获悉中美之间的谈判顺利结束，正在土耳其进行访问的克林顿总统发表讲话说，他对协议的签署表示高兴，这是美中关系发展进程中意义深远的一步，签署协议为中国加入世贸组织扫清了道路，对美国、中国以及世界经济均有益。他还保证立即着手实行协议中美国的最重要承诺：促使国会批准给予中国永久性正常贸易待遇。[75]15日，巴尔舍夫斯基和斯帕林发表联合声明说：“经过13年的谈判，中国和美国终于就中国加入世贸组织达成了有力的、商业上可行的协议，对此我们倍感喜悦。这个具有历史意义的协议，有利于美国的出口业，有利于中国的经济改革，有利于全球贸易体系，有利于美中两国的长期关系。”[76]在15日的记者招待会上巴尔舍夫斯基还表示，这一协议的签订“会有助于以最本质的方式稳定美国与中国之间的关系”。在这一基础上，“其他美好的事物会显现出来，两国间全面关系的状况也将更加稳定”。[77]
在两国关系复归正常的同时，中美双方于12月16日就中国驻贝尔格莱德使馆赔偿问题达成了协议。根据协议，美方将向中方支付2800万美元，作为对中国使馆财产损失的赔偿；中方将赔偿美方287万美元，以支付美方轰炸引发的中国人民反美示威中损坏的美国驻华使领馆建筑。[78]
1999年对于中美关系是极不平凡、甚至是惊心动魄的一年。这一年在中美关系中上演了令人大悲大喜的活剧。“炸馆”使中美关系跌入低谷，比1989年和1995年更低的低谷，北京等一些地方爆发的大规模抗议示威以及对美国使馆采取的做法，甚至使一些美国人联想到一个世纪前的义和团。这就突出说明了中美两国关系的战略基础仍然薄弱，两国之间仍然缺乏互信。但这场危机没有持续多久。台湾的李登辉机关算尽，本来想乘着中美关系恶化之机捞取好处，不曾想却帮了中美关系的忙，帮助了两国恢复关系。年底两国关于中国入世的双边协议的达成，结束了长达13年的马拉松式谈判，对中美关系又是一个大的促进。这又说明，中美两国之间确实有着难舍难分的共同利益。经过这一年的反反复复，人们会对中美关系的复杂性有更进一步的认识。
