按照这种计算方法，如果——切顺利，只需40架飞机的鱼雷机队和50架飞机的水平轰炸机队，就可以给予美国太平洋舰队的主力——12艘大型军舰以致命打击。不过，在实际战斗中，目标的分配和转移往往不可能都像事前安排的那样得以实现。
参加轰炸的还有俯冲轰炸机队。由于要实施俯冲攻击，所以俯冲轰炸机不能携带重磅炸弹，每架只能携带一颗250公斤普通炸弹。空袭珍珠港时，俯冲轰炸机将从4000米高度开始俯冲，为了获得较高的命中率，当高度达到大约400米时开始投弹。这样，可以把命中率提高到80%以上。但是，俯冲轰炸机最容易被击落，如果将这一因素考虑进去，预计可能有50%的炸弹击中目标。俯冲轰炸机队一共81架飞机，取其半数，大约有40颗命中弹。
不过，俯冲轰炸机携带的250公斤普通炸弹，不能穿透战列舰的装甲，即使命中，也无非擦伤而已。但如果用它轰炸航空母舰，效果则就不同了。航空母舰结构单薄，俯冲轰炸可以给予致命打击。因此，俯冲轰炸机将全力以赴对付航空母舰。如果兵力有余，或者美军的航空母舰不在港内，就将按巡洋舰、战列舰的次序，选择攻击目标。如果战列舰在遭到鱼雷攻击后倾覆，没有装甲的水下部分露出水面，这时再用俯冲轰炸就能把敌舰彻底炸毁，使它无法修复。
通过周密计算和反复权衡，最后决定所有参加轰炸的飞机共组成两个攻击波，第一攻击波由鱼雷机队的40架飞机和水平轰炸机队的50架飞机组成，第二攻击波由俯冲轰炸机队的81架飞机组成，总共有171架飞机参加轰炸。这是对美国太平洋舰队主力实施攻击的基干兵力。
6.夺取制空权
如果仅仅使用上述171架飞机，是很难完成作战任务的。为了充分发挥基干兵力的攻击能力，必须有效阻止美军战斗机的反击，确保战斗空域制空权的掌握。这一任务，由另外的189架作战飞机去完成。
根据日军掌握的情报，瓦胡岛上的美军航空基地情况如下：
在瓦胡岛，美国陆海军共有6个机场。海军有福特岛机场、卡内欧黑机场和巴尔伯兹角机场，陆军有惠勒机场、希卡姆机场和佩洛斯机场。它们都地处能够保卫珍珠港的位置。
福特岛机场包括水上和陆上两个机场。水上机场驻有大型水上飞机，其主要任务是实施远程巡逻。陆上机场主要是太平洋舰队所属航空母舰舰载机的常驻基地。
卡内欧黑机场也包括水上和陆上两个机场。水上机场驻有水上飞机。陆上机场正在施工，竣工后可配备战斗机队。
巴尔伯兹角机场是一个舰载机有时进行训练的作业基地，没有机库。
惠勒机场是一个大型陆军战斗机机场。
希卡姆机场是陆军重轰炸机大型机场。
佩洛斯机场过去是陆军飞机作业基地，有时用于训练，从9月后升格为战斗机基地。
为了确保制空权，决定使用俯冲轰炸机队，趁美军战斗机还未起飞之际，对机场进行轰炸，制空战斗机队负责扫荡并击落起飞的美军战斗机。争夺制空权的189架飞机也分为两个波次。
第一波的俯冲轰炸机队54架飞机分为3个攻击队，将同时攻击驻有战斗机的惠勒机场及福特岛机场和驻有重轰炸机的希卡姆机场，并速即予以火力压制，以防止美机进行反击。福特岛机场和希卡姆机场离珍珠港很近，要求在攻击这两个机场时，不要让硝烟妨碍其他部队对珍珠港内舰船的攻击。
为了进一步扩大战果，第二波的水平轰炸机队共54架飞机也分为3个攻击队，继续对希卡姆机场、福特岛机场和卡内欧黑机场进行轰炸。这些水平轰炸机主要携带250公斤和60公斤炸弹。
为对付美军伺机起飞的战斗机，制空战斗机队也分为两个波次。第一波制空战斗机队由45架战斗机组成，第二波由36架战斗机组成。制空战斗机队将首先歼灭起飞的敌机，确保制空权，然后对各机场进行扫射。
以上是参加这次空袭的总共360架飞机所分配的攻击目标。为了保卫机动部队本身，每艘航空母舰将留下三分之一的战斗机在舰队上空巡逻，进行掩护。
