始皇正坐在软榻上，见他进来施礼，青白的脸上露出一丝冷笑，说:
“今天的宴会上丞相也听见了，这些儒生自恃读过圣贤之书，是何等的狂妄!他们眼里根本就没有朕和大秦律法的威严。朕现在完全可以想像到他们在各地是如何以古制诽谤当今、鼓惑黔首。有他们在，大秦的天下，一天也不能安稳。”
李斯正被儒生们奚落得一肚子气无处发泄，见始皇动了怒气，便恨声道:
“臣也觉得这帮儒生着实可恨。陛下可命廷尉治他们一个诽谤朝廷、以下犯上之罪，问一个斩刑，将他们斩草除根。”不料，始皇冷哼一声说:
“亏你还是我大秦的丞相。这件事如果能这么简单地处理了，朕用得着召你来吗?”李斯忙说:
“臣一时糊涂，不明主意，请陛下明示。”
“六百名儒生可杀，却杀不尽天下儒生。在黔首的眼里，他们是无所不知的圣人，至少是圣人的传人——贤人。他们说的话，黔首相信。为什么?因为他们读过所谓圣贤之书。正本清源，该治罪的是那些所谓的圣贤之书。它们才是威胁我大秦安定的罪魁祸首。李斯，你是丞相，该知道怎么做了。”李斯面露惊异之色，说:
“陛下之见正与臣不谋而合。对付这些儒生，臣早有思想准备，明日就写奏章上奏。”始皇信任地说:
“以丞相之才，朕相信明日的奏章一定又是惊世之作。”
李斯回府后，当晚挑灯夜战，秉笔直书，一篇洋洋洒洒近万言的上书在第二天的早朝前送到始皇的御案上。
始皇深知，当年李斯以一篇《谏逐客书》使自己收回驱逐秦国客卿的成命，从而扬名天下。今天的这份奏章一定也是惊世之作。他打开细看，果不其然，但见奏曰:
五帝不相互重复，三代不相互因袭，各自都把天下治理得很好，而不是很差，这是因时代和形势发生变化的缘故。今陛下立大业，建万世之功，当然不是那些迂庸的儒生所能理解的。况且，淳于越所说的夏商周三代的事，有什么值得效法的?当年，诸侯并上，相互争雄，所以才用重金根致游学的人士，为自己出谋划策。今日，天下已经平安，法令出于一流，百姓当家，则致力于农工本业，士人则习学律法。今儒生不学习当今，而效法远古，用来非难现实，鼓惑百姓。臣李斯冒死上言:
古时天下分散混乱，未能统一，所以诸侯并起，在舆论上都是称道往古而非难当今，粉饰空言而扰乱实际，而人们又往往以为他们和下所学的这些理论为圣贤之论，并以此来非难圣上所建树的宏图大业。今陛下已兼有天下，判别是非而尊立一帝;而那些禀录私学的人，却相互勾结来非难以法为教的制度，闻知有法令颁行，便用他们那套和学来妄加评论。入室则内心不满、出家则街头巷议，以非难主上为名望，以标新立异为高明，煽动门徒群起造谣诽谤。这种状况如不加以制止，对上则陈低主上的权势，不则使这些人形成觉羽。必须严加禁止，以利于国。臣李斯请求:
一、史宦所收藏的历代史书，除秦国的史书《秦记》外，其他一律焚烧;
二、除博士官因职务上的关系外，天下其他人有收藏《诗》、《书》以及诸子百家著作的，一律要送交所在郡将、郡尉处焚烧;
三、有敢于相互谈论《诗》、《书》的，处以弃市（闹市处死）的刑罚;
四、有敢于以古非今者，诛杀全族;
五、各级官员有“见知而不举者”，与违犯此项法令者同罪论处;
六、此项法令下达后，期满三十天而不焚烧所藏禁书的人，则处以面部刺字并罚作四年劳役的刑罚;七、凡属医药、入筮、种树方面的书籍可以收藏如故，不必焚烧;
八、如果有想学法律的人，可以到官府向负责普及法律知识的人请教，以吏为师。
李斯的这份上书在驳斥了淳于越的同时，一并提出了他起草的具有八条律文的《焚书令》。始皇一直为儒生非议国政的事耿耿于怀，李斯揣摸圣意，这份上书可谓雪中送炭，令他万分满意。“明主之国，无书简之文，以法为教;无先王之语，以吏为师。”始皇看完李斯的上书，想起韩非当年在《王蠹》篇中的这几句话，表达对李斯所见的赞同之意。但是，焚烧天下《诗》、《书》史篇，毕竟不是一件小事，他完全能够想像到朝臣们对这份奏章的非议。所以，早朝时，始皇没有把它交付廷议，而是在散朝后，把蒙毅、冯去疾等主要大臣召见到南书房，公开了李斯的上书。冯去疾、蒙毅一听，吓了一大跳，直觉告诉他们，李斯肯定哪根筋出了毛病，否则怎么写出这样的上书呢?冯去疾不加思索地说:“陛下，焚烧古籍的事千万做不得!真要做了，陛下会让天下人遗憾的!”他的言外之意很明白，始皇真要做，一定会留下千古骂名。
蒙毅也表示坚决反对。
“矫枉无须过正。昨天的宴会上，儒生们的确冒犯了陛下和大秦的尊严，臣也是看不下去。但是，陛下不能因为几个狂妄的儒生而焚烧天下古籍。”始皇见这两位平时最听话的宠臣都表示坚决反对，皱眉说:“朕也是委决不下，才召你们来商量。李斯之言也对，让儒生们这样煽动下去，黔首跟着盲从下去，最后会损伤朕的威严，动摇国基!”
冯去疾见皇帝还是偏信李斯，劝谏说:
“凡事都有源头，没有古哪来今?诸子百家有如河川支流，汇成大海，学术思想没有源头，很快就会干涸而死。”始皇反驳说:
“可是，杨朱说过，岔路多了羊会走失，学说多了，会让黔首无所适应，不利于国家稳定。如今，天下统一了，法令出于一统，学术思想也应该统一，这样才能使天下长治久安不乱。”蒙毅摇头说:
“天下可以统一，学术思想却不能统一，人各有志，各有各的想法，说出来方能集思广益，相互补充，为治国者提供最佳的治理方案。单纯使用武力只能适得其反。防民之口甚于防川啊!”始皇对两人的态度大为不满。
“朕以为大秦的法令和制度是最完美的，不然怎么会很快统一天下，富国强兵。朕的作为也非三皇五帝可比，不然不会有这样一个真正统一的秦帝国。可是那些愚儒者和无知的黔首却怀念古制，以古非今非难朕。”
冯去疾、蒙毅不敢再劝。始皇越说越气。
“昨天的宴会上你们都听到了。有人攻击大秦的国家制度;有人在批评朕刚愎自用，不守祖制，不肯效法古人。可是他们不知道这是朕最公正之处。朕不分封子弟，乃是亲眼看见诸侯一多，战乱不息。中原争战，几百年的战祸难道不是血的教训吗?天下一统，天下人心往一处想，劲往一处使，没有做不好的事。可是那些愚儒只知道穷研古制，就是不肯睁开眼睛看看现实。”冯去疾、蒙毅正不知所措，忽然，始皇的一名近侍奔跑进来，禀报说:
“启禀陛下，朝门外聚集很多儒生和百姓，说是要陛下亲自去接见，郎中大人怎么劝他们也不肯离开。”始皇闻听，脸上怒意全逝，含笑道:
“这些人是何等的狂妄!冯卿、蒙卿，你们陪朕去看看，这可是大秦从没发生过的新鲜事。”
