孔祥熙和当年在蒋、宋、孔、陈四大家族中的陈氏兄弟原来的关系一直不错，特别是陈氏兄弟当初羽翼未丰之时，便极力和孔祥熙搞好关系。但随着抗战后期孔祥熙的权力极度膨胀，作风也日益霸道起来，便和陈氏兄弟发生了摩擦。此后愈演愈烈，终于反目为仇。在1944年前后的倒孔运动中，陈氏兄弟也起了重要作用。
早在1932年蒋介石和宋子文的“耳光风波”之前，蒋介石因宋子文对“剿共”的消极态度便准备撤换他这个财政部长兼行政院副院长。消息传出后，国民党内的政学派积极活动，想谋求这个位置。因政学派和汪精卫关系密切，蒋介石虽然一直想把汪精卫置于自己之下，但有时为了长远利益也不得不做一些妥协。为此蒋介石初步决定让政学派的张群接替宋子文的位置。
而陈氏兄弟当时正要发展自己的势力，政学派却是他们的主要障碍。陈果夫找到陈立夫商量后，陈立夫立即起草了一封秘信，派人送到宋霭龄家中。宋霭龄接到陈立夫的信后大吃一惊。宋霭龄是极不愿意让财政部大权落入张群之手的。她觉得那对宋家是个威胁，这点她和陈氏兄弟观点一致。所以立即驱车从上海赶到南京，直奔蒋介石的官邸。经过宋霭龄三寸不烂之舌的一番权衡利弊，蒋介石答应给孔祥熙一个机会。
其实蒋介石想让张群当财政部长实属迫不得已。宋子文有才，和美国人、英国人关系也深，可太孤傲，好像从来都不把他蒋介石放在眼里。蒋介石也想到过孔祥熙，但有所顾虑，经过宋霭龄的一番劝说，蒋介石终于下了决心。孔祥熙来到南京后，他的谦逊、他的中庸、他的忠顺和他对财政部工作的设想，都使蒋介石觉得把财权交给他比交给张群要合适得多。于是，孔祥熙在仕途的道路上完成了一次最重要的飞跃，这一年孔祥熙52岁。而帮他完成这次飞跃的关键人物是夫人宋霭龄和陈氏兄弟。
※ 张群，蒋介石的幕僚之一。在宋霭龄的一番说辞下，张群就与行政院副院长擦肩而过了。前排右一为张群。
孔祥熙当了财政部长后不久，又担任了行政院副院长，以后便官运亨通。特别是在抗日战争期间，汪精卫投降日寇做了汉奸，蒋介石在政治上最主要的对手都销声匿迹了，国民党内形成了以蒋介石为首的包括孔祥熙、宋子文、陈氏兄弟等几大势力集团。其中又以孔家最为得宠，因此势力也最大。在蒋介石的有心撺弄下，孔氏家族和宋子文、陈氏兄弟的矛盾也日渐显露，日渐激化。
※ “蒋家天下陈家党”的陈氏兄弟，在国民党内亦是呼风唤雨。陈果夫（中），陈立夫（右）。
孔祥熙与陈氏兄弟的矛盾与宋子文不同，与宋子文是表面上都相互尊重，骨子里相互提防，谁也不想得罪谁，谁也不想撕破脸。对陈氏兄弟就不同了，孔祥熙、宋霭龄对待陈氏兄弟无论在表面上还是骨子里都有深深的瞧不起。就说孔令俊的婚事。孔祥熙和宋霭龄有意让孔令俊嫁给胡宗南，是想在军界找一个靠山，找一门亲戚，以扩大自己的势力和影响。但他们和胡宗南不熟，是陈立夫帮着牵的线。后来好事未成，他们也不和陈立夫打个招呼。陈立夫还是从别人那里知道孔令俊去西安的结果，心里好大的不满。好事虽未成，然周折颇费，成与不成间，招呼总得有一个吧，这是人之常情。由此，陈氏兄弟对孔家就衍生出一股说不出的怨恨来。
对孔家假公济私、贪污受贿、巧取豪夺和中饱私囊的劣迹，陈果夫通过自己的耳目也早有所闻。抗战以来，陈氏兄弟对孔祥熙的本来面目有了越来越清楚的认识。抗战爆发后，陈氏兄弟的势力急剧膨胀，并把持和控制了国民党中高级干部的晋升大权。
1941年6月，宋霭龄遵照医生的建议，离开中国前往巴西，同行的还有孔令杰及宋美龄。宋霭龄的出走，直接影响到了孔祥熙。此时，美国总统罗斯福也向蒋介石建议，要求更换军政部长何应钦和财政部长孔祥熙。于是，蒋介石下了决心，要免去孔祥熙的职务。兵败如山倒，破鼓乱人捶。孔祥熙的失势使多年来的积怨像火山爆发一样喷射出来，陈氏兄弟也是在这时跳出来参加到倒孔的行列中。此后孔家在政坛日渐衰落，陈氏兄弟则日益兴旺发达。但也好景不长，陈氏家族只在极度膨胀了两三年后，也被蒋介石罢黜。
※ 如果当年孔家大小姐没有嫁给穷小子陈纪恩，而选择了胡宗南，那么历史又会是什么样呢？中为胡宗南。
孔祥熙在抗战时期集数权于一身，成为国民党金融财政的化身。又靠着蒋介石的庇护，得意于一时，致使当时众多的阿谀奉承、溜须拍马之徒也纷至沓来。但中国的知识分子，历来就有不畏权势的。“春风得意”的孔祥熙不仅受到了党派争斗之煎熬，而且也遭受到刚直不阿的知识分子的公开批评和抨击。其中最著名的一次，就是当时中国著名的经济学家马寅初先生在一次会议上对孔祥熙的当面痛斥。对孔祥熙制定出台的一系列有损国家利益和主权的法案、政策，马寅初先生当时特别痛恨并一再仗义执言，即使是在有孔祥熙和宋子文等人亲自出席的会议上，他也毫不留情。孔祥熙曾对他的秘书说，他还从来没见过像马寅初这样敢于在大会上公开顶撞他的学者。
1939年春，马寅初到重庆任重庆大学商学院院长。当时国民党政府政治腐败，军事上节节败退，经济上一片混乱。而孔祥熙、宋子文等豪门却利用手中权力，巧取豪夺囤积居奇，大发国难财。当时，物价开始大幅度上扬，法币逐渐贬值，市场上出现了黄金、白银和美钞黑市。而在此时，孔祥熙突然命令财政部宣布将法币对美元的比价降低一倍，这等于无形中承认法币贬值一倍。一时间人心动荡，物价如脱缰的野马直线上升，市场一片混乱。对此孔祥熙不但不想办法，反而事前利用职权购换大量美元和黄金。一时间上行下效，财政部和“中央银行”的官员们也借了大量法币抢购黄金和美元，法币一宣布贬值，他们即可用一半美金偿还借款，自己净得一半。
马寅初目睹这一切，不禁痛心疾首。当即便借召开1939年中国经济学社年会的机会，邀请孔祥熙参加，准备和孔祥熙好好理论理论。孔祥熙平日里作威作福，根本没想到马寅初会拿他是问。会议开始后，马寅初首先发言。在介绍了各位来宾后，他说：“今天我们很荣幸，请到了我们的社员、现任财政部长孔祥熙先生在百忙之中到会。孔先生是财政专家，又是现任主管全国财政命脉的最高行政长官，我想还是先请他来对当前国家财经情况作指示。”
孔祥熙经常出席各种会议，每次发言都要预先准备。这次出于情面原想应付一下，想听听别人的意见再考虑是否发言，根本没想到马寅初会将他一军。但这时大家已鼓起掌来，他只得硬着头皮走上台去，装模作样地讲了几句。
※ 马寅初不畏权势，仗义执言，令孔祥熙亦无奈。
孔祥熙讲完后，马寅初走向讲台说：“刚才部长先生讲了一通形势，我想请问一句，在法币已经贬值、物价不断上涨的情况下，财政部不但不设法出面干预，防止因通货膨胀给人民生活带来的影响，反而突然宣布大幅度降低法币对美元的比价，无形中对物价上涨起到了推波助澜的作用。对那些大倒小倒，利用手中职权，在市场上抢购美钞、黄金，在黑市上转手倒卖，大发横财，坑了国家和百姓的。对此不知部长先生有何感想？”听到马寅初这番入木三分的言词，孔祥熙顿时面红耳赤。但当着众人的面又不好发作，只好在那里干瞪眼。马寅初如入无人之境似的继续讲道：“我们中国经济学社的基金和我个人微薄的储蓄，都存在国家银行分文未动，就是将来在法币继续贬值下不值一文，如果国家需要，我们也绝不会去提那些存款……”
当时不少到会的社员见马寅初敢当着孔祥熙的面去揭那些丑陋的伤疤，不禁为他捏了一把汗。同时又为马寅初不畏权势，敢于讲出大家想讲又不敢讲的话而感到由衷的敬佩。于是会场上顿时响起经久不息的掌声。
这时孔祥熙在主席台上已如坐针毡，大汗淋漓了。赶巧这时有人提议休息10分钟，总算为孔祥熙解了围。孔祥熙趁机溜之大吉，但从此对马寅初恨之入骨。第二年，马寅初又牵头组织召开了1940年中国经济学社年会，大后方地区的社员都应邀出席了年会。孔祥熙虽接到了邀请，但回想起头一年被马寅初当场质问的情景，便以公务繁忙为由推辞了，只派了他的几个助手代他前往。
※ 孔祥熙数权集于一身，自是春风得意。
马寅初先生对他颜面的损伤，孔祥熙记恨在心，他和蒋介石密谋，怎样处掉这个异己？在抗战后期，马寅初先生一直都在躲着国民党的秘密的逮捕和迫害。
