奈斯卡王室一直不断的内讧，使信奉天主教的伊萨贝拉能够轻易地将他们消灭。她与菲迪南德二世结婚，使卡斯提尔与阿拉贡两个王国合而爲一，之后，她于1479年决定将异教徒全部驱逐出西班牙。格拉那达最后一个埃米尔艾卜，哈桑的两个儿子艾卜·阿卜杜拉·穆罕默德(西班牙人称之爲波布迪尔)和优素福都背叛了他。这场斗争结果，由波布迪尔占领了格拉那达，在这场战争中，伊萨贝拉的丈夫菲迪南德采取了狡诈的外交手段插手进来。他首先从阿拉伯人手中夺取了较小的城市，阿拉伯人有时曾极其英勇地保卫了这些城市。接着经过了长期的围困，格拉那达终于在1492年1月2日向他投降。波布迪尔最初获得一小块的采地，但是后来他退往非斯，终于在那里去世。至于未曾迁出西班牙的穆斯林，天主教的宗教法庭指引他们参加唯一的能使他们得到拯救的教会，而不顾原来的投降条件；但很多的人渡过了直布罗陀海峡，因此繁荣了摩洛哥的文明，并把这种文明的影响带到更南的地区。
