怎么杀毛文龙呢？有两个办法可供袁崇焕选择。
一、引诱毛文龙到宁远来。只要他敢来，万无一失。但是，毛文龙来不来，袁崇焕拿不准。即使他来了，杀了他，其属下的人肯定不服，弄不好要发生兵变。他远在宁远，根本控制不了局面。
二、袁崇焕带人到皮岛去。因为皮岛是毛文龙的地盘，他不会对新任领导设防。只要抓住机会，拿下毛文龙，公开宣布毛文龙的罪状，让他属下意识到，他们的主帅的确罪不可赦，然后让适当的人选接替，就不会出大乱子。但是，能不能拿下毛文龙，是个关键。
袁崇焕想来想去，觉得去皮岛杀毛文龙，才是上策。于是，他设计出先麻痹、趁其不备再动手的杀人方案。
在出发之前，袁崇焕先派人通知毛文龙，说他五月底要到岛上犒赏三军，顺便给他们带去军饷。毛文龙对此没有拒绝，表示热烈欢迎新领导下去视察工作。
1629年5月29日，袁崇焕乘船到达双岛，但他没有直接上岸，派人通知毛文龙来接。第二天，毛文龙带着酒肉迎接袁崇焕，表示欢迎领导下来视察工作。袁崇焕见到毛文龙，非常亲切，嘘寒问暖，说了很多褒奖的话。
上岸之后，毛文龙还真以为新任领导犒赏三军来了，自然得提点工作上的困难。他说：“我靠200人起家，在海外经营8年，虽想为国做贡献，但缺粮少枪，心有余而力不足啊。”
袁崇焕说：“这个没关系，崇祯皇帝是个干事的人，只要咱们老哥俩齐心协力，我在陆地，你在水上，收复辽东，粮饷器械不是问题。只要你好好配合我工作，有什么困难尽管提。”
袁崇焕在岛上视察几日，饷银也足额发到士兵的手中，没有露出一丝要除掉毛文龙的迹象。这让毛文龙放松了警惕。
6日，袁崇焕提出要考察士兵教射，要毛文龙陪他到山上观看，毛文龙爽快地答应。其实，袁崇焕早已把他的卫队埋伏在山上的大帐之外，只等毛文龙前去。
在山上，袁崇焕顺利拿下毛文龙及他带领的几个都姓毛的属下，当众宣布毛文龙的12大罪状，请出尚方剑，要代崇祯铲除大明的害群之马。
毛文龙根本不承认那些拼凑成的12大罪状。他只想知道，到底是皇帝想杀他，还是袁崇焕想杀他。
其实，杀毛文龙，确实不是崇祯的意思，而是袁崇焕和东林党圈子里那群人的意思。在他们看来，凡是阉党圈子里的人，都得毫不客气地斩尽杀绝。
袁崇焕不可能说他这次是擅杀大将，为了让毛文龙属下承认他的行为，他跪在地上，冲着北京方向说：“我今天诛毛文龙，只因他独霸一方，不受管制，以肃军政，各镇守将中如果再有如毛文龙者，照杀！臣5年不能平奴，求皇上亦以诛毛文龙者诛臣。”
警告、发誓之后，袁崇焕就命令水营都司赵可怀执御赐尚方剑，在帐外砍了毛文龙。
■
对手也是帮手
尽管袁崇焕持有尚方剑，但是像毛文龙这样级别的大将，也不是想杀就杀的。他私自斩杀毛文龙这样的大事，不能不向北京禀告。袁崇焕为了证明自己做得没有错，在给崇祯的报告中，强调毛文龙的12大罪状，并用数据说话。
报告中说，毛文龙属下，老少病残加在一起，不到47000人，还包括不在编制内的民兵。真正在编制的士兵，还不到2万。他说编制内的将领有1000人，其实不到100人。
袁崇焕知道自己擅杀毛文龙，是违反制度的。在报告中，他承认自己有罪，要求处分。
崇祯上台之后，听到关于毛文龙的消息，都是负面的。比如，此人是阉党圈子里的，给魏忠贤建过生祠，冒领军饷，私自做买卖等。但是，同样作为魏忠贤的受害者，崇祯认为，阉党圈子里的人，也得区别对待。袁崇焕是好样的，死活不加入阉党的圈子，结果怎么样？还不如毛文龙这个加入的呢，最起码，他还能为政府、为人民办点事儿。最近，崇祯对辽东放心不下，没事就研究辽东地图，发现牵制后金政府，毛文龙是不可或缺的人物。
