尽管山本的计划直到开战前35天时才被日本最高军事当局批准，但早在4月份山本就命令部队开始进行作战准备了。
1941年5月27日，日本洋溢在旗帜的海洋之中。因为这一天是日本的海军节，又是日本取得对马海战胜利的纪念日。当日，日本海军在四国岛西南海岸的宿毛湾里，进行了鱼雷和其他轰炸技术的表演，以检验前一个时期训练的成果。
被称作“三寸不烂之舌”的海军发言人平出英夫海军上校，当天晚上在东京无线电广播电台中极度兴奋地声称
：“海军航空部队现在约有4000架飞机，经常进行特殊的战斗训练”，“我们可以坚相信，海军目前已做好了充分的准备，随时可以在转瞬间粉碎任何敢于向日本挑战的敌人。天皇陛下的海军航空部队……现在可以制订使任何国家立即灭亡的策略。”
到5月底，第1航空舰队司令官南云中将的飞行员们已艰苦训练了很长时间。针对前一段时间的训练情况，南云下发了一份有关训练达标要求的冗长的文件。这份文件规定，把1941年7月初作为这支新组建部队达到相当于帝国海军任何其他部队基本训练标准的最后日期；到8月底，第1航空舰队应具备随时能投入战斗的“作战能力”。在那之后，战斗力还应有进一步提高。
南云特别强调诸如对敌空军基地实施突然大规模空袭、摧毁敌航空母舰、航空母舰的战术性机动以及与陆基飞机和潜艇部队的配合等项目的训练。在战术技术训练上，强调不同类型的飞机进行协同攻击、夜间鱼雷攻击、大规模编队的空战、夜间战斗机技术、大型机群的重复进攻、改进防空及防潜措施，以及规避鱼雷的方法等等。
在一次训练中，源田参谋突然想起了他在孩童时学的剑术中的一招。按这个招术，应首先逼近敌人，把剑举过头顶，然后向下凶狠地一击，再回到原来的位置。他把自己的这个突发奇想用到了空袭战术上，作为第1航空舰队的战术模式。
6月初，源田开始组织第1航空战队进行低空投放浅水鱼雷的训练。
日本4个大岛中最南部的九州岛，被选中作为训练场所。在九州岛东南部的海岸，有一个小海湾，联合舰队的军舰就停泊在那里。由此向正西穿过一片陆地，鹿儿岛湾绵延深入内地，成了一个非常优良的港口。只需一点点想像力，就可看出它与珍珠港十分相似。把想像力再加大一点，海湾西北面的鹿儿岛城区就成了珍珠港西北边的船坞地区。
在这个能够唤起夏威夷感觉的亚热带场所，第1航空战队的鱼雷机飞行员们开始了他们的特殊训练。这一年的整个夏秋两季，每天都有飞机呼啸着低低地飞越鹿儿岛市上空，搞得这座城市似乎空中总是悬着一颗炸弹，终日提心吊胆。
袭击停泊在珍珠港内的大型军舰，最有效的方法是用飞机空投鱼雷。但是，由于珍珠港的水深只有十几米，鱼雷从飞机上空投后会直接扎入滩底。如果不解决这一技术难题，就难以使用鱼雷攻击。
自1933年以来，日本在刚刚超过100米的高度上和在相对高的速度下空投鱼雷的技术方面处于领先地位。然而，在这种情况下投放的鱼雷，扎入水中深度为30～100米，然后猛然向上反弹，有时会蹦出水面。这种鱼雷和游戏的海豚相似，而不像致命的鲨鱼，其威力大大降低。造成这种结果的主要原因，是由于鱼雷的水平舵失效。还有一些鱼雷由于在太深的水中运行，结果从目标舰船的底下通过，不能击中目标。为了克服这些不足之处，日本人试着减低鱼雷运行速度，但这样做会减少鱼雷冲击力，同样会降低对舰船的毁伤效果，因而，必须把鱼雷运行深度减到尽可能小，才能使这种空投鱼雷成为海军作战中真正有效的武器。
1939年，日本人在鱼雷上装上一个大木鳍，用来起稳定作用。但当鱼雷落到水面时，强大的撞击力会使木鳍破裂。后来在横须贺海军基地进行的实验中，又加上一片木板成一定角度支撑木鳍，解决了这个难题。到1940年2月时，这种实验已把鱼雷的最初扎入水深降到了大约20米或更少。当飞机飞行高度低于30米、飞行速度低于280公里时，70%的鱼雷可在大约13米深处运行。但是，在实验中又暴露了其他一些问题，需要对鱼雷进行进一步的改进。
