利奥波德被任命为于利希地区行政长官，然而普勃两国根本没有理会皇帝的命令，但他们心中还是有担忧，害怕皇帝出兵干预。为了抵抗皇帝，稳固既得利益，于利希临时政府和普勃两国国王在有心人（密探）的建议下，向北洲各地新教君王写信，号召他们来于利希开会，组建新教联盟。
联盟信传到各地，差不多所有新教君王都到了，联盟大会顺利召开，各国签订军事同盟协议，约定共同应对有可能到来的天主教军事干预。自此德意志中部、北部大片地区成为事实联盟，这样的情况鲁道夫二世自然不能容忍。
不过鲁道夫二世这些年来痴迷占星术，想要弄明白其中的奥妙，整天不理朝政。但不说整个神圣罗马帝国，但只是奥地利就一直与奥斯曼帝国争斗不休，鲁道夫二世只得将朝政全权交于他的弟弟马蒂亚斯处理。
当年反奥斯曼帝国之战结束后，奥斯曼帝国在锡南的督促下实施东和西攻的策略，波斯潞王也十分配合，奥斯曼帝国与大明外贸中赚取了大批新式军火。奥斯曼将这些军火运至西方，令西方各地封建主与北洲各国展开骚扰战，主要是奥地利和匈牙利，主要在罗马尼亚和匈牙利之间反复争夺。
马蒂亚斯知道奥地利本身的国力，常年陷入与奥斯曼帝国的争端有百害而无一利，马蒂亚斯顺应匈牙利等地的名义，决定允许匈牙利和罗马尼亚等地独立出去，同时与奥斯曼帝国签订合约，废除兵端。
实际上匈牙利一部分和罗马尼亚大部都在奥斯曼帝国手中，他们想要独立就不会停止争斗，而马蒂亚斯允许他们独立，就能让奥地利从东方抽身，攥紧拳头解决神圣罗马帝国内部其他问题，例如宗教争端。
但鲁道夫二世不认可马蒂亚斯签订的合约，他认为宗教争端是内部矛盾，奥斯曼帝国是外部势力入侵，怎么能因内部矛盾而使外部势力取得利益，他反而决定试图缓和与新教联盟的关系，重新组建十字军远征奥斯曼帝国，优先解决外敌。
鲁道夫二世的决定马蒂亚斯不同意，各地国王、贵族不同意，教皇更不同意。将议会位置让给新教徒，这国家还是天主教的吗，国将不国啊。这些人联名抵抗鲁道夫二世的命令，将马蒂亚斯推上前台，迫于各方压力，鲁道夫二世不得不将权利交到马蒂亚斯手中，由他“攘外必先安内”。
鲁道夫二世成为名义上的皇帝，实权落入马蒂亚斯手中，他上台后立刻组建天主教联盟，作为天主教守护者西班牙当即加入天主教联盟。西班牙一表态，反对西班牙的国家和地区立刻声援新教联盟，例如英格兰和尼德兰。
本来于利希地区不配合皇帝的命令，利奥波德这个行政长官也就没有到于利希上任，马蒂亚斯掌权后，立刻令利奥波德走马上任，还派出一支千人卫队护送利奥波德。
新教联盟组建的消息传到法兰西，亨利四世立刻找来群臣商议，会议上众人一致同意了贾法“引燃战火，乘火打劫”的战略。之后一段时间，亨利四世定下具体战略。
利用西班牙恶劣的国际形势，联合想要自治的尼德兰人和意大利人（当年为了反抗法兰西和奥斯曼的入侵，意大利认同西班牙的统治，到了此时意大利南部大片领土还是西班牙所有），前期在幕后支援，如有必要可以加入新教联盟（虽然自身是天主教）。
于利希地区临近瑞士，新教联盟的大军可以借道瑞士，翻越阿尔卑斯山脉，进攻北意大利，摧毁西班牙和教宗的统治，使意大利自治。
奥地利本身也有宗教争端，新教联盟大军就可以利用这个，在攻击北意大利后跨越威尼斯地区杀入奥地利腹地，占领地中海出海口，切断奥地利外援和外贸收入，这样天主教联盟就会瓦解。
最后再一路北上，帮助低地城邦摆脱西班牙统治。
如果亨利四世的战略成功，法兰西将成为北洲第一强国，哪怕不在这场战争中夺取一块地区（当然法兰西已经瞄准了敦刻尔克地区，这里被西班牙占领后成为西班牙北方势力的后备，还是西班牙劫掠船的大本营，经常劫掠英格兰和法兰西的外贸船只，法兰西早就想攻取这里）。
法兰西人在筹划战略的时候，利奥波德到达了于利希地区，可是利奥波德一到这里就遭到了软禁，随行的护卫军也被赶走。马蒂亚斯很想立刻出兵，但他名义上不是皇帝，只得去向鲁道夫二世叙说。
之前权利被夺，鲁道夫二世并没有就此罢休，他秘密与新教徒取得联系，想要重新掌权，实际上是怕马蒂亚斯为了皇位暗杀他。
马蒂亚斯本没有想暗杀鲁道夫二世，但听闻鲁道夫二世与新教徒密谋，企图向新教徒屈服，还颁布了《大诏书》，允许捷克人民宗教自由。马蒂亚斯忍不了了，鲁道夫二世暴毙于皇宫之中，号称突发奇疾。
鲁道夫二世死了，他与新教徒后续影响没有结束，《大诏书》给了捷克地区新教徒政治意义，其中波西米亚地区（捷克西部三分之二地区）的图尔恩伯爵是个虔诚的新教徒，诏书颁布他立刻在波西米亚积极奔走，新教大面积扩散，其实鲁道夫二世死前就是和他联系的，图尔恩伯爵在鲁道夫二世的授意下还招募了一批雇佣兵。
鲁道夫二世死后马蒂亚斯顺势继位，准备出兵平定宗教纷争的他这才得知帝国国库空虚，常年与奥斯曼帝国争夺东方地区使得奥地利虚弱不堪，国中老兵将领正是青黄不接的时候，想要出兵也不可能。
马蒂亚斯没有办法，只得暂时与新教徒虚与委蛇，放弃于利希地区的统治权，但波西米亚地区新教扩张的趋势令他不安。他决定找个人压制新教，等到他筹集军备开战。他选择了他的堂弟斐迪南二世出任波西米亚国王，斐迪南二世从小接受教会的严格教育，是狂热的天主教教徒，早年在他的领地派出一切非天主教信仰，马蒂亚斯相信斐迪南二世能暂时压制波西米亚地区。
斐迪南二世上任波西米亚国王，立刻在波西米亚地区展开血腥的手段，压制一切非天主教信仰，这使得波西米亚地区的新教徒极度不安。又是图尔恩伯爵，他召集波西米亚各地新教徒向马蒂亚斯请愿，希望恢复宗教自由，但斐迪南二世的行动深得马蒂亚斯之心，对图尔恩伯爵的请愿回复并没有实质性内容。
这段时间统领新教徒各部，图尔恩伯爵的野心极度膨胀起来，他现在心中不单单只想着振兴新教，还要扩大自身领地，染指波西米亚国王之位，他决定利用这次的宗教纷争起兵。
图尔恩伯爵首先拿着马蒂亚斯对请愿的回复，谣传布拉格总督参与皇帝的决断，将没有恢复宗教自由怪罪到当地总督头上。一次总督外出，被愤怒的新教徒围困，叫嚣声中一支利箭射穿了努力解释的总督。
总督死了，虽然不知道是什么人帮助了自己，图尔恩伯爵大喜过望，他立刻出来鼓动人心，言此次刺杀事件将会引发皇帝大清洗，引发当地民众恐慌，由言自己会带领民众取得最终胜利，聚拢民心在身，起兵占领了布拉格（波西米亚地区精华城市）。
马蒂亚斯收到布拉格被新教反叛者占领，并没有第一时间出兵平叛，他知道新教联盟组建，自身也组建了天主教联盟，冒然进兵，布拉格反叛者很可能投入新教联盟反抗，引发两个联盟的大战，这场大战马蒂亚斯还没有准备好，他决定暂时修书稳住布拉格反叛者。
但马蒂亚斯期望和平解决反叛的信件被图尔恩伯爵拦截了下来，神圣罗马帝国皇帝软弱的举动助长了他的野心，知道皇帝没有派出平叛大军，图尔恩伯爵不再停留布拉格，带着他的雇佣兵四处出击，用威胁恐吓促使周边城市屈服。
大明大肆收购牲畜，使得北洲各国大面积退耕还草，牛羊吃人在北洲渐渐失控，北洲百姓生活在水深火热之中，奥地利、捷克等地也不例外。图尔恩伯爵的叛军到处，许多活不下去的农民拿着草叉就加入了叛军。
自身兵力极度增长，治下地盘增加，进一步刺激了图尔恩伯爵的野心，他已经不单单想要波西米亚国王了，他决定夺取整个捷克乃至奥地利北部地区，为此他决定出兵奥地利首都维也纳城，攻下维也纳，强迫皇帝签订城下之盟。
图尔恩伯爵势力的急速膨胀，与密探和其他新教势力暗中支持脱不了关系，刚开始波西米亚的新教徒被迫害，他们感同身受，慷慨解囊，但他们没想到奥地利如此虚弱不堪，反叛居然成了燎原之势，这下他们又有些眼红了。
