1950年7月26日，蒋介石宣布酝酿已久的中国国民党改造案，开始了旨在重新分配上层统治权力，重建国民党组织的“改造运动”。
蒋介石心里明白，要确保蒋经国在权力再分配中得到好处，就必须排除具有实力而又是争权老手的CC系。同时，美国对CC系的反感和陈诚与CC系的争权夺利，促使蒋介石最后下定了整肃CC系的决心。还有，由于长期以来，从国民党中央党部到各级地方党部，都为CC系所控制，不清除CC系，“改造运动”都无从开始，所以，将CC系挤出党务系统，是蒋介石进行“改造运动”的首要前提和初步目的。
蒋介石知道，踢开二陈及CC系也不是轻而易举的事。一来CC系根深蒂固，兵强马壮，在国民党内部很有基础；二来自己与二陈毕竟打交道多年，交情还是有的，要把他们踢开，也要找个借口，或者寻个机会，或顺理成章，或逼他们就范。但蒋介石毕竟是蒋介石，耍手腕是他的老把戏。
从1950年6月起，凡是“中央党部”呈递蒋介石的文件，他一律不阅退还。“国民党中央常委”几次开会，蒋介石概不参加。CC分子当然明白蒋介石的意思，6月22日，CC系大将、国民党“中常委”萧挣提出全体“中常委”应主动辞职，以便让总裁实施“改造”。这正中蒋介石下怀，于是行动开始了。
此时，陈果夫的身体一天不如一天，他虽然不再过问政治，但每天都在关心“改造”的消息。但是，传来的都是让他十分痛心的消息。
7月，蒋介石下令免去陈果夫“中央财政委员会”主任的职务，裁撤由陈果夫任董事长的“中央合作金库”、“中央农民银行”，一举削去了CC派的经济支柱。同时，在召集全体国民党“中常委”谈话时，点名批评了陈立夫。
7月26日，蒋介石发表演讲，提出成立“中央改造委员会”，负责重新组织国民党，使过去庞大的组织由大改小，撤销国民党“中央执行委员会和监察委员会”，改以“中央评议会”代替，并宣布了酝酿已久的“国民党改造方案”和新的“中央改造委员会、中央评议委员会”名单。除谷正纲和张道藩外，包括陈立夫在内的相当一批CC系要员都没有入选，陈果夫只挂名为安慰性的“中央评议委员”，此时，他已是疾病缠身的垂危之人。
※ 陈果夫已缠绵病榻，而陈立夫也已对蒋失去了信心，准备远走他乡来结束他的政治生涯。从之后的形势发展来看，陈立夫淡泊名利，弃政从商不失是明智之举。
8月初，蒋介石又下令改组由陈果夫任董事长的农业教育电影公司，让蒋经国接办，这就又削掉了CC系掌握的一大舆论阵地。
这次“改造运动”，一直持续到1952年10月，历时两年多。蒋介石认为“改造”取得了辉煌成果，那就是解除了以二陈为代表的CC系的党政大权，而代之以较为年轻一辈的心腹嫡系，加强了对国民党的控制。
至此，“蒋家天下陈家党”的历史彻底结束了，二陈在国民党中的政治生命画了一个句号，二陈所领导的CC系成了一个历史名词。
※ 当时共我赏花人，点检如今无一半。回首曾经的荣辱，陈果夫多的是对流逝的岁月的感慨。
凄凉逝去
躺在病床上的陈果夫，得知“中央改造”的结果以后，病情骤然加重。他经受不住这种沉重的打击，真想大喊大叫一场，发泄心中的痛苦郁闷，但医生却嘱咐他千万不要说话。无奈之际，陈果夫便作了一首《哑巴歌》：
听得人家好说话，肚里更加不开心；
若闻笑骂声，面孔涨得红又青；
摩拳擦掌，胆小不敢争。
有时候像吃过黄连嘴里苦，
有时候像受了冤屈没处伸。
哑巴哥，不能说话苦得很。
之后，陈果夫又在表面上装出若无其事的样子，给自己写下一副对联：
合法、合情、合理，做成大事；
轻权、轻利、轻中，修得长生。
从这副对联中可以看出，不管是出于真情也好，还是出于无奈也罢，陈果夫开始淡泊权势与名利了。
弟弟陈立夫去美国前，和夫人孙禄卿专门前去看望了陈果夫。陈果夫一见和自己在国民党政坛风雨同舟20多年的亲兄弟，满肚子的埋怨都倾诉出来。
陈果夫说：“我们跟着蒋家反共，20多年来，几乎把命都搭上了，结果，总裁竟把大陆失败的责任推到我们身上，现在又为了传位给儿子，将我们一脚踢开，唉！”
这时，陈立夫看到了陈果夫写的《哑巴歌》，细细读了几遍，禁不住内心一阵凄凉与愤懑，之后，便劝陈果夫：“果夫兄，你现在身体成了这个样子，还能做些什么，人家不用你，也是因为你的身体不佳，这有什么想不开的？”
陈果夫接过来说：“那么你呢？你年富力强，正是干事业出政绩的年龄，怎么也不给一职一权？”
此时的陈立夫在夫人的劝慰下，已经彻底淡泊名利了，他对哥哥说：“我现在什么都不想了，在政坛上混够了，什么都看清楚了。我打算离开台北，到国外去过平静的日子。今天我是来向你辞行的。”
陈果夫原以为弟弟能有办法东山再起，没想到突然说出这番话来，一时感到很突然，沉默了很久，问：“到国外去？小弟打算去哪个国家？”
陈立夫说：“我准备去美国。”
陈果夫问：“总裁批准了吗？”
陈立夫说：“已批准了。”
陈果夫叹了一口气，说：“看来台湾不是我们待的地方啊！也许总裁早就想让我们走了！”过了一会儿，他又问：“小弟到美国人生地不熟，怎么生活啊！”
陈立夫说：“我们自食其力，自己动手，还能生存不下去？”
陈果夫听罢，禁不住潸然泪下。
陈立夫也伤心地掉下了眼泪。同胞兄弟，情深意笃，此次别离也可能即是诀别。特别是弟弟陈立夫，他始终忘不了年幼时果夫对自己的关怀和照顾，四处奔波为自己跑学费，送自己赴美留学；忘不了留学期间，果夫对自己的谆谆教诲和殷切期望；忘不了自己留学归来，果夫积极向蒋介石推荐，使他顺利地走向政坛；忘不了兄弟二人在政治的风风雨雨中同心同德、你拉我扶……
两兄弟抱在一起痛哭起来……
陈立夫说走就走了，此时的陈果夫更是孤立无援，内心苍凉。为了在自己有限的生命中能给后人留下些什么，陈果夫打算写一部回忆录。他想借出书向蒋介石表白，他陈果夫一生是忠于蒋介石，忠于国民党的，希望蒋介石能以恻隐之心，对陈氏家族另眼看待。同时，他也希望这部回忆录，既是对自己“革命生涯”辉煌历史的总结，也是对国民党在大陆20多年沧桑经历的概括，能够成为一部教育后人的教科书。
陈果夫把回忆录按水利、合作、广播、电影、金融、礼俗、医药、卫生、道德、建筑、经济、计划、教育、人事、组织、政治、制度、世界大同、CC来源、党务、豪门等列出了条目，然后就开始写了起来。无奈此时的他力不从心，手总是抖个不停，想表达的话总落不在纸上，一天也写不了几张纸。
1950年9月3日，张静江在纽约病故。消息传到台湾，病重的陈果夫有一种说不出的伤感，他想起当年在上海交易所时与张静江密切交往，“大革命”时期又来往甚密，如今竟先他而去了。这时候噩耗不断传来，陈果夫的故友赵棣华、张简齐、俞松筠相继离世，这让他沉浸在无比的悲痛之中。他想，下一个该轮到自己了。
※ 妇以夫贵荣，夫已失势，依旧紧相随，言多安慰语。图为陈果夫夫人朱明。
※ 念往昔，繁华竞逐，叹门外楼头，悲恨相续。图为陈立夫、陈其采、陈果夫。
于是，陈果夫夜以继日地写作，无论医生怎么相劝，他也不听，甚至有时跟医生发脾气，说自己已经是要死的人了，不用再治了。1950年底，陈果夫终于完成了回忆录之一《苏政回忆》，觉得轻松了许多。
除夕之夜，爆竹声声，万家灯火，陈果夫却独坐床头，静思默想，许多往事一齐涌上心头，真是往事不堪回首。他想起自己的童年，想起从政几十年的坎坎坷坷，想起自己的恋爱、婚姻与家庭，想起与立夫的手足之情和患难与共。
多少年来，陈果夫早已养成了岁末回顾一年工作的习惯。1950年对于他来说是最不平常的一年，也是最痛苦的一年，该总结的东西太多了。他不知道该从哪里写起，就给自己做了一个大致的总结：
一、住繁华都市多年，从未入妓院、舞场、赌场之类。
二、管钱始终不将钱作为私有，或为金钱所管。
三、读书未尝为书本所困，或自以为知足。
四、管人事不作弄人，不私于人，更不自用私人。
五、做官未尝作福、作威、营私或运用政客，作因位之想，及悻进之图，我始终保持平民本色，接近商业工作，自己做到不做生意，不与人谈私利。
六、办党务工作植党之想，办教育亦然。
七、生病能摆脱烦恼，始终抱乐观与进取之心。
1951年1月15日，陈果夫从台中迁至台北市，以改善治疗条件。此时的他似乎比原来好了很多。在病榻之上，他作了《老爷歌》与《太太歌》以资消遣。
《老爷歌》写道：
老爷老，脾气好。
日日夜夜困在病床上，
看书、会客、作文章，
脱衣着衣忙勿了。
有时眯眯笑，
有时嘴巴翘。
按铃叫我来做事，
还有给我吃糖了。
讲起故事来，
三天三夜讲勿了。
《太太歌》写道：
太太，太太，
难嬉闹喧，
性子急，脾气大，
吃饭吃得快，肚子常常要吃坏，
发起火来我顶怕，
高兴起来给我买个洋娃娃。
1951年4月，陈果夫的《苏政回忆》出版。在自序中他写道：“我写这本小册子的动机，一则个人从政的经验，也许有可供今后从政同志参考之处；二则以后我和同志见面时，省得再讲，没有见面的同志，一编在手，亦如和我谈话，尤其从前允许向中央政校同学讲话，正可以此代替，惟延持10年，殊为遗憾。不幸此10年中间，中国政治进步甚少，此册虽陈旧事迹，或仍可供参考之用……”《苏政回忆》的出版，确实给陈果夫带来了许多安慰。
※ 人老病残，却更兼风雨，陈果夫逝世后，蒋介石的“褒扬令”倒给了凄凉的陈家一丝慰藉。似乎终究陈果夫还是国民党的功臣，而蒋介石对其似也念念不忘。
陈果夫的病情越来越严重了，他知道自己剩下的时间越来越少了。临死之前，他将自己对政治、对社会、对人生的各种意见集中起来，写了下来，名为《铮谏之文》，派人呈交蒋介石，以表明他对国民党和蒋介石的忠心。
“鸟之将亡，其鸣也哀；人之将死，其言也善。”病入膏肓的陈果夫不顾死神一天天靠近，不遗余力地倾吐着他对国民党对蒋介石的“善言”。
1951年8月25日上午，陈果夫病势急转直下，体温骤然增高，口中发出呓语，好像要说什么，但什么也说不出来。到下午2时后，便进入昏迷状态，体温高达摄氏40多度。他面色蜡黄，呼吸微弱，口吐白沫，手向空中乱抓。
夫人朱明抓住他的手，轻声问他：“果夫，你想说什么就说吧，我在这听着呢。”
陈果夫喘着粗气，死死地抓住朱明的手。朱明把脸贴近陈果夫的脸，再一次问他：“果夫，你有什么话要说吗？你的儿女们都在跟前听着呢！”
然而陈果夫抓住朱明的手，嘴张了几次，没说出一个字，又陷入昏迷状态。
下午4时52分，陈果夫带着一生对国民党和蒋介石的功与过、荣与辱、忠与怨离开了人世，享年59岁。
陈果夫没有遗嘱，而有遗言——《铮谏之文》；没有遗产，而有遗著——《老病人谈中西医》。一生风雨坎坷，是非功过，只有后人去评说了。
陈果夫死后，蒋介石对其厚葬。9月15日，蒋介石特颁“褒扬令”：“前国民政府委员、监察院副院长陈果夫，资性弘毅，志行纯笃，缵承革命家风，效忠三民主义，越四十年如一日。溯自民前加盟，先后参与武昌起义暨讨袁、北伐、抗战、戡乱诸役，赞襄缔创，卓著勖勤，中经办黄埔军校，主治淮河水利，敬恭将事，均彰懋绩。嗣更外膺疆寄，内佐栓衡，肃政培才，弥宏实效。对于‘共匪’倡乱，尤能烛识机先，悉力防杜，冒险犯难，弗渝初志。至其匡维礼俗，研考卫生，改革地政，倡导合作，盖画良漠，有稗‘建国’，乃以优劳，触发旧迹，黄志澄逝，追怀政迹，转怀弥深！应予明令褒扬，从优议邮。生平事迹，存备宣付史馆，用彰政府驾念动庸之至意此令！”
陈果夫生前受到蒋介石的冷落，死后却备享殊荣，对陈氏家族的死者和生者都是莫大的安慰。
