朝廷知道陈介兵败情况后，乃逮捕介等下锦衣狱。命血腥镇压荆襄流民起义的刽子手都御史项忠总督军务，总兵刘玉、参将夏正率京营兵，并发陕西三边(延绥、宁夏、甘肃)兵5万人往讨满四。同时起用马文升为都御史，巡抚陕西协剿。
十月，项忠、马文升至固原，分兵六路进攻石城，互有胜负。此时，兵部尚书程信等恐满四势力壮大以后，与大漠的蒙古铁骑联合起来，就更难对付了。因此建议由抚宁侯朱永率京兵4万前往征讨。但大学士彭时，商辂认为项忠能够获胜，而项忠则认为京兵没有战斗力，兵多无用，乃不待援兵到来，督兵攻围石城，迫使满四投降。十一月，项忠计诱满四出城，将其擒获，并斩首7000余级，俘虏2000余人。继续屯兵城下，伺机进攻。叛军已经失去首领，自度无力抵抗官军，乃于一夜之间溃散而去。项忠乘机发兵追捕，又斩首数千级。平石城。
自“土木之变”后，瓦剌势力日益衰弱，鞑靼的势力则逐渐强大起来。虽然他们此时都没有对明王朝构成严重的威胁，但也不时侵扰明朝边境，有时还深入内地，对明朝而言，始终是隐患。可是，此时明王朝的君臣，似乎并没有认识到问题的严重性，而是某种程度地陶醉在“升平世界”里。
从以上所述，不难看出，宪宗朝决不是封建史家所说那样升平宁静的，而是充满了矛盾，潜藏着危机的。明孝宗朱祐樘就是在这样的环境中成长起来的。
