为你要一剂来。"李成无奈只好把药送给他。但是等李成再去谯县时，华佗被关在监牢里，李成不忍心去打扰，没取到药。18年后，李成病发无药可治，最终还是病死了。
