综上所述，曾国藩组建湘军，从官兵选募、编制体制、武器配备、薪饷待遇和教育训练等各方面，都改弦更张，另立新规，别开生面。它虽然开了近代中国“兵为将有”的恶劣先例，同时存在着封建军队所不可避免的一些弊病，但就总体而言，远比八旗、绿营的军制优越，对于提高部队的战斗力起了明显的作用。无可讳言，湘军的建立，是晚清军制变革的先导，具有深远的影响。另外，湘军的军制，在不少方面也优于太平军的军制。例如，它的组织指挥层次远比太平军少，官少兵多，前期基本上保持满员，不存在太平军那种官多兵少、士兵缺额严重的现象，因而更便于指挥、利于作战。又如，水师的战船形制、火器配备、战船和运输船的分别编组以及平时的训练等方面，均超过太平军的水营，从而得以战胜太平军的水营，实现控制长江江面，有力地支援陆营作战的目的。这也足以说明，湘军军制的优点和特点，是其成为取代绿营充当镇压农民起义的得力工具的一个重要原因。
应当指出，由于湘军以“兵为将有”为主要特征，在镇压太平军过程中又屡立“战功”，自曾国藩被任命为两江总督以后，其他一些重要将领也逐渐由单一统兵者变为集地方军、政、财权于一身的封疆大吏，形成了一个颇有势力的湘系集团。这样，就破坏了原来各省事权互相牵制、权归中央的局面，开创了督抚专擅地方事权的先例。此后，各省督抚与中央的关系，逐渐处于游离状态。
可以这样说，湘军的崛起，虽然暂时挽救了清政府的垂危统治，但清王朝的最后覆亡，与湘军制度也有一定的关系。
