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努尔哈赤对这件事十分恼恨，在很长一段时间之内，这位汗王都没有笑脸，以后，努尔哈赤对汉族人更加不信任了。
在萨尔浒一战之后，明朝四路出师，三路被歼，一路逃跑，辱国丧师，辽东告警。
京城里文武大官一片惊慌，以吏部尚书赵焕为首的大臣，一齐来到文华门跪请万历皇帝出宫，共议辽东战守计策。
可是，万历皇帝沉迷于淫乐声色之中，坚持不上朝，不问国事，急得群臣捶胸顿足，呼天号地，从清晨一直跪到傍晚。万历皇帝这才好不容易来到文华殿听政，接受群臣追究丧师辱国的责任，一致请求严惩主帅杨镐、总兵李如柏。
于是，万历准奏，下令处死杨镐；怎奈此公命大，关在狱中七、八年，方被处决。连皇帝的命令都拒不执行，可见明廷中胆大枉法之徒，何其狂悖！不过，李如柏到底胆小，未等皇帝命死，他就畏罪自杀了。
处理了这两个罪魁祸首之后，算是找对了替罪羊，文武大臣总算出了一口胸中的恶气。
为了收拾辽东惨败后的残破局势，在群臣促议之下，一致推荐起用原任御史熊廷弼为大理寺丞兼河南道御史，定慰辽东。
这熊廷弼，字飞百，是湖北江爰（今武昌）人。万历二十六年（１５９８年）中进士，以后担任御史、兵部侍郎。
此人身高七尺，有文才武略，能左右开弓射箭，有胆知兵，刚直不阿，作风雷厉风行，严明有声。辽东百姓对熊廷弼十分信任，把他当作神人一样的敬奉。
明神宗万历皇帝接受大臣建议，于闰年六月二十二日，又提升熊廷弼为兵部右侍郎兼右佥都御史，经略辽东，主持辽东军事，并赐给尚方宝剑，准他先斩后奏。
熊廷弼奉了朝命，不敢怠慢，第二天就点齐了兵马，校阅了一遍，他发现兵器朽蚀，兵马衰弱、甲胄蛀坏、军旗腐烂，心中不免叹息。到了七月初七日，熊廷弼还未到任，又传来开原城失守的消息，局势变得异常严重。
熊廷弼决定这一次出兵，一定要把朝廷失去的面子重新争回来，让天朝的威风再次得到展现。熊廷弼连夜写了一本奏章，呈给万历皇上，心才安下来。
刚睡下不久，天已五更时候，遂穿衣起床，带了十八万人马，匆匆向山海关进发。
这位有胆有识的熊廷弼，在他这套以防御为主体的作战计划里，说得言辞恳切，情感真挚，既有聪睿，又有忠心。
可是，这份奏章却落在了太监手里，不送给万历皇上看，被作为垃圾处理了。
熊廷弼领着兵马，一路上辛辛苦苦，风餐露宿，由于他对待士兵温厚和气，常常嘘寒问暖，丝毫没有做官当老爷的架子，以致赢得士兵们的信赖，即使辛苦，也无怨言，都说熊经略“爱兵如子”。
队伍刚出山海关，探马又送来努尔哈赤占领铁岭的消息。
熊廷弼忧心如焚，立即催马疾进，日夜兼程，眼看沿途逃难的百姓，扶老携幼，哭爹喊娘，凄凄惨惨，十分可怜。那些逃难的百姓，一听说皇上派天兵来了，都虔诚地跪在路旁，请求救助。此情此景，熊廷弼见了，在马上再也坐不住了，急忙跳下马来，用好话去抚慰他们，劝他们重新回到沈阳去。
难民们见到这位巡抚能体恤民情，十分高兴，便随军前行，各自返回家园，甚至开小差的逃兵，也折回头重新返回营地。
七月二十九日，熊廷弼的兵马到达明朝在辽东的治所——辽阳，展现在他面前的，是一幅残破凋敝的画面。
他先到驻军处一看，其零落不整，腐败不堪的情景，犹如一群讨饭花子，哪像是军队？
次日，熊廷弼委任李怀信为辽东总兵官，命令他抓紧整治军队，不得有半点拖延，如有违命者，立刻斩首。
为了整肃军纪军风，将那些故意怠慢不进、临阵脱逃的将领、逃兵带来。这些人跪在熊廷弼面前，张口结舌，无话可说。熊廷弼一见，火冒三丈，那些人吓得一个个两腿乱颤，有的哀求饶命，有的推委责任，熊廷弼一听，怒上加怒，请出尚方宝剑，一声断喝：“拉出去，砍了！”
接着，熊廷弼又以辽东经略的名义颁发了几张布告，晓谕百姓们安心生产，照常经营，不必惊慌。若有私造谣言，扰乱人心的，一经查到，立刻严惩不贷！
经过这次整治，满城军民，人人慑服，个个感恩，人心大快，混乱局面大有改观。
但军需将官陈伦贪污军饷，致使军库房无兵器、粮库无粮，马房无草料，严重影响了军队作战。
这陈伦原是总兵府里一个下级军官，只是因为他有一个长得俏丽的妹妹，被杨镐相中了，娶作他的第七房姨太太，杨镐提升他为军需官。陈伦依仗杨镐权势，贪污军饷，克扣钱粮，连马料也送到街上出售，弄得议论纷纷。如今杨镐出事了，他还恶习不改，大家实在气愤不过，才到熊廷弼处告发他。
陈伦抵赖不掉，只得如实招供。熊廷弼将其拉去砍头示众了。
熊廷弼来到辽东，通过一系列措施尤其是整顿了军纪，抓住了根本，得了民心，更得了军心，赢得了一片叫好声。
为了防备努尔哈赤对辽沈用兵，熊廷弼亲自到校场训练兵马，日日操练；制造战车火炮，修理火器；对沈阳、辽阳的城墙加固，并在城外挖掘深沟壕堑，放入河水，使后金骑兵无法靠近城墙。
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