英王詹姆士一世在位时，严厉地警告清教徒
必须归从国教，否则立即驱逐出境。国王的作风使所有不从国教者都不舒服，因此，斯洛克比公理派信徒被迫于公元1609年逃往荷兰的莱登。
这些英国人在荷兰并不快乐，首先他们发现，要在一个陌生的国家谋生活不容易，后来令他们更不悦的是，看到自己的孩子去荷兰学到许多坏榜样；因此，他们决定到美洲新大陆去建立新的家园。他们从英国的普里茅斯(plymouth)驾五月花号(Mayflower)启程，于公元1620年十一月十一日抵达美洲的鳕鱼角(CapeCod)，他们把上岸的地方命名为普里茅斯以纪念他们在英国家乡。在美国史上，这批人被称为「天路客」(Pilgrims)。
这些在普里茅斯殖民的人大多是贫穷卑贱的人，他们在英国被看为「激进份子」，因为他们坚持公理派的教会行政观念而脱离英国国家教会；换言之，他们就是当时的「分离派」，大部份清教徒都愿意留在国家教会中，而视这批「分离派」为「自以为义的滋事份子」。事实上，分离派信徒在当时是被所有英国人所讨厌的。普里茅斯殖民地一直都很小。
英国清教徒前往美洲的大移民开始于公元1628年，他们在撒冷(Salem)建立麻萨诸塞湾殖民地(MassachusettsBayColony)；这个殖民地一开始就非常兴盛，到公元1640年时，已经有二十万人在撒冷地区找到安居之所；这批殖民者，大部份是有钱、有地位、有才干的人。
这批清教徒本无脱离英国教会之意。一位名叫黑金山(Higginson)的牧师，前往麻萨诸塞湾时，站在甲板上，看见英国渐渐消失，他说：「我们不像分离派在离开英国时说：「再见了，巴比伦！再见了，罗马！」我们愿说：「再见了，亲爱的英国！再见了，神在英国的教会！再见了，所有基督徒朋友们！我们不是以分离派身份脱离教会，前往新英格兰，然而，我们不得不脱离教会的腐败！」清教徒领袖们仍然以英国教会为荣，为他们「亲爱的母亲」。
我们会以为，这个兴盛的麻萨诸塞湾殖民地既具备财力与人力，必然会在新英格兰的教会生活和行政上起带头作用。没有想到，却是那些在普里茅斯又小、又穷、又被厌弃的激进份子为整个新英格兰区清教徒奠立了教会生活与行政的模范。许多在撒冷的清教徒后来也与他们「亲爱的母亲」断绝关系，采用了公理派教会行政制度。十年之间，在麻萨诸塞州成立了三十三间教会，除了一两位牧师倾向长老派制度外，他们都采用公理派制度。
公元1636年，他们在麻萨诸塞州的剑桥镇(Cam-bridge)设立了第一间基督教学院；为了纪念奉献大批捐款的哈佛牧师(JohnHarvard)，而定名为哈佛学院，就是今天的哈佛大学。
公元1701年，另外一个学院在康涅狄克州(Connectcut)设立。校址起先在塞布鲁克(Saybrook)，于公元1716年搬到新港(NewHaven)；两年后，为纪念慷慨资助的耶鲁以列(ElihuYale)而定名为耶鲁大学，也因为如此，到今天仍有人称耶鲁大学为「老以列」(OldEli)。
二千年教会史
