李敖最后说，他准备对吴英昭在《不起诉书》中指他"凭空捏造、子虚乌有、错误百出"的说法进行控告，告吴与另三名检察官郭珍妮、王荣森、郭峰祈涉嫌诽谤。估计这场控告不起作用，但要留下一份历史记录，相信这个枪击案终有一天会真相大白。
陈水扁靠两颗子弹获得连任后，海内外的中国人都担心陈水扁将利用手中的权力，一步步地将台湾带往独立之路。
带着大家的疑虑，香港《文汇报》一记者于2004年5月21日专程到台北访问了李敖，李敖说："陈水扁搞台独搞不起来的，也不敢搞，'修宪'最终也只是由五权分治变成三权分治，北京的底线，他不敢碰。"
他还说："从整个国际大气候看，台湾已经出局了，被边缘化了。大陆的经济影响，我们越来越感受得到。只要大陆开放A股给台湾人买，台湾的资金流失会更加严重。我住的台北市大安区，有消费能力的阶层估计足足跑了10余万人，都到大陆长三角去了。所以各行各业，租VCD的，开计程车的，生意都不好，一些高级餐厅都关闭了，这说明陈水扁执政不得人心嘛！"
记者问他对陈水扁当局搞的"去中国化"有何看法时，李敖情绪有些激动地说："英国著名文学家肖伯纳说过，一切政治都是宣传，一切文学都是宣传。李登辉、陈水扁他们提出的'去中国化'，也是政治宣传。所以，这些观点是不可能生根的。我想问他：'去中国化'之后，台湾文化还有什么？什么都没有嘛！可能只剩下他们所认为的本土戏剧--文化歌仔戏，但这种以台湾流行100年的民间表演方式，也是源于中国大陆的南、北管，只不过是将其粗俗化而已。"
他接着说："有的人担心他们搞'去中国化'是慢性台独，我对此不忧虑，因为文化层次的东西要去掉的话，要视乎政治、经济的发展。如日本人统治台湾51年，日本人走后，'去日本化'是随着其政治、经济影响的减弱而形成的。大陆与台湾在政治、经济越来越紧密的情况下，根本上是去不了的，互相的影响只会越来越深。……陈水扁他们的做法，是一种很愚蠢的行为。"
5月22日，李敖的谈话在《文汇报》上刊出。
随后，大陆的《世界知识》半月刊一记者访问了李敖，谈到陈水扁搞台独的问题时，他又说："陈水扁是跟着拳头转的，你拳头硬了他就变，嘴巴说的都不算。"
记者问他：有人认为2006年"制宪"是台独时间表，你对此怎么看？李敖说："他敢？他是欠揍！我始终不相信这一点。因为他搞'台独时间表'就是正式翻脸了，就是'破坏现状'，美国不干了。台湾怎么独呢？不改'国号'、'国旗'，这些最具象征意义的不敢改，怎么叫'独立'呢？它只能鬼叫，它可以'公投'，但它过不了关。陈水扁根本不敢拿这个来'公投'，他会喊'公投'，喊'修宪'，但他大不了是搞什么体制改革的花样，没有什么了不起。"
2004年12月底，李敖斗陈水扁的另一件大事，就是阻击张建邦出任台湾当局的"监察院院长"。
张建邦，台湾宜兰县人，生于1929年，1940年随家迁住上海，毕业于上海圣约翰大学经济系，1950年回台，然后去美国留学，在伊利诺大学获得农业经济与教育行政硕士学位，1952年返回台湾，历任大学副教授、副院长、院长、校长，台北市议员、副议长、议长，"驻联合国代表团顾问"、国民党知识青年党部主任委员、台北市副主任委员、国民党中央委员、常务委员、"交通部长"等职。
国民党在台湾失去政权后，张建邦在政坛消失。
2004年12月，台湾政坛突然传出一条爆炸性新闻：陈水扁准备提议张建邦出任台湾当局的"监察院院长"。
李敖得到这一消息，十分震惊。
张建邦系台湾过时政客，又不是民进党的人，陈水扁突然将他提出来任如此重职，说明张建邦通过小道与民进党的人一直在勾搭，不然，陈水扁不会提他任"监察院院长"。
对张建邦其人，李敖太熟悉了。早在上世纪八十年代，李敖在台湾多家报刊上写过抨击、批评张建邦霸占淡江大学校产，逼死其母居瀛玖的文章。
事情是这样的：1950年9月，逃台的原国民党元老居正在台湾淡水创办了淡江英语专科学校（后改称淡江大学），董事长也由居正担任。1951年初，居正女婿病死，年底76岁的居正也病故，淡江英语专科学校的董事长一职便由居正的女儿、张建邦的母亲居瀛玖担任，居正的儿子居浩然任教务长，主持日常工作。
1962年，从美国留学归来的张建邦被母亲居瀛玖、舅舅居浩然聘到该校任副教授。
张建邦干了一段时间，私心恶性发展，开始策划夺权。他首先赶走了舅舅居浩然，使居浩然被迫去了澳大利亚。其后，他又逼迫母亲居瀛玖退位，居瀛玖难以忍受，于1963年3月15日上吊自杀。
居瀛玖一死，张建邦就做了淡江英语专科学校校长，夺权的愿望终于实现。
张建邦的卑鄙行为，引起很多人的愤慨，并向台湾的一些要人作了反映，台湾当局认为这是张家的家务事，没有理会。这样，这起轰动一时的逼死人命案，不了了之。
70年代，张建帮与蒋氏父子拉上了关系，官越做越大，更不会有人去追究这件事了。
为了阻止张建邦任"监察院院长"，李敖突然在台湾《联合报》、《中国时报》上登了两大版广告，细讲了张建邦逼死其母的经过，公开反对陈水扁提议道德上有缺失的张建邦出任台湾"监察院院长"。
李敖还在台湾举行了记者会，说明他为什么要反对陈水扁提议张建邦任"监察院长"，并说，如果陈水扁不顾他的反对，他将组织人举行示威抗议。
由于李敖的强力阻击，陈水扁只得暂时放弃提名张建邦的念头。
2004年12月31日，李敖借在香港凤凰卫视开辟的《李敖有话说》栏目，又谈到了这件事，他说："刚才我录像的时候，还被记者包围起来问这个事情，这就是我李敖看不过去的方法，看不过去的方式，就是我刊登满版的广告，来跟你对干，来骂你陈水扁，来骂你张建邦，来阻拦这件事情。为什么呢？因为他太背离正义的标准，'监察院长'不应该找这种逼妈妈上吊的人来主持。而今天陈水扁如此倒行逆施，所以我登报问他：你是什么'总统'？'总统'两个字还用括号括起来，表示我根本怀疑你的真实性……"
