1864年9月17日，侍王李世贤部放弃江西南安府水城，越梅岭入广东；攻南雄州不下，复入江西攻龙南、走定南。一部入广东和平、龙川、兴宁境，东走嘉应州（今梅州市）；李世贤则经江西安远、长宁，进占广东平远，10月4日弃平远，占镇平、大埔，旋入福建，于14日占漳州府。李世贤在此布告农商，各安所业，照常完粮纳税，并致书英、美、法领事，申述太平天国的主张，企图重振革命事业。
这时，天将丁太阳等攻占福建武平；来王陆顺德等攻占龙岩；康王汪海洋部也由江西瑞金入闽，攻克汀州。各太平军余部会集闽南，闽浙总督左宗棠以职责所在，于11月26日自杭州启行，亲
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①启王梁成富在陕西坚持斗争，1865年6月6日在甘肃守阶州，城破被俘牺牲。
自督军分三路入闽：西路由帮办福建军务刘典率部万余人，由江西建昌入汀州；中路由提督黄少春率部4000余人，由衢州经江山，取道浦城南下；东路由提督高连升率部4000人，由杭州赴宁波乘轮船取海道抵福州。
12月中旬，刘典部自连城南下，汪海洋部败之于新泉隘，毙副将卢华胜等。1865年1月初，刘典率部再次来攻，2月22日战于新泉，汪海洋部大败，精锐丧失几半，遂转移至龙岩、南靖、永定一带。
清廷为加强镇压福建太平军的兵力，又从江苏调派提督郭松林率淮军8000人由海道去福建，4月上旬抵漳州外围。李世贤部添筑营垒，协力坚守。5月15日，各路清军联合进攻，分截太平军南靖援军，并扼北尾桥以牵制楼内寨。太平军马头门14垒被毁，伤亡颇众。清军攻破漳州南门，太平军巷战不胜，启西门退出，漳州遂为清军攻占。
侍王李世贤自1864年10月攻占漳州，在此坚持了7个月。撤出漳州后，又于1865年5月26日败于永定，损失二三万人，李世贤只身逃走。
由于漳州失陷，李世贤连连失败，康王汪海洋也于6月初旬撤出上杭，由武平入广东镇平。8月19日，李世贤逃至镇平，汪海洋迎之入城。李世贤在营中得悉其叔李元茂已被汪的部下杀害，意甚不平。汪海洋恐其责己，并怕夺其军权，乃于8月23日派人将李世贤刺死（时年32岁）。
漳州失守后，来王陆顺德也弃龙岩，南入粤，占镇平，走平远，据长乐，9月20日为天将林正扬擒缚，连同长乐城一起降于清军。
9月28日，镇平为提督高连升等部攻占，汪海洋率部经平远入江西，在定南、龙南又为席宝田所败，10月17日复折入广东，连占和平、连平。12月初经龙川抵兴宁，8日攻占嘉应州。
早在1865年10月，由于太平军进入广东，清廷命左宗棠赴广东督师，并节制各路清军。1866年1月15日，左宗棠抵广东大埔，令鲍超自福建上杭、武平从北面进攻嘉应州，提督高连升部攻其西，刘典部攻其东，左宗棠亲率黄少春、王德榜部攻其东南。1月28日，汪海洋等督精锐猛烈反击，刘典、王德榜战败。后清军高连升、黄少春部合力猛攻，在激战中汪海洋中弹受伤牺牲，余部由偕王谭体元统领。2月7日，谭体元率部弃嘉应州西南走，被清军追及，遂与敌死战，谭体元力竭坠崖牺牲，部众万余人战死，四五万人投降。至此，进入江西、福建、广东的江南太平军余部，被清军歼灭。
自1851年初金田起义开始的太平天国革命战争，经历了英勇、悲壮而曲折的斗争历程，至此最后失败。
