一、控制武卫军
李璮事变也在新建立的中央禁军武卫军中引起了反响。史天泽家族子弟交出兵权后，担任武卫军都指挥使的李伯祐因为是史家的姻亲，也“致事”家居，交出了武卫军的指挥权。郑江接任都指挥使。中统三年九月，对李璮旧军加以整顿，由益都行省大都督撒吉思和武卫军都指挥使董文炳会议兵民籍册，“每十户惟取
其二充武卫军”，共择出了1000军士加入武卫军，由益都调到燕京屯田。四年正月，“诏诸翼万户简精兵四千充武卫军”。至元元年(1264年)八月，又选益都新军千人充武卫军。①为进一步扩大卫军的力量和加强对它的控制，忽必烈很快对武卫军的建置进行了改造。
二、至元元年至八年的左、右翼侍卫亲军
至元元年（1264年）十月，武卫军改名为侍卫亲军，分为左、右两翼，继续从地方汉军中抽调精锐士兵补充中央禁军。二年十二月，从辽西、辽东的女直（女真）军、高丽军、汉军中各选“富强才勇者”3000人，益都路“丁力壮锐者”1000人，入充侍卫亲军。四年七月，又从东京路民户内签选侍卫亲军1800名，“仍定立千户、百户、牌子头，并其家属同来，赴中都应役”。从中统三年到至元四年，增入卫军的士兵见于记载的计有1. 78万人，加上原有的武卫军3万人，左、右翼侍卫亲军的总人数已将近5万人。
左、右翼侍卫亲军的职官设置与武卫军相同，主要职务仍然是由汉军将领充任。任左翼侍卫亲军都指挥使的为郑江和景州人贾茂，刘思敬任副使。任右翼侍卫亲军都指挥使的是董文炳和刘复亨，原史天泽部将郑温任副使。
武卫军改建成侍卫亲军以后，仍然承担扈从、征伐等任务。当时蒙古朝廷的对外战争主要是与宋朝争夺边城，尤其是争夺襄樊及四川的军事重镇。为了补充前线兵力的不足和通过实战锻炼提高侍卫亲军战斗力，忽必烈将相当一部分侍卫亲军投入了对宋战争，又选派了一部分卫军军官出任前线指挥官。郑江和贾茂亲率军队作战，贾茂曾兼任行淮东左副都元帅府事，郑江则于至元八
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①《元史》卷五《世祖纪》二，卷九九《兵志二·宿卫》。
年战死于襄阳城下。董文炳、刘思敬和千户王仲仁等人也先后出任河南、山东、东川、西川统军司要职。由卫军人员出任的军官能在地方担任重要统军职务，任职后的升擢也较一般汉军军官快得多，这正反映了蒙古统治者传统的用人制度。由宿卫的怯薛歹（护卫士）中选人为官，从成吉思汗开始一直沿循下来。侍卫军组织建立以后，与怯薛（护卫军）一同构成双重宿卫体制，侍卫军成为蒙古大汗最可信赖的一支军事力量，在侍卫军中任职的各级军官容易成为大汗的心腹，他们的待遇基本和怯薛相同。将他们派到前方去替换其他汉军将领指挥诸军，正是通过侍卫亲军控制汉军的有力手段。
留在京城的侍卫亲军，主要是屯田和担任中都（即燕京，至元元年八月诏改为中都，至元九年二月，又改名为大都）巡逻的任务。从原则上讲，当时是不许擅自差发侍卫军士兵进行工役的，因为它作为中央常备主力军，须保证较强的战斗力，应尽量减少它的劳役损耗。至元三年五月，忽必烈特别下令：“侍卫亲军，非朕命不得发充夫役，修琼华岛士卒，即日放还”①。但在必要时也派侍卫亲军充役，如至元四年扩建都城，命刘思敬率军“筑京城”，就是一例。②
三、至元八年至十六年的左、右、中三卫
至元八年（1271年）七月，忽必烈又将左、右翼侍卫亲军改编成左、右、中三卫，中央禁军的民族成分和指挥管理都有了一些明显的变化。
蒙古军士入卫 蒙古军士兵原来只在蒙古各千户、探马赤军和怯薛中应役，不入卫军系统。至元十四年五月，“选蒙古、汉军相参宿卫”，“备都城内外及万寿山宿卫”，蒙古军士开始被编入卫
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①《元史》卷九九《兵志二·宿卫》。
②《元史》卷一五二《刘斌传》。
军组织。①
色目人入卫 早期由色目降人组成的军队，大多数直隶于蒙古军籍，所以没有被编入卫军。至元九年，设立阿速拔都达鲁花赤，统管招入卫军的阿速正军3000人，怯薛丹军700人。十五年，又在钦察人中“择其材者备禁卫”。全国统一以后，卫军组织中出现了钦察卫和阿速卫的建置，就是滥觞于此。
新附军入卫 新附军是元代对南宋降军的称呼。至元十年二月，宋襄阳守将吕文焕率生、熟券军（详情见后第三编第十三章）降元。四月，吕文焕入大都朝觐忽必烈，被授职为侍卫亲军都指挥使，原属部生券军无家眷者均被召集入京，大部分编入左、右、中三卫。十二年，元廷发起灭宋战役，在战争中收编了大量新附军人口十五年五月，“选江南锐军为侍卫亲军”，新附军的精锐之士大多被选入了卫军组织。②
汉军入卫相对减少 由于汉军当时大多数投入对宋作战，不宜从前线抽回来补充卫军，所以这次卫军改编后没有大规模征调汉军入卫，只是将一些汉军军官“私匿”的军人招入卫军。汉军入卫虽然减少，但在整个卫军组织中，汉人仍然占很大比例。
军队指挥权的移交 改建“三卫”后，单纯由汉军组成的卫军体系被打破，变成了多民族成分的中央禁卫组织。蒙古统治者在中原建立的统治本来就是由多民族所组成，它的军事组织当然也要由各民族人所组成。蒙古统治者在各族人联合组成的军事组织内首先注意的是要保持住蒙古族的独尊地位，除了在政治、经济、法律上给予蒙古人以特殊待遇外，军政要职一般由蒙古贵族充任。中央禁军组织近处京畿要地，长年掌握在汉人军将手中，显然与蒙古皇室的统治政策相悖，所以早晚要发生变化。改立三卫军之后，首任右卫都指挥使的是蒙古忙兀部人、功臣畏答儿的后
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①《元史》卷九《世祖纪》六，卷九九《兵志二·宿卫》。
②《元史》卷九《世祖纪》六，卷一二三《哈八儿秃传》，卷一五一《贾塔刺浑传》。
裔博罗欢，“在大都专掌右卫，至上都则兼管三卫”①。蒙古人以右为上，也就是说整个卫军的指挥权已经由汉人将领手中移到了蒙古贵族手中。对蒙古族以外的其他民族，统治者采取的是各民族相互节制、兼容并用的政策，中央禁军长期以一种民族军队组成，也与这种政策相违，所以需要在卫军巾适当渗入其他民族成分，蒙古人、色目人和南宋降人即适时地被吸收到了卫军组织中来。既然是由多民族人所组成的军队，它的主要军官也就由各族将领分担，只不过是以蒙古人为首而已。任右卫都指挥使的除博罗欢外，还有刘思恭（刘思敬弟）、秃满带和郑温。郑江子郑郇为左卫都指挥使。王仲仁子王宏和原北京路征行万户王荣祖子王廷任中卫都指挥使，高丽人洪君祥任副使。札的失、囊加带、百家奴、唐古、忙兀儿、帖木儿、贾忙古台等人，也都在三卫军中任都指挥使和副使之职，所在卫已难详考。
忽必烈对侍卫亲军进行改编前后，对其他官府机构也进行了调整，使它们更接近于历代中原王朝的中央和地方机构建置。至元八年十一月，忽必烈改国号为“大元”，蒙古汗廷向中原王朝的转化基本告成。三卫军的建置，也是朝政正规化的一个重要步骤。
从武卫军改建为三卫军，元廷中央禁军组织的民族构成和指挥权问题基本解决，但组织制度还很不完备，卫军士兵的定期番直制度还未建立起来，军官的品级、俸秩也没有定制，各卫的屯营地点也不甚明确。这些问题，到全国统一之后才逐步得到解决。
