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牛顿的一系列伟大成就在科学史和哲学史上赢得了高度评价。他的同代人、著名天文学家哈雷在１６８７年４月５日给牛顿的信中称赞牛顿说　：“当世人尚未进一步经受经过证明的学说的教诲之时，他们会为有一个这样深入的、最难理解的自然奥秘及殚思竭虑而使人类理性达到无比的高度而感到自豪。”

冯太纳尔是第一个为牛顿写传记的人，他说　：“在１６８７年，艾萨克・牛顿终于决心揭开面纱， 现出他的真面目。于是　，《自然哲学的数学原理》披露于世。在这本以最深邃的几何学作为新哲学体系基础的书，起初全然没有取得它应得到的荣誉。这种荣誉是它后来才获得的……大量几何学家如不很专心就不能理解，并且那些下层的人直到这本书受到最精通的专家们的称赞之前，对它是不了解的。但是最后，当这本书受到充分了解时，它慢慢获得的这些称赞在各个方面爆发，并联成一片赞扬。每一个人都被整个著作所闪烁的创造精神所打动，都被大师般的天才所打动。这种天才在整个最愉快的年代期间，仅由一切最有学识的国家挑选出来的三四个人所分享。”

伏尔泰也在《艾萨克・牛顿爵士的原理》一书中说　：“牛顿的哲学到现在为止对许多人来说，好像古代人的哲学一样深奥莫测。但是，希腊人的哲学从其产生以来实际上已经暗然无光，而牛顿的哲学从离我们极其遥远的光芒处升起。他已经发现了很多真理，但是他曾探求的和位于深渊中的，是他必然深入其中的，他要把它们发掘出来，并且把它们置于充分的光明之中。”

法国著名天文学家和天体力学家拉普拉斯是继牛顿之后，对天体力学做出重大贡献的科学家，他还是根据牛顿的自然哲学原理和因果律提出“决定论”的人，被称为“决定论之父”。　他也对《原理》做出了 高度的评价。他说　：“这些发现的重要性和普遍性，以及大量创造性的和深邃的观点，已经成为本世纪哲学家们极其辉煌的理论根据，并且全是以优雅的文字表述的，确保了《自然哲学的数学原理》这部著作成为超出人类智慧的一切产品的杰作　。”　又说　：“《原理》将成为一座永垂不朽的深邃智慧的纪念碑，它向我们揭示了最伟大的宇宙定律。这部著作是高于人类一切其他思想产物之上的杰作。这个简单而普遍的定律的发现，因为他囊括对象之巨大和多样性，给予人类智慧以光荣。”　他还在其名著《宇宙系统论》一书中写道　：“用地球的运动去解释天体运动所表现的简单性，得到天文学家一致的赞成，认为是万有引力原理的一种新的验证，使其达到物理科学可能得到的最高境界。”　“如果考虑到没有一个现象不是可以从引力定律去得到解说的话，而且考虑到这个定律以很高的精度决定天体在每瞬间和整个过程里的位置与运动，我们更不怕这个定律为某个还没有观测到的现象所否定。最后，天王星和它的卫星以及新发现的四颗小行星都顺从而且验证了引力定律。我们不能否定这一切证据，使我们不得不肯定，除地球的运动与万有引力的原理之外，自然哲学里没有什么更完美的论证了。”牛顿传记的著名作者物理学家布鲁斯特，在《艾萨克・牛顿爵士的生平　：伟大的哲学家》　一书中写道： “按照普遍的意见，艾萨克・牛顿的名字被列在有着他们那种光荣的人们的榜首。然而，给人深刻印象的是标志，随着时间的推移，把这种标志赋予了古代的哲人和英雄们。他们声名的光辉已经被牛顿荣誉的显赫搞得暗淡下来；既不是竞争的国家的偏爱，也不是傲慢年代的虚荣，的确，或许后代将选定地位仅次于牛顿的哲学家把《原理》描述为人类一切智慧产物之上的杰作，并且因之剥去同代人加给它的作者的过分的颂词。”　但是，到２０世纪，人们仍然对他的赞誉不减，而且随着时间推移，他的历史地位愈加突出。他说　：“自从牛顿奠定理论物理学的基础以来，物理学的公理基础换一句话说，就是我们关于实在的结构的概念的最伟大的革命，是由法拉第和麦克斯韦在电磁现象方面的工作所引起的。”　他又说　：“我觉得有必要在这样的时刻来纪念这位杰出的天才，在他以前和以后，都还没有人能像他那样决定着西方的思想、研究和实践的方向。他不仅作为某些关键性方法的发明者来说是杰出的，而且他在善于运用他那时的经验材料上也是独特的，同时还对于数学和物理学的详细证明方法有惊人的创造才能。由于这些理由，他应当受到我们最深挚的尊敬。”　１９４６年，爱因斯坦在《自述》中说　：“牛顿啊，请原谅我，你所发现的道路，在你那个时代，是一位具有最高思维能力和创造 力的人所能发现的唯一道路。你所创造的概念，甚至今天仍然指导着我们的物理思想，虽然我们现在知道，如果要更加深入地了解各种联系，那就必须用另外一些离直接经验领域较远的概念来替代这些概念。”　卢瑟福也针对本世纪初出现的企图以相对论推翻牛顿力学体系的说法，在１９２３年举行的大英科学促进协会的主席致词中说　：“今天有一种颇为流行的误解，科学是由推翻以前建立的理论才进步的，这是极少的情况。例如，时常有人说爱因斯坦的广义相对论推翻了牛顿在引力上的工作。真理再前进一步会是谬误。事实上他们的工作是难以比较的，因为他们处理着不同的思想领域。就爱因斯坦的工作与牛顿的工作的关系而言，仅仅是它的基础的一种普遍的推广，事实上是数学和物理发展的一个典型情况，总之，一个伟大的原理不是可弃之物，而是加以修改，以便将它放在一更广泛的和更稳固的基础之上……”

薄柏形象地讲过这样一句名言，后来被广泛引用：“自然和自然规律隐匿在黑夜之中　”，上帝说　：“让牛顿降生吧，则一切就有了光明。”　牛顿的确给人类带来了光明。