慈禧办完丧事后，李莲英靠山已倒，隆裕身边的贴身太监小德张成了紫禁城风水轮流转的新角色。一朝天子一朝臣，李莲英已经到了急风转舵、告老归乡的时候了。宣统元年（1909）二月初二，为慈禧守了一百天孝后，他离开了生活了五十一年的皇宫。树倒猢狲散，聪明绝顶的李莲英估计隆裕不会那么轻易放过自己，于是临行前将收藏在宫中的七大盒财物，全部归还隆裕，以作脱身之计，并对隆裕说：「这是皇家的东西，不应该流入民间，奴才我小心谨慎地替皇家保存了几十年，现在年老体衰，要离开宫廷了，所有这些宝物，奉还给主子。」他还决心为慈禧守孝，临行前还对隆裕承诺：「我前后伺候太后这么多年，蒙太后的恩典，我这辈子也报不了，只有下辈子再报答了。我离开宫后，要给老太后守孝三年，稍尽奴才的一点孝心。」隆裕太后深受感动，念他在宫中服役多年，准其「原品休致」，即带原薪每月六十两白银退休。他在北京皇城根接近帝阙的地方，置了一所宅院，虽比不上小德张在永康胡同的私宅那样珠帘玉户，但也穿廊圆拱，雕梁粉壁，足娱晚年。他还投资饭馆，在东华门著名的饭馆东兴楼，他占三分之二的股权。宣统大婚前，宫内为了节省开支，裁撤御膳房，改由东兴楼包饭。李莲英为感谢故主旧恩，所包伙食，仅收成本。有时他还到东兴楼查看有无偷工减料情形，优游林下，以娱晚年。
宣统三年（1911），他忽然得了急性肺炎，病入膏肓。他以一贯谨慎做事的风格，叮嘱后代，他的丧事一定要奏明朝廷，请隆裕太后恩准定夺。他将上百万两白银、大量珠宝、价值万贯的几处房产分送给几个嗣子和侄儿等，后因送医太迟，不治而亡，时年六十四岁。二月初六日，隆裕太后降旨，依祖宗成法，依六品以上太监成例，赐茔地一块，在德胜门外恩济庄大公地。他的坟墓在太监茔地里是最有气派的，有个独立院落，前有石桥和牌坊，牌坊上横眉写着「钦赐李大总管之墓」，阳宅四五十间，另有一座专门的祠堂，祠堂内挂李莲英画像，供人奉祀。
他一死，他过继的两个嗣子是游手好闲、花钱买快乐的人，一个赛一个地狂嫖滥赌，将他一生聚敛而来的财产，变卖得一乾二净。到了民国二十年（1931）左右，在德胜门晓市有人发现了李莲英当年受赐的珍贵皮氅外褂、碧缕牙筒、翠幛围肩等。他的两个嗣子在抗战期间贫病交加，先后倒毙街头，一代权监的声威，从此烟消雾散，消融于无形。
